MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus M1 complete genome

Total Repeats: 68199

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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54002	NC_021059	ATA	2	6	2262043	2262048	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479330155
54003	NC_021059	T	6	6	2262084	2262089	0 %	100 %	0 %	0 %	479330155
54004	NC_021059	TAACA	2	10	2262191	2262200	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
54005	NC_021059	TAAA	3	12	2262221	2262232	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
54006	NC_021059	A	6	6	2262291	2262296	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54007	NC_021059	TTTAAT	2	12	2262337	2262348	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54008	NC_021059	TGAT	2	8	2262352	2262359	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
54009	NC_021059	A	6	6	2262363	2262368	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54010	NC_021059	ATT	2	6	2262373	2262378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54011	NC_021059	TGC	2	6	2262437	2262442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479330156
54012	NC_021059	AATT	2	8	2262452	2262459	50 %	50 %	0 %	0 %	479330156
54013	NC_021059	CTT	2	6	2262526	2262531	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479330156
54014	NC_021059	ATA	2	6	2262552	2262557	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479330156
54015	NC_021059	CAC	2	6	2262568	2262573	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479330156
54016	NC_021059	CTA	2	6	2262577	2262582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479330156
54017	NC_021059	CTT	2	6	2262652	2262657	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479330156
54018	NC_021059	CCA	2	6	2262690	2262695	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479330156
54019	NC_021059	GTT	2	6	2262798	2262803	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479330156
54020	NC_021059	CAA	2	6	2262847	2262852	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479330156
54021	NC_021059	TGT	2	6	2262866	2262871	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479330156
54022	NC_021059	TC	3	6	2262885	2262890	0 %	50 %	0 %	50 %	479330156
54023	NC_021059	ATA	2	6	2262949	2262954	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479330156
54024	NC_021059	TAA	2	6	2263013	2263018	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479330156
54025	NC_021059	TG	3	6	2263022	2263027	0 %	50 %	50 %	0 %	479330156
54026	NC_021059	TTA	2	6	2263092	2263097	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479330156
54027	NC_021059	ATA	2	6	2263171	2263176	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479330156
54028	NC_021059	TGT	2	6	2263183	2263188	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479330156
54029	NC_021059	CTA	2	6	2263255	2263260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479330156
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54031	NC_021059	CTT	2	6	2263309	2263314	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479330156
54032	NC_021059	CAT	2	6	2263318	2263323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479330156
54033	NC_021059	TGA	2	6	2263324	2263329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479330156
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54035	NC_021059	ACG	2	6	2263382	2263387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479330156
54036	NC_021059	CTG	2	6	2263393	2263398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479330156
54037	NC_021059	GTT	2	6	2263399	2263404	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479330156
54038	NC_021059	AT	3	6	2263473	2263478	50 %	50 %	0 %	0 %	479330156
54039	NC_021059	TAA	3	9	2263513	2263521	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479330156
54040	NC_021059	T	6	6	2263529	2263534	0 %	100 %	0 %	0 %	479330156
54041	NC_021059	TCATGG	2	12	2263548	2263559	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	479330156
54042	NC_021059	TAA	3	9	2263637	2263645	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479330156
54043	NC_021059	ATTT	2	8	2263651	2263658	25 %	75 %	0 %	0 %	479330156
54044	NC_021059	TGTCTT	2	12	2263675	2263686	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	479330156
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54047	NC_021059	CTT	2	6	2263747	2263752	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479330156
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54049	NC_021059	TGA	2	6	2263907	2263912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479330156
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54051	NC_021059	GT	3	6	2263963	2263968	0 %	50 %	50 %	0 %	479330156
54052	NC_021059	CTA	2	6	2263998	2264003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479330156
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54054	NC_021059	CAT	2	6	2264062	2264067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479330156
54055	NC_021059	TAC	2	6	2264069	2264074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479330156
54056	NC_021059	TAA	3	9	2264126	2264134	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479330156
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54059	NC_021059	TCC	2	6	2264190	2264195	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54060	NC_021059	ATA	2	6	2264260	2264265	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54061	NC_021059	ATC	2	6	2264282	2264287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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54063	NC_021059	TTA	2	6	2264392	2264397	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54064	NC_021059	TAA	2	6	2264431	2264436	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54065	NC_021059	CCG	2	6	2264468	2264473	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
