MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. Ty21a

Total Repeats: 100791

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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12002	NC_021176	ATG	2	6	560521	560526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488653034
12003	NC_021176	GTT	2	6	560568	560573	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	488653034
12004	NC_021176	GC	3	6	560598	560603	0 %	0 %	50 %	50 %	488653034
12005	NC_021176	GC	3	6	560605	560610	0 %	0 %	50 %	50 %	488653034
12006	NC_021176	TCG	2	6	560626	560631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488653034
12007	NC_021176	TGCA	2	8	560694	560701	25 %	25 %	25 %	25 %	488653034
12008	NC_021176	CT	3	6	560891	560896	0 %	50 %	0 %	50 %	488653034
12009	NC_021176	GGC	2	6	561033	561038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488653034
12010	NC_021176	GTA	2	6	561088	561093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12011	NC_021176	CAA	2	6	561095	561100	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12012	NC_021176	T	6	6	561126	561131	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12013	NC_021176	AAC	2	6	561141	561146	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12014	NC_021176	TA	3	6	561162	561167	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12015	NC_021176	TG	3	6	561211	561216	0 %	50 %	50 %	0 %	488653035
12016	NC_021176	TTTTTG	2	12	561242	561253	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	488653035
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12018	NC_021176	GCC	2	6	561340	561345	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488653035
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12022	NC_021176	GGA	2	6	561555	561560	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	488653035
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12041	NC_021176	GTT	2	6	562478	562483	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	488653037
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12043	NC_021176	CG	3	6	562577	562582	0 %	0 %	50 %	50 %	488653037
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12058	NC_021176	AGAA	2	8	563298	563305	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
12059	NC_021176	AGA	2	6	563324	563329	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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12062	NC_021176	TA	3	6	563449	563454	50 %	50 %	0 %	0 %	488653039
12063	NC_021176	GAG	2	6	563508	563513	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	488653039
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12065	NC_021176	CT	3	6	563533	563538	0 %	50 %	0 %	50 %	488653039
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12119	NC_021176	AT	3	6	566130	566135	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12123	NC_021176	GCC	2	6	566250	566255	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488653042
12124	NC_021176	GAA	2	6	566297	566302	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488653042
12125	NC_021176	TGAA	2	8	566346	566353	50 %	25 %	25 %	0 %	488653042
12126	NC_021176	GCT	2	6	566356	566361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488653042
12127	NC_021176	GGCA	2	8	566398	566405	25 %	0 %	50 %	25 %	488653042
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12132	NC_021176	CGC	2	6	566842	566847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488653042
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12135	NC_021176	GC	3	6	566990	566995	0 %	0 %	50 %	50 %	488653042
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12143	NC_021176	ACG	2	6	567270	567275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488653042
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12147	NC_021176	AAT	2	6	567361	567366	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12148	NC_021176	CGGT	2	8	567493	567500	0 %	25 %	50 %	25 %	488653043
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12156	NC_021176	A	6	6	567900	567905	100 %	0 %	0 %	0 %	488653043
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12200	NC_021176	TTC	2	6	569807	569812	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488653045
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12203	NC_021176	T	6	6	569963	569968	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12204	NC_021176	TAA	2	6	570050	570055	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12205	NC_021176	GCAAG	2	10	570131	570140	40 %	0 %	40 %	20 %	488653046
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12211	NC_021176	TGG	2	6	570410	570415	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488653046
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12218	NC_021176	AAG	2	6	570590	570595	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488653046
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12222	NC_021176	TGATA	2	10	570858	570867	40 %	40 %	20 %	0 %	488653046
12223	NC_021176	CCG	2	6	570870	570875	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488653046
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12226	NC_021176	AGGGC	2	10	571012	571021	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
