MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. U288

Total Repeats: 102527

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021151	T	8	8	9	16	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021151	AAC	2	6	36	41	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_021151	CGG	2	6	60	65	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902550
4	NC_021151	ACCA	2	8	172	179	50 %	0 %	0 %	50 %	482902550
5	NC_021151	TGG	2	6	182	187	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482902550
6	NC_021151	A	6	6	197	202	100 %	0 %	0 %	0 %	482902550
7	NC_021151	CGG	2	6	207	212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902550
8	NC_021151	T	6	6	251	256	0 %	100 %	0 %	0 %	482902550
9	NC_021151	GC	3	6	281	286	0 %	0 %	50 %	50 %	482902550
10	NC_021151	CTG	2	6	370	375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902550
11	NC_021151	CGC	2	6	399	404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902550
12	NC_021151	A	6	6	422	427	100 %	0 %	0 %	0 %	482902550
13	NC_021151	GATC	2	8	483	490	25 %	25 %	25 %	25 %	482902550
14	NC_021151	CGC	2	6	564	569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902550
15	NC_021151	CCG	2	6	614	619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902550
16	NC_021151	TGG	2	6	638	643	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482902550
17	NC_021151	CCG	3	9	671	679	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902550
18	NC_021151	GCC	2	6	685	690	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902550
19	NC_021151	CTG	2	6	705	710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902550
20	NC_021151	GCT	2	6	774	779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902550
21	NC_021151	CT	3	6	811	816	0 %	50 %	0 %	50 %	482902550
22	NC_021151	CGA	2	6	939	944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902550
23	NC_021151	AAC	2	6	979	984	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482902550
24	NC_021151	GAT	2	6	1023	1028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902550
25	NC_021151	GGC	2	6	1035	1040	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902550
26	NC_021151	CGC	2	6	1050	1055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902550
27	NC_021151	GGT	2	6	1077	1082	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482902550
28	NC_021151	TCC	2	6	1096	1101	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482902550
29	NC_021151	TG	3	6	1123	1128	0 %	50 %	50 %	0 %	482902550
30	NC_021151	GC	3	6	1142	1147	0 %	0 %	50 %	50 %	482902550
31	NC_021151	CCG	2	6	1152	1157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902550
32	NC_021151	GCT	2	6	1197	1202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902550
33	NC_021151	TGT	2	6	1242	1247	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482902550
34	NC_021151	TTC	2	6	1288	1293	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482902550
35	NC_021151	AATATC	2	12	1312	1323	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	482902550
36	NC_021151	TCT	2	6	1342	1347	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482902550
37	NC_021151	TGG	2	6	1364	1369	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482902550
38	NC_021151	ACG	2	6	1376	1381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902550
39	NC_021151	CCA	2	6	1385	1390	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482902550
40	NC_021151	CGG	2	6	1461	1466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902550
41	NC_021151	CGG	2	6	1470	1475	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902550
42	NC_021151	GAA	2	6	1515	1520	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482902550
43	NC_021151	GCG	2	6	1544	1549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902550
44	NC_021151	ATC	2	6	1673	1678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482902550
45	NC_021151	TTG	2	6	1694	1699	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482902550
46	NC_021151	ACT	2	6	1802	1807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482902550
47	NC_021151	CGC	3	9	1824	1832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902550
48	NC_021151	CTG	2	6	1906	1911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902550
49	NC_021151	TGA	2	6	1920	1925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902550
50	NC_021151	CT	3	6	1960	1965	0 %	50 %	0 %	50 %	482902550
51	NC_021151	TC	3	6	1998	2003	0 %	50 %	0 %	50 %	482902550
52	NC_021151	GC	3	6	2020	2025	0 %	0 %	50 %	50 %	482902550
53	NC_021151	CG	3	6	2051	2056	0 %	0 %	50 %	50 %	482902550
54	NC_021151	GAC	2	6	2218	2223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902550
55	NC_021151	GCC	2	6	2230	2235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902550
56	NC_021151	TGA	2	6	2253	2258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902550
57	NC_021151	AGGTA	2	10	2259	2268	40 %	20 %	40 %	0 %	482902550
58	NC_021151	TAT	2	6	2392	2397	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482902550
59	NC_021151	TGC	2	6	2414	2419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902550
60	NC_021151	ATG	2	6	2438	2443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902550
61	NC_021151	CGG	3	9	2447	2455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902550
62	NC_021151	AGC	2	6	2623	2628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902551
63	NC_021151	GCC	2	6	2674	2679	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902551
64	NC_021151	A	7	7	2766	2772	100 %	0 %	0 %	0 %	482902551
65	NC_021151	CGT	2	6	2812	2817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902551
66	NC_021151	CGC	2	6	2818	2823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902551
67	NC_021151	ATGA	2	8	2834	2841	50 %	25 %	25 %	0 %	482902551
68	NC_021151	GCA	2	6	2913	2918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902551
69	NC_021151	TGA	2	6	2964	2969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902551
70	NC_021151	GAA	2	6	2972	2977	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482902551