54066	NC_021059	TCC	2	6	2264490	2264495	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54067	NC_021059	AT	3	6	2264510	2264515	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54068	NC_021059	AT	3	6	2264537	2264542	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54069	NC_021059	CAAATA	2	12	2264557	2264568	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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54071	NC_021059	GTT	2	6	2264641	2264646	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54072	NC_021059	T	7	7	2264695	2264701	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54073	NC_021059	TGA	2	6	2264736	2264741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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54075	NC_021059	ATTT	2	8	2264763	2264770	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
54076	NC_021059	CT	3	6	2264811	2264816	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
54077	NC_021059	TA	4	8	2264823	2264830	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54078	NC_021059	AT	3	6	2264836	2264841	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54079	NC_021059	A	6	6	2264843	2264848	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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54081	NC_021059	GTC	2	6	2264891	2264896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479330157
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54092	NC_021059	CGC	2	6	2265242	2265247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479330157
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54102	NC_021059	TAT	2	6	2265680	2265685	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479330157
54103	NC_021059	GGATTT	2	12	2265739	2265750	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	479330157
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54112	NC_021059	CA	3	6	2266094	2266099	50 %	0 %	0 %	50 %	479330157
54113	NC_021059	AAT	2	6	2266105	2266110	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479330157
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54115	NC_021059	A	6	6	2266273	2266278	100 %	0 %	0 %	0 %	479330157
54116	NC_021059	AAAC	2	8	2266297	2266304	75 %	0 %	0 %	25 %	479330157
54117	NC_021059	CCAT	2	8	2266313	2266320	25 %	25 %	0 %	50 %	479330157
54118	NC_021059	GAA	2	6	2266357	2266362	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479330157
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54120	NC_021059	GAT	2	6	2266384	2266389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479330157
54121	NC_021059	ATA	2	6	2266395	2266400	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479330157
54122	NC_021059	TAAA	2	8	2266403	2266410	75 %	25 %	0 %	0 %	479330157
54123	NC_021059	A	6	6	2266413	2266418	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54124	NC_021059	GGA	2	6	2266420	2266425	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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54353	NC_021059	GCA	2	6	2274979	2274984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479330161
54354	NC_021059	CTT	2	6	2275001	2275006	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479330161
54355	NC_021059	TCT	2	6	2275045	2275050	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479330161
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54454	NC_021059	TATT	2	8	2279528	2279535	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
54455	NC_021059	TA	3	6	2279543	2279548	50 %	50 %	0 %	0 %	479330163
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54468	NC_021059	TAT	2	6	2280227	2280232	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479330163
54469	NC_021059	AAAG	2	8	2280421	2280428	75 %	0 %	25 %	0 %	479330163
54470	NC_021059	ATT	2	6	2280464	2280469	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479330163
54471	NC_021059	CTTT	2	8	2280476	2280483	0 %	75 %	0 %	25 %	479330164
54472	NC_021059	AGCA	2	8	2280510	2280517	50 %	0 %	25 %	25 %	479330164
54473	NC_021059	TCG	2	6	2280546	2280551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479330164
54474	NC_021059	TTC	2	6	2280588	2280593	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479330164
54475	NC_021059	TGC	4	12	2280705	2280716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479330164
54476	NC_021059	AAT	2	6	2280732	2280737	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479330164
54477	NC_021059	CAT	2	6	2280746	2280751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479330164
54478	NC_021059	GT	3	6	2280758	2280763	0 %	50 %	50 %	0 %	479330164
54479	NC_021059	ATTA	2	8	2280777	2280784	50 %	50 %	0 %	0 %	479330164
54480	NC_021059	AT	3	6	2280892	2280897	50 %	50 %	0 %	0 %	479330164
54481	NC_021059	GTT	2	6	2280989	2280994	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479330164
54482	NC_021059	C	6	6	2281043	2281048	0 %	0 %	0 %	100 %	479330164
54483	NC_021059	AAT	2	6	2281066	2281071	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479330164
54484	NC_021059	CTG	2	6	2281107	2281112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479330164
54485	NC_021059	TGA	2	6	2281175	2281180	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54486	NC_021059	A	6	6	2281254	2281259	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54487	NC_021059	TCC	2	6	2281281	2281286	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54488	NC_021059	ATA	2	6	2281302	2281307	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54489	NC_021059	AT	3	6	2281346	2281351	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54490	NC_021059	A	6	6	2281360	2281365	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54491	NC_021059	ACT	2	6	2281384	2281389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54492	NC_021059	A	7	7	2281410	2281416	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54493	NC_021059	ATTT	2	8	2281457	2281464	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
54494	NC_021059	ATA	2	6	2281465	2281470	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54495	NC_021059	A	6	6	2281481	2281486	100 %	0 %	0 %	0 %	479330165
54496	NC_021059	CAG	2	6	2281513	2281518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479330165
54497	NC_021059	ATT	2	6	2281523	2281528	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479330165
54498	NC_021059	TCAA	2	8	2281533	2281540	50 %	25 %	0 %	25 %	479330165
54499	NC_021059	TGAT	2	8	2281580	2281587	25 %	50 %	25 %	0 %	479330165
54500	NC_021059	ACC	2	6	2281628	2281633	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479330165

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