MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. Ty21a

Total Repeats: 100791

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_021176	GAA	2	6	630518	630523	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488653103
13502	NC_021176	A	6	6	630527	630532	100 %	0 %	0 %	0 %	488653103
13503	NC_021176	GCA	2	6	630652	630657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488653103
13504	NC_021176	GTC	2	6	630668	630673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488653103
13505	NC_021176	GGCA	2	8	630714	630721	25 %	0 %	50 %	25 %	488653103
13506	NC_021176	GTC	2	6	630765	630770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488653103
13507	NC_021176	CGG	2	6	630837	630842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488653103
13508	NC_021176	GTG	2	6	630856	630861	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488653103
13509	NC_021176	GGT	2	6	630901	630906	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488653103
13510	NC_021176	TGG	2	6	630999	631004	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488653103
13511	NC_021176	GCCG	2	8	631033	631040	0 %	0 %	50 %	50 %	488653103
13512	NC_021176	GCG	2	6	631097	631102	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488653103
13513	NC_021176	GC	3	6	631111	631116	0 %	0 %	50 %	50 %	488653103
13514	NC_021176	TCG	2	6	631140	631145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488653103
13515	NC_021176	TAC	2	6	631185	631190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488653103
13516	NC_021176	CAA	2	6	631225	631230	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	488653103
13517	NC_021176	CGG	2	6	631234	631239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488653103
13518	NC_021176	CTG	2	6	631253	631258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488653103
13519	NC_021176	CGC	2	6	631263	631268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488653103
13520	NC_021176	GCC	2	6	631325	631330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488653103
13521	NC_021176	ATC	2	6	631347	631352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488653103
13522	NC_021176	GAA	2	6	631367	631372	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488653103
13523	NC_021176	GCTG	2	8	631384	631391	0 %	25 %	50 %	25 %	488653103
13524	NC_021176	TGG	2	6	631428	631433	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488653103
13525	NC_021176	GC	3	6	631449	631454	0 %	0 %	50 %	50 %	488653103
13526	NC_021176	GCA	2	6	631462	631467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488653103
13527	NC_021176	ATG	2	6	631492	631497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488653103
13528	NC_021176	GCA	2	6	631506	631511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488653104
13529	NC_021176	CGG	2	6	631665	631670	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488653104
13530	NC_021176	TCA	2	6	631682	631687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488653104
13531	NC_021176	GC	3	6	631695	631700	0 %	0 %	50 %	50 %	488653104
13532	NC_021176	ACA	2	6	631715	631720	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	488653104
13533	NC_021176	TGGT	2	8	631732	631739	0 %	50 %	50 %	0 %	488653104
13534	NC_021176	GGC	2	6	631753	631758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488653104
13535	NC_021176	GAT	2	6	631767	631772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488653104
13536	NC_021176	TGG	2	6	631808	631813	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488653104
13537	NC_021176	GC	4	8	631849	631856	0 %	0 %	50 %	50 %	488653104
13538	NC_021176	CAG	2	6	631936	631941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488653104
13539	NC_021176	GCA	2	6	631965	631970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488653104
13540	NC_021176	AGGC	2	8	631972	631979	25 %	0 %	50 %	25 %	488653104
13541	NC_021176	GCTG	2	8	632016	632023	0 %	25 %	50 %	25 %	488653104
13542	NC_021176	TAT	2	6	632098	632103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	488653104
13543	NC_021176	GGC	2	6	632151	632156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488653104
13544	NC_021176	AC	3	6	632258	632263	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13545	NC_021176	TGA	2	6	632276	632281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488653105
13546	NC_021176	GAT	2	6	632429	632434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488653105
13547	NC_021176	ACG	2	6	632458	632463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488653105
13548	NC_021176	ATT	2	6	632478	632483	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	488653105
13549	NC_021176	GCGG	2	8	632514	632521	0 %	0 %	75 %	25 %	488653105
13550	NC_021176	GCG	2	6	632536	632541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488653105
13551	NC_021176	CGG	2	6	632546	632551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488653105
13552	NC_021176	CGG	2	6	632657	632662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488653105
13553	NC_021176	TGC	2	6	632671	632676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488653105
13554	NC_021176	ATG	2	6	632679	632684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488653105