12227	NC_021176	AGC	2	6	571057	571062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12228	NC_021176	CGTT	2	8	571215	571222	0 %	50 %	25 %	25 %	488653047
12229	NC_021176	CGG	2	6	571287	571292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488653047
12230	NC_021176	GCGCGT	2	12	571342	571353	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	488653047
12231	NC_021176	GCG	2	6	571409	571414	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488653047
12232	NC_021176	CG	3	6	571413	571418	0 %	0 %	50 %	50 %	488653047
12233	NC_021176	GTG	2	6	571493	571498	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488653047
12234	NC_021176	GGGC	2	8	571516	571523	0 %	0 %	75 %	25 %	488653047
12235	NC_021176	ACTG	2	8	571589	571596	25 %	25 %	25 %	25 %	488653047
12236	NC_021176	TCG	2	6	571665	571670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488653047
12237	NC_021176	GC	3	6	571719	571724	0 %	0 %	50 %	50 %	488653047
12238	NC_021176	TGC	2	6	571728	571733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488653047
12239	NC_021176	GCC	2	6	571841	571846	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488653047
12240	NC_021176	GC	3	6	571864	571869	0 %	0 %	50 %	50 %	488653047
12241	NC_021176	GTGA	2	8	571946	571953	25 %	25 %	50 %	0 %	488653047
12242	NC_021176	CGC	2	6	571956	571961	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488653047
12243	NC_021176	CGG	2	6	571995	572000	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488653047
12244	NC_021176	GTC	2	6	572013	572018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488653047
12245	NC_021176	TGC	2	6	572064	572069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488653047
12246	NC_021176	GAC	2	6	572117	572122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488653047
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12248	NC_021176	CGG	2	6	572160	572165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488653047
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12262	NC_021176	CCG	2	6	572836	572841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488653048
12263	NC_021176	TCG	2	6	572899	572904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488653048
12264	NC_021176	AAGAT	2	10	572920	572929	60 %	20 %	20 %	0 %	488653048
12265	NC_021176	GCG	2	6	572971	572976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488653048
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12267	NC_021176	CGC	2	6	573090	573095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12268	NC_021176	T	6	6	573197	573202	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12269	NC_021176	TTTA	2	8	573213	573220	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12270	NC_021176	GGAA	2	8	573227	573234	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12271	NC_021176	TTTTCT	2	12	573250	573261	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12272	NC_021176	GAC	2	6	573283	573288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12273	NC_021176	GATT	2	8	573321	573328	25 %	50 %	25 %	0 %	488653049
12274	NC_021176	CTTT	2	8	573422	573429	0 %	75 %	0 %	25 %	488653049
12275	NC_021176	ACT	2	6	573440	573445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488653049
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12282	NC_021176	TCA	3	9	573740	573748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488653049
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12309	NC_021176	CAC	2	6	575401	575406	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	488653051
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12339	NC_021176	T	7	7	576586	576592	0 %	100 %	0 %	0 %	488653051
12340	NC_021176	TTTC	2	8	576618	576625	0 %	75 %	0 %	25 %	488653051
12341	NC_021176	GTA	2	6	576706	576711	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488653051
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12345	NC_021176	TCG	2	6	576874	576879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12346	NC_021176	ATG	2	6	576882	576887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12347	NC_021176	ATT	2	6	576941	576946	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12348	NC_021176	A	6	6	576952	576957	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12349	NC_021176	TGAC	2	8	577031	577038	25 %	25 %	25 %	25 %	488653052
12350	NC_021176	GC	3	6	577150	577155	0 %	0 %	50 %	50 %	488653052
12351	NC_021176	ATT	2	6	577195	577200	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	488653052
12352	NC_021176	CAG	2	6	577219	577224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488653052
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12357	NC_021176	TC	3	6	577496	577501	0 %	50 %	0 %	50 %	488653052
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12361	NC_021176	TGG	2	6	577736	577741	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488653052
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12477	NC_021176	A	7	7	583370	583376	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12478	NC_021176	GTAT	2	8	583393	583400	25 %	50 %	25 %	0 %	488653057
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12490	NC_021176	GTC	2	6	583922	583927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488653057
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