71	NC_021151	ATT	2	6	2984	2989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482902551
72	NC_021151	CAG	2	6	2993	2998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902551
73	NC_021151	TGA	2	6	3010	3015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902551
74	NC_021151	ATTGC	2	10	3102	3111	20 %	40 %	20 %	20 %	482902551
75	NC_021151	GCC	2	6	3170	3175	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902551
76	NC_021151	TGA	2	6	3180	3185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902551
77	NC_021151	CG	4	8	3209	3216	0 %	0 %	50 %	50 %	482902551
78	NC_021151	GC	3	6	3264	3269	0 %	0 %	50 %	50 %	482902551
79	NC_021151	CGG	2	6	3411	3416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902551
80	NC_021151	AGT	2	6	3424	3429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902551
81	NC_021151	CAG	2	6	3515	3520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902552
82	NC_021151	T	8	8	3525	3532	0 %	100 %	0 %	0 %	482902552
83	NC_021151	TGA	2	6	3568	3573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902552
84	NC_021151	GCA	2	6	3643	3648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902552
85	NC_021151	CG	3	6	3668	3673	0 %	0 %	50 %	50 %	482902552
86	NC_021151	CGG	2	6	3766	3771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902552
87	NC_021151	GCG	2	6	3804	3809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902552
88	NC_021151	CGGCG	2	10	3850	3859	0 %	0 %	60 %	40 %	482902552
89	NC_021151	GTC	2	6	3896	3901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902552
90	NC_021151	CG	3	6	3912	3917	0 %	0 %	50 %	50 %	482902552
91	NC_021151	GGC	2	6	3959	3964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902552
92	NC_021151	TGA	2	6	4030	4035	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902552
93	NC_021151	GAA	2	6	4037	4042	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482902552
94	NC_021151	GCC	2	6	4089	4094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902552
95	NC_021151	CTA	2	6	4111	4116	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482902552
96	NC_021151	GCT	2	6	4207	4212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902552
97	NC_021151	CGC	2	6	4249	4254	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902552
98	NC_021151	GATG	2	8	4339	4346	25 %	25 %	50 %	0 %	482902552
99	NC_021151	CAGC	2	8	4348	4355	25 %	0 %	25 %	50 %	482902552
100	NC_021151	CG	3	6	4368	4373	0 %	0 %	50 %	50 %	482902552
101	NC_021151	GGA	2	6	4375	4380	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482902552
102	NC_021151	CCG	2	6	4387	4392	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902552
103	NC_021151	CTGA	2	8	4406	4413	25 %	25 %	25 %	25 %	482902552
104	NC_021151	GCG	2	6	4424	4429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902552
105	NC_021151	GAT	2	6	4433	4438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902552
106	NC_021151	CAG	2	6	4448	4453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902552
107	NC_021151	GCG	2	6	4499	4504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902552
108	NC_021151	AG	3	6	4588	4593	50 %	0 %	50 %	0 %	482902552
109	NC_021151	GCT	2	6	4660	4665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902552
110	NC_021151	CAT	2	6	4670	4675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482902552
111	NC_021151	CTGC	2	8	4676	4683	0 %	25 %	25 %	50 %	482902552
112	NC_021151	GCC	2	6	4691	4696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902552
113	NC_021151	TGA	3	9	4707	4715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902552
114	NC_021151	GTG	2	6	4768	4773	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_021151	TG	3	6	4854	4859	0 %	50 %	50 %	0 %	482902553
116	NC_021151	TCA	2	6	4869	4874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482902553
117	NC_021151	AAT	2	6	4934	4939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482902553
118	NC_021151	TCA	2	6	4948	4953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482902553
119	NC_021151	CG	3	6	4957	4962	0 %	0 %	50 %	50 %	482902553
120	NC_021151	T	6	6	4964	4969	0 %	100 %	0 %	0 %	482902553
121	NC_021151	ACC	2	6	4983	4988	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482902553
122	NC_021151	TCA	2	6	5007	5012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482902553
123	NC_021151	TTC	2	6	5046	5051	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482902553
124	NC_021151	CAC	3	9	5090	5098	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482902553
125	NC_021151	CG	3	6	5176	5181	0 %	0 %	50 %	50 %	482902553
126	NC_021151	AG	3	6	5258	5263	50 %	0 %	50 %	0 %	482902553
127	NC_021151	TGT	2	6	5274	5279	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482902553
128	NC_021151	CAAAAT	2	12	5284	5295	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	482902553
129	NC_021151	CGT	2	6	5299	5304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902553
130	NC_021151	GCG	2	6	5461	5466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902553
131	NC_021151	GCT	2	6	5494	5499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902553
132	NC_021151	AATCAG	2	12	5579	5590	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	482902553
133	NC_021151	A	7	7	5630	5636	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_021151	CGC	2	6	5637	5642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
135	NC_021151	CG	3	6	5677	5682	0 %	0 %	50 %	50 %	482902554
136	NC_021151	GCC	2	6	5685	5690	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902554
137	NC_021151	ACC	2	6	5802	5807	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482902554
138	NC_021151	CAA	2	6	5816	5821	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482902554
139	NC_021151	A	6	6	5972	5977	100 %	0 %	0 %	0 %	482902554
140	NC_021151	CGA	2	6	6007	6012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902554
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144	NC_021151	ACG	2	6	6241	6246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902554
