MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. Ty21a

Total Repeats: 100791

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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10002	NC_021176	ACG	2	6	466971	466976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488652944
10003	NC_021176	GCCTG	2	10	467120	467129	0 %	20 %	40 %	40 %	488652944
10004	NC_021176	TCA	2	6	467156	467161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488652945
10005	NC_021176	CTG	2	6	467254	467259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652945
10006	NC_021176	GTC	2	6	467264	467269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652945
10007	NC_021176	GAT	2	6	467314	467319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488652945
10008	NC_021176	CAG	2	6	467326	467331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488652945
10009	NC_021176	CTG	2	6	467373	467378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652945
10010	NC_021176	GCC	2	6	467387	467392	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488652945
10011	NC_021176	GGT	2	6	467397	467402	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488652945
10012	NC_021176	CGG	2	6	467432	467437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488652945
10013	NC_021176	CGCGC	2	10	467476	467485	0 %	0 %	40 %	60 %	488652945
10014	NC_021176	GC	3	6	467586	467591	0 %	0 %	50 %	50 %	488652945
10015	NC_021176	GGC	2	6	467613	467618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488652945
10016	NC_021176	TCG	2	6	467627	467632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652945
10017	NC_021176	CCA	2	6	467664	467669	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	488652945
10018	NC_021176	GCCA	2	8	467710	467717	25 %	0 %	25 %	50 %	488652945
10019	NC_021176	GCG	2	6	467728	467733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488652945
10020	NC_021176	CTG	2	6	467743	467748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652945
10021	NC_021176	CGC	2	6	467778	467783	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488652945
10022	NC_021176	TTA	2	6	467792	467797	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	488652945
10023	NC_021176	TC	3	6	467847	467852	0 %	50 %	0 %	50 %	488652945
10024	NC_021176	TGA	3	9	467867	467875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488652945
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10028	NC_021176	GCG	2	6	468027	468032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488652946
10029	NC_021176	GATG	2	8	468122	468129	25 %	25 %	50 %	0 %	488652946
10030	NC_021176	CA	3	6	468148	468153	50 %	0 %	0 %	50 %	488652946
10031	NC_021176	A	6	6	468208	468213	100 %	0 %	0 %	0 %	488652946
10032	NC_021176	CGC	2	6	468214	468219	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488652946
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10035	NC_021176	GTC	2	6	468311	468316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652946
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10042	NC_021176	GCA	2	6	468593	468598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488652946
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10048	NC_021176	TGG	2	6	468889	468894	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488652946
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10052	NC_021176	GCG	2	6	469180	469185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10053	NC_021176	GAA	2	6	469243	469248	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10054	NC_021176	GCA	2	6	469273	469278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10055	NC_021176	GCG	2	6	469310	469315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10056	NC_021176	GC	3	6	469331	469336	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10057	NC_021176	GTC	2	6	469411	469416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652947
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10117	NC_021176	AC	3	6	471194	471199	50 %	0 %	0 %	50 %	488652949
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10224	NC_021176	CGGTGA	2	12	475839	475850	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	488652952
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10226	NC_021176	CAA	2	6	476064	476069	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	488652953
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10234	NC_021176	CAC	2	6	476568	476573	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	488652953
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10237	NC_021176	CGA	2	6	476679	476684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488652953
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10240	NC_021176	CTG	2	6	476970	476975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652953
10241	NC_021176	ACCA	2	8	476980	476987	50 %	0 %	0 %	50 %	488652953
10242	NC_021176	GCCGAC	2	12	476989	477000	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	488652953
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10246	NC_021176	CAT	2	6	477081	477086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488652953
10247	NC_021176	CCGT	2	8	477125	477132	0 %	25 %	25 %	50 %	488652953
10248	NC_021176	GCTG	2	8	477170	477177	0 %	25 %	50 %	25 %	488652953
10249	NC_021176	GTC	2	6	477203	477208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652953
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10272	NC_021176	TGA	2	6	478302	478307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488652955
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10325	NC_021176	GC	4	8	480584	480591	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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10330	NC_021176	TTCCTC	2	12	480712	480723	0 %	50 %	0 %	50 %	488652958
10331	NC_021176	TAGCT	2	10	480734	480743	20 %	40 %	20 %	20 %	488652958
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10343	NC_021176	TGAAG	2	10	481289	481298	40 %	20 %	40 %	0 %	488652958
10344	NC_021176	GGT	2	6	481310	481315	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488652958
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10352	NC_021176	TCA	2	6	481625	481630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488652958
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10354	NC_021176	AT	3	6	481784	481789	50 %	50 %	0 %	0 %	488652958
10355	NC_021176	GC	3	6	481810	481815	0 %	0 %	50 %	50 %	488652958
10356	NC_021176	TACTG	2	10	481949	481958	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
10357	NC_021176	GCGG	2	8	481979	481986	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
10358	NC_021176	AAAC	2	8	482067	482074	75 %	0 %	0 %	25 %	488652959
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10361	NC_021176	AT	3	6	482268	482273	50 %	50 %	0 %	0 %	488652959
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10481	NC_021176	GGC	2	6	487856	487861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488652966
10482	NC_021176	AGCGTA	2	12	487877	487888	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	488652966
10483	NC_021176	TGAT	2	8	487895	487902	25 %	50 %	25 %	0 %	488652966
10484	NC_021176	TCC	2	6	487910	487915	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10485	NC_021176	CGC	2	6	487919	487924	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10486	NC_021176	GGGA	2	8	487928	487935	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
10487	NC_021176	ATC	2	6	487963	487968	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10488	NC_021176	TA	3	6	487975	487980	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10489	NC_021176	ATG	2	6	488013	488018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10490	NC_021176	GCA	2	6	488094	488099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488652967
10491	NC_021176	GGCAG	2	10	488111	488120	20 %	0 %	60 %	20 %	488652967
10492	NC_021176	GCT	2	6	488135	488140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652967
10493	NC_021176	GCC	2	6	488175	488180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488652967
10494	NC_021176	CCG	2	6	488187	488192	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488652967
10495	NC_021176	CAA	2	6	488199	488204	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	488652967
10496	NC_021176	CGG	2	6	488219	488224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488652967
10497	NC_021176	TCA	2	6	488259	488264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488652967
10498	NC_021176	CGT	2	6	488303	488308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488652967
10499	NC_021176	TTC	2	6	488338	488343	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488652967
10500	NC_021176	AAC	2	6	488391	488396	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	488652967

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