13555	NC_021176	CGG	2	6	632753	632758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488653105
13556	NC_021176	AGA	2	6	632794	632799	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488653105
13557	NC_021176	GCC	2	6	632824	632829	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488653105
13558	NC_021176	CGT	2	6	632873	632878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488653105
13559	NC_021176	GCG	2	6	632964	632969	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488653105
13560	NC_021176	GAA	2	6	633045	633050	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488653105
13561	NC_021176	GC	3	6	633129	633134	0 %	0 %	50 %	50 %	488653106
13562	NC_021176	GGT	2	6	633169	633174	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488653106
13563	NC_021176	GA	3	6	633249	633254	50 %	0 %	50 %	0 %	488653106
13564	NC_021176	TCAG	2	8	633273	633280	25 %	25 %	25 %	25 %	488653106
13565	NC_021176	GC	3	6	633387	633392	0 %	0 %	50 %	50 %	488653106
13566	NC_021176	ACTG	2	8	633400	633407	25 %	25 %	25 %	25 %	488653106
13567	NC_021176	GGC	2	6	633421	633426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488653106
13568	NC_021176	CGCGC	2	10	633434	633443	0 %	0 %	40 %	60 %	488653106
13569	NC_021176	TGG	2	6	633552	633557	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488653106
13570	NC_021176	TGC	2	6	633564	633569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488653106
13571	NC_021176	ATCTGC	2	12	633585	633596	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	488653106
13572	NC_021176	CGC	2	6	633621	633626	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488653106
13573	NC_021176	GAA	2	6	633689	633694	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488653106
13574	NC_021176	GAT	2	6	633710	633715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488653106
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13576	NC_021176	CGG	2	6	633894	633899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488653106
13577	NC_021176	TCA	2	6	633900	633905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488653106
13578	NC_021176	TCGA	2	8	633911	633918	25 %	25 %	25 %	25 %	488653106
13579	NC_021176	GCC	2	6	633953	633958	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488653106
13580	NC_021176	CCTGG	2	10	634026	634035	0 %	20 %	40 %	40 %	488653106
13581	NC_021176	TGA	2	6	634060	634065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488653106
13582	NC_021176	GC	3	6	634170	634175	0 %	0 %	50 %	50 %	488653107
13583	NC_021176	GGCG	2	8	634200	634207	0 %	0 %	75 %	25 %	488653107
13584	NC_021176	CTG	2	6	634246	634251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488653107
13585	NC_021176	GCG	2	6	634304	634309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488653107
13586	NC_021176	CG	3	6	634308	634313	0 %	0 %	50 %	50 %	488653107
13587	NC_021176	GC	3	6	634565	634570	0 %	0 %	50 %	50 %	488653107
13588	NC_021176	GCT	2	6	634614	634619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488653107
13589	NC_021176	TAT	2	6	634653	634658	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	488653107
13590	NC_021176	GC	3	6	634681	634686	0 %	0 %	50 %	50 %	488653107
13591	NC_021176	GGC	2	6	634766	634771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488653107
13592	NC_021176	GCG	2	6	634786	634791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488653107
13593	NC_021176	CGG	2	6	634815	634820	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488653107
13594	NC_021176	GCT	2	6	634871	634876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488653107
13595	NC_021176	GAT	2	6	634939	634944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488653107
13596	NC_021176	GC	3	6	634949	634954	0 %	0 %	50 %	50 %	488653107
13597	NC_021176	AG	3	6	634966	634971	50 %	0 %	50 %	0 %	488653107
13598	NC_021176	TCG	2	6	634979	634984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488653107
13599	NC_021176	GC	3	6	635001	635006	0 %	0 %	50 %	50 %	488653107
13600	NC_021176	CG	3	6	635081	635086	0 %	0 %	50 %	50 %	488653107
13601	NC_021176	GGC	2	6	635126	635131	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488653107
13602	NC_021176	GCG	3	9	635150	635158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488653107
13603	NC_021176	GGA	2	6	635172	635177	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	488653107
13604	NC_021176	TTA	2	6	635189	635194	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	488653107
13605	NC_021176	CAA	2	6	635212	635217	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	488653107
13606	NC_021176	AGA	2	6	635235	635240	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488653107
13607	NC_021176	CAG	2	6	635416	635421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488653107
13608	NC_021176	GT	3	6	635425	635430	0 %	50 %	50 %	0 %	488653107
13609	NC_021176	TGGT	2	8	635552	635559	0 %	50 %	50 %	0 %	488653108
13610	NC_021176	GCG	2	6	635616	635621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488653108
13611	NC_021176	GTATT	2	10	635704	635713	20 %	60 %	20 %	0 %	488653108
