MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. Ty21a

Total Repeats: 100791

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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12502	NC_021176	CGC	2	6	584748	584753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488653058
12503	NC_021176	TGG	3	9	584765	584773	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488653058
12504	NC_021176	GAA	2	6	584775	584780	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488653058
12505	NC_021176	CGTCG	2	10	584799	584808	0 %	20 %	40 %	40 %	488653058
12506	NC_021176	GAC	2	6	584841	584846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488653058
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12508	NC_021176	GCG	2	6	584953	584958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488653058
12509	NC_021176	CGG	2	6	585024	585029	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488653058
12510	NC_021176	CGG	2	6	585032	585037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488653058
12511	NC_021176	TTTGAT	2	12	585175	585186	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	488653058
12512	NC_021176	GCC	2	6	585308	585313	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12513	NC_021176	CTT	2	6	585349	585354	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12514	NC_021176	CAC	2	6	585359	585364	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12515	NC_021176	AC	3	6	585363	585368	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12516	NC_021176	ACAGG	2	10	585370	585379	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
12517	NC_021176	TGT	2	6	585385	585390	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	488653059
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12519	NC_021176	TCG	2	6	585478	585483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488653059
12520	NC_021176	ACC	2	6	585540	585545	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	488653059
12521	NC_021176	TGC	2	6	585577	585582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488653059
12522	NC_021176	GTG	2	6	585615	585620	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488653059
12523	NC_021176	AGAT	2	8	585643	585650	50 %	25 %	25 %	0 %	488653059
12524	NC_021176	TGG	2	6	585661	585666	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488653059
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12542	NC_021176	ATT	2	6	586514	586519	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	488653060
12543	NC_021176	TGCC	2	8	586545	586552	0 %	25 %	25 %	50 %	488653060
12544	NC_021176	TGC	2	6	586575	586580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488653060
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12552	NC_021176	CGG	2	6	586832	586837	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488653061
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12555	NC_021176	TTG	2	6	587052	587057	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	488653061
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12558	NC_021176	CG	4	8	587168	587175	0 %	0 %	50 %	50 %	488653061
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12561	NC_021176	TC	3	6	587243	587248	0 %	50 %	0 %	50 %	488653061
12562	NC_021176	CGG	2	6	587249	587254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488653061
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12564	NC_021176	GC	5	10	587277	587286	0 %	0 %	50 %	50 %	488653061
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12569	NC_021176	CGCC	2	8	587429	587436	0 %	0 %	25 %	75 %	488653061
12570	NC_021176	GAA	2	6	587478	587483	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488653061
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12572	NC_021176	CGG	2	6	587669	587674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488653062
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12582	NC_021176	GACA	2	8	588059	588066	50 %	0 %	25 %	25 %	488653062
12583	NC_021176	GCG	2	6	588110	588115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488653062
12584	NC_021176	GAC	2	6	588129	588134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488653062
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12588	NC_021176	CGCC	2	8	588302	588309	0 %	0 %	25 %	75 %	488653062
12589	NC_021176	TGA	2	6	588314	588319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488653062
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12591	NC_021176	CCG	2	6	588484	588489	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488653062
12592	NC_021176	GGA	2	6	588523	588528	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12593	NC_021176	CAT	2	6	588604	588609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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12599	NC_021176	GCGTT	2	10	588861	588870	0 %	40 %	40 %	20 %	488653063
12600	NC_021176	TGA	2	6	588928	588933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488653063
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12608	NC_021176	A	6	6	589147	589152	100 %	0 %	0 %	0 %	488653063
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12612	NC_021176	TG	4	8	589337	589344	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12613	NC_021176	TCA	2	6	589350	589355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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12616	NC_021176	TC	3	6	589463	589468	0 %	50 %	0 %	50 %	488653064
12617	NC_021176	CTGG	2	8	589562	589569	0 %	25 %	50 %	25 %	488653064
12618	NC_021176	TGAGC	2	10	589620	589629	20 %	20 %	40 %	20 %	488653064
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12746	NC_021176	GTC	2	6	595374	595379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488653072
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12853	NC_021176	CGC	2	6	600331	600336	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488653075
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12983	NC_021176	TTC	2	6	606000	606005	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488653081
12984	NC_021176	TCA	2	6	606022	606027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488653081
12985	NC_021176	T	6	6	606092	606097	0 %	100 %	0 %	0 %	488653081
12986	NC_021176	CAT	2	6	606179	606184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488653081
12987	NC_021176	GCC	2	6	606225	606230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488653081
12988	NC_021176	T	6	6	606241	606246	0 %	100 %	0 %	0 %	488653081
12989	NC_021176	CGC	2	6	606249	606254	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488653081
12990	NC_021176	GA	3	6	606355	606360	50 %	0 %	50 %	0 %	488653081
12991	NC_021176	A	6	6	606367	606372	100 %	0 %	0 %	0 %	488653081
12992	NC_021176	TGA	2	6	606435	606440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12993	NC_021176	ATT	2	6	606479	606484	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	488653082
12994	NC_021176	CGGCCA	2	12	606573	606584	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	488653082
12995	NC_021176	CAG	2	6	606606	606611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488653082
12996	NC_021176	TCT	2	6	606644	606649	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488653082
12997	NC_021176	GTC	2	6	606651	606656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488653082
12998	NC_021176	CGCGC	2	10	606702	606711	0 %	0 %	40 %	60 %	488653082
12999	NC_021176	GCC	2	6	606819	606824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488653082
13000	NC_021176	T	6	6	606918	606923	0 %	100 %	0 %	0 %	488653082

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