MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pneumoniae SPN034183 draft genome

Total Repeats: 41473

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
37001	NC_021028	ATC	2	6	1822579	1822584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480537428
37002	NC_021028	ACC	2	6	1822604	1822609	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480537428
37003	NC_021028	CTT	2	6	1822614	1822619	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480537428
37004	NC_021028	T	6	6	1822753	1822758	0 %	100 %	0 %	0 %	480537428
37005	NC_021028	CGA	2	6	1822814	1822819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480537428
37006	NC_021028	TTC	2	6	1822888	1822893	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480537428
37007	NC_021028	GT	3	6	1823002	1823007	0 %	50 %	50 %	0 %	480537428
37008	NC_021028	GCT	2	6	1823090	1823095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480537429
37009	NC_021028	CTG	2	6	1823097	1823102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480537429
37010	NC_021028	ACC	2	6	1823188	1823193	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480537429
37011	NC_021028	T	6	6	1823227	1823232	0 %	100 %	0 %	0 %	480537429
37012	NC_021028	TTA	2	6	1823237	1823242	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480537429
37013	NC_021028	AAG	2	6	1823272	1823277	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480537429
37014	NC_021028	GCT	2	6	1823417	1823422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480537429
37015	NC_021028	TAG	2	6	1823427	1823432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480537429
37016	NC_021028	ATT	2	6	1823482	1823487	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480537429
37017	NC_021028	CCA	2	6	1823501	1823506	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480537429
37018	NC_021028	AAT	2	6	1823533	1823538	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480537429
37019	NC_021028	AAGC	2	8	1823590	1823597	50 %	0 %	25 %	25 %	480537429
37020	NC_021028	ATA	2	6	1823615	1823620	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480537429
37021	NC_021028	GCT	2	6	1823645	1823650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480537429
37022	NC_021028	AATCC	2	10	1823743	1823752	40 %	20 %	0 %	40 %	480537430
37023	NC_021028	TTC	2	6	1823777	1823782	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480537430
37024	NC_021028	TCT	2	6	1823799	1823804	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480537430
37025	NC_021028	TCT	2	6	1823838	1823843	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480537430
37026	NC_021028	AAT	2	6	1823858	1823863	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480537430
37027	NC_021028	TG	3	6	1823882	1823887	0 %	50 %	50 %	0 %	480537430
37028	NC_021028	TTG	2	6	1823899	1823904	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480537430
37029	NC_021028	CAA	2	6	1823915	1823920	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480537430
37030	NC_021028	ACA	2	6	1823949	1823954	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480537430
37031	NC_021028	TCAA	2	8	1824114	1824121	50 %	25 %	0 %	25 %	480537430
37032	NC_021028	CTT	2	6	1824145	1824150	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480537430
37033	NC_021028	CCT	2	6	1824223	1824228	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37034	NC_021028	ATC	2	6	1824333	1824338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480537431
37035	NC_021028	TGA	2	6	1824531	1824536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480537431
37036	NC_021028	CCATT	2	10	1824539	1824548	20 %	40 %	0 %	40 %	480537431
37037	NC_021028	GCT	2	6	1824556	1824561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480537431
37038	NC_021028	CTT	3	9	1824603	1824611	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480537432
37039	NC_021028	CAAG	2	8	1824675	1824682	50 %	0 %	25 %	25 %	480537432
37040	NC_021028	AC	3	6	1824688	1824693	50 %	0 %	0 %	50 %	480537432
37041	NC_021028	CAA	2	6	1824705	1824710	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480537432
37042	NC_021028	AT	3	6	1824728	1824733	50 %	50 %	0 %	0 %	480537432
37043	NC_021028	CCA	2	6	1824779	1824784	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480537432
37044	NC_021028	CA	3	6	1824808	1824813	50 %	0 %	0 %	50 %	480537432
37045	NC_021028	AAAGG	2	10	1824850	1824859	60 %	0 %	40 %	0 %	480537432
37046	NC_021028	CCG	2	6	1824878	1824883	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	480537432
37047	NC_021028	TAA	3	9	1824942	1824950	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480537432
37048	NC_021028	AAG	2	6	1825053	1825058	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480537432
37049	NC_021028	CAA	2	6	1825090	1825095	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480537432
37050	NC_021028	TTTG	2	8	1825096	1825103	0 %	75 %	25 %	0 %	480537432
37051	NC_021028	TGA	2	6	1825251	1825256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480537432
37052	NC_021028	CTT	2	6	1825257	1825262	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480537432
37053	NC_021028	GAA	2	6	1825306	1825311	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480537432