13612	NC_021176	CGA	2	6	635767	635772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488653108
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13617	NC_021176	GAGG	2	8	636131	636138	25 %	0 %	75 %	0 %	488653109
13618	NC_021176	TAAT	2	8	636210	636217	50 %	50 %	0 %	0 %	488653110
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13741	NC_021176	CGCT	2	8	642099	642106	0 %	25 %	25 %	50 %	488653115
13742	NC_021176	ATA	2	6	642152	642157	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	488653115
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13851	NC_021176	CTG	2	6	647329	647334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488653120
13852	NC_021176	GCCG	2	8	647343	647350	0 %	0 %	50 %	50 %	488653120
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13863	NC_021176	GGC	2	6	647765	647770	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488653121
13864	NC_021176	GGA	2	6	647789	647794	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	488653121
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13874	NC_021176	CTG	2	6	648361	648366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488653121
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13883	NC_021176	TGG	2	6	648657	648662	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488653121
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13892	NC_021176	CTG	2	6	649173	649178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488653122
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13943	NC_021176	AT	3	6	651778	651783	50 %	50 %	0 %	0 %	488653125
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13951	NC_021176	T	7	7	652120	652126	0 %	100 %	0 %	0 %	488653125
13952	NC_021176	ACA	2	6	652270	652275	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	488653125
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13955	NC_021176	ATT	2	6	652417	652422	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13956	NC_021176	ATT	2	6	652432	652437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13957	NC_021176	AT	3	6	652449	652454	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13958	NC_021176	TAT	3	9	652478	652486	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13959	NC_021176	ATT	3	9	652501	652509	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13960	NC_021176	AGG	2	6	652538	652543	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13961	NC_021176	CGT	2	6	652588	652593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13962	NC_021176	AAT	2	6	652679	652684	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13963	NC_021176	GAGTA	2	10	652751	652760	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
13964	NC_021176	GAC	2	6	652885	652890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488653126
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13968	NC_021176	T	6	6	653073	653078	0 %	100 %	0 %	0 %	488653126
13969	NC_021176	CGCAA	2	10	653237	653246	40 %	0 %	20 %	40 %	488653126
13970	NC_021176	CGC	2	6	653373	653378	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488653126
13971	NC_021176	CTG	2	6	653515	653520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488653126
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13974	NC_021176	GCG	2	6	653578	653583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488653126
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13978	NC_021176	GC	3	6	653747	653752	0 %	0 %	50 %	50 %	488653126
13979	NC_021176	GAT	2	6	653755	653760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488653126
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13981	NC_021176	GC	3	6	653841	653846	0 %	0 %	50 %	50 %	488653126
13982	NC_021176	TCCGG	2	10	653873	653882	0 %	20 %	40 %	40 %	488653126
13983	NC_021176	GGT	2	6	653932	653937	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488653126
13984	NC_021176	GT	3	6	653970	653975	0 %	50 %	50 %	0 %	488653126
13985	NC_021176	CGC	4	12	654044	654055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488653127
13986	NC_021176	AGGG	2	8	654130	654137	25 %	0 %	75 %	0 %	488653127
13987	NC_021176	ACG	2	6	654157	654162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488653127
13988	NC_021176	CTG	2	6	654168	654173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488653127
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13990	NC_021176	TGT	2	6	654196	654201	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	488653127
13991	NC_021176	CTA	2	6	654289	654294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488653127
13992	NC_021176	AAG	2	6	654295	654300	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488653127
13993	NC_021176	CTTCA	2	10	654399	654408	20 %	40 %	0 %	40 %	488653127
13994	NC_021176	GCC	2	6	654426	654431	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488653127
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13998	NC_021176	CGTT	2	8	654526	654533	0 %	50 %	25 %	25 %	488653127
13999	NC_021176	ATG	2	6	654580	654585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488653127
14000	NC_021176	CGT	2	6	654620	654625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488653127

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