145	NC_021151	GCCA	2	8	6370	6377	25 %	0 %	25 %	50 %	482902554
146	NC_021151	GCG	2	6	6568	6573	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902554
147	NC_021151	GC	3	6	6595	6600	0 %	0 %	50 %	50 %	482902554
148	NC_021151	CGA	2	6	6646	6651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902554
149	NC_021151	GCC	2	6	6719	6724	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902554
150	NC_021151	AGG	2	6	6784	6789	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482902554
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153	NC_021151	CCGCG	2	10	6890	6899	0 %	0 %	40 %	60 %	482902554
154	NC_021151	GCC	2	6	6932	6937	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902554
155	NC_021151	TGAA	2	8	6996	7003	50 %	25 %	25 %	0 %	482902554
156	NC_021151	AGC	2	6	7038	7043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902554
157	NC_021151	TAA	2	6	7078	7083	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482902554
158	NC_021151	TTG	2	6	7114	7119	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
159	NC_021151	ATG	2	6	7159	7164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
160	NC_021151	GGT	2	6	7212	7217	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
161	NC_021151	CGT	2	6	7305	7310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
162	NC_021151	ATC	2	6	7314	7319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
163	NC_021151	CAC	2	6	7403	7408	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482902555
164	NC_021151	TC	3	6	7479	7484	0 %	50 %	0 %	50 %	482902555
165	NC_021151	CAG	2	6	7551	7556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902555
166	NC_021151	AGC	2	6	7557	7562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902555
167	NC_021151	CG	3	6	7566	7571	0 %	0 %	50 %	50 %	482902555
168	NC_021151	CAG	2	6	7572	7577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902555
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170	NC_021151	CG	3	6	7664	7669	0 %	0 %	50 %	50 %	482902555
171	NC_021151	ATG	2	6	7729	7734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902555
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179	NC_021151	GC	3	6	8181	8186	0 %	0 %	50 %	50 %	482902555
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183	NC_021151	CTGT	2	8	8372	8379	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
184	NC_021151	CCTTC	2	10	8380	8389	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
185	NC_021151	AAT	2	6	8428	8433	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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190	NC_021151	GATGA	2	10	8621	8630	40 %	20 %	40 %	0 %	482902556
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194	NC_021151	GGA	2	6	9065	9070	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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210	NC_021151	GAAAA	2	10	9767	9776	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
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240	NC_021151	TCTTT	2	10	11028	11037	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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243	NC_021151	TCTG	2	8	11095	11102	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
244	NC_021151	A	6	6	11129	11134	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
245	NC_021151	T	6	6	11135	11140	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
246	NC_021151	TGA	2	6	11152	11157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
247	NC_021151	GTG	2	6	11192	11197	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
248	NC_021151	A	8	8	11204	11211	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
249	NC_021151	TTA	2	6	11246	11251	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
250	NC_021151	ATG	2	6	11267	11272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
251	NC_021151	ATT	2	6	11308	11313	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482902560
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266	NC_021151	A	6	6	11936	11941	100 %	0 %	0 %	0 %	482902560
267	NC_021151	CAAC	2	8	11957	11964	50 %	0 %	0 %	50 %	482902560
268	NC_021151	GTG	2	6	11981	11986	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482902560
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270	NC_021151	AAG	2	6	12086	12091	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482902560
271	NC_021151	TCT	2	6	12118	12123	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482902560
272	NC_021151	GCA	2	6	12126	12131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902560
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275	NC_021151	GCG	2	6	12434	12439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902560
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282	NC_021151	CG	3	6	12695	12700	0 %	0 %	50 %	50 %	482902560
283	NC_021151	AGA	2	6	12788	12793	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482902560
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392	NC_021151	T	6	6	17497	17502	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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398	NC_021151	TTG	2	6	17862	17867	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482902566
399	NC_021151	AGA	2	6	17896	17901	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482902566
400	NC_021151	CTG	2	6	18065	18070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902566
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402	NC_021151	CGG	2	6	18139	18144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902566
403	NC_021151	CCG	2	6	18174	18179	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902566
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412	NC_021151	CTG	2	6	18587	18592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902566
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432	NC_021151	CCA	2	6	19737	19742	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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