37054	NC_021028	CAA	2	6	1825335	1825340	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480537432
37055	NC_021028	TCT	2	6	1825394	1825399	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480537432
37056	NC_021028	CCA	3	9	1825475	1825483	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480537432
37057	NC_021028	AACT	2	8	1825518	1825525	50 %	25 %	0 %	25 %	480537432
37058	NC_021028	GAT	2	6	1825543	1825548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480537432
37059	NC_021028	GCT	2	6	1825556	1825561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480537432
37060	NC_021028	TTG	2	6	1825624	1825629	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480537432
37061	NC_021028	ATG	2	6	1825634	1825639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480537432
37062	NC_021028	TAA	2	6	1825647	1825652	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480537432
37063	NC_021028	CAAT	2	8	1825713	1825720	50 %	25 %	0 %	25 %	480537432
37064	NC_021028	CAA	2	6	1825740	1825745	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480537432
37065	NC_021028	CTG	2	6	1825758	1825763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480537432
37066	NC_021028	TGT	2	6	1825770	1825775	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480537432
37067	NC_021028	TGC	2	6	1825777	1825782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480537432
37068	NC_021028	GCT	2	6	1825841	1825846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480537432
37069	NC_021028	AACCA	2	10	1825867	1825876	60 %	0 %	0 %	40 %	480537432
37070	NC_021028	A	6	6	1825929	1825934	100 %	0 %	0 %	0 %	480537432
37071	NC_021028	T	6	6	1825948	1825953	0 %	100 %	0 %	0 %	480537432
37072	NC_021028	TAT	2	6	1826089	1826094	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37073	NC_021028	CAAA	2	8	1826109	1826116	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
37074	NC_021028	ATG	2	6	1826166	1826171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37075	NC_021028	ATA	2	6	1826204	1826209	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480537433
37076	NC_021028	GAA	2	6	1826212	1826217	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480537433
37077	NC_021028	TCT	2	6	1826253	1826258	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480537433
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37081	NC_021028	ATA	2	6	1826399	1826404	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480537433
37082	NC_021028	CTT	2	6	1826465	1826470	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480537433
37083	NC_021028	CAT	2	6	1826537	1826542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480537433
37084	NC_021028	TC	3	6	1826562	1826567	0 %	50 %	0 %	50 %	480537433
37085	NC_021028	GCTT	2	8	1826651	1826658	0 %	50 %	25 %	25 %	480537433
37086	NC_021028	TCT	2	6	1826725	1826730	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480537433
37087	NC_021028	TCTTA	2	10	1826792	1826801	20 %	60 %	0 %	20 %	480537433
37088	NC_021028	CCT	2	6	1826818	1826823	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37089	NC_021028	CTAG	2	8	1826824	1826831	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
37090	NC_021028	A	6	6	1826833	1826838	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37091	NC_021028	TCA	2	6	1826894	1826899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480537434
37092	NC_021028	CCAT	2	8	1826921	1826928	25 %	25 %	0 %	50 %	480537434
37093	NC_021028	ATA	2	6	1826936	1826941	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480537434
37094	NC_021028	TGA	2	6	1826984	1826989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480537434
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37096	NC_021028	CATTGA	2	12	1827069	1827080	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	480537434
37097	NC_021028	ATA	2	6	1827170	1827175	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480537434
37098	NC_021028	ACG	2	6	1827214	1827219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480537434
37099	NC_021028	TCA	2	6	1827386	1827391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480537434
37100	NC_021028	CTT	2	6	1827399	1827404	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480537434
37101	NC_021028	TCT	2	6	1827458	1827463	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480537434
37102	NC_021028	TCA	2	6	1827512	1827517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480537434
37103	NC_021028	CTT	2	6	1827531	1827536	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480537434
37104	NC_021028	T	7	7	1827543	1827549	0 %	100 %	0 %	0 %	480537434
37105	NC_021028	TTC	2	6	1827583	1827588	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480537434
37106	NC_021028	T	7	7	1827624	1827630	0 %	100 %	0 %	0 %	480537434
37107	NC_021028	TAC	2	6	1827643	1827648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480537434
37108	NC_021028	ACA	2	6	1827665	1827670	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480537434
37109	NC_021028	T	6	6	1827709	1827714	0 %	100 %	0 %	0 %	480537434
37110	NC_021028	T	6	6	1827736	1827741	0 %	100 %	0 %	0 %	480537434
37111	NC_021028	CTT	2	6	1827813	1827818	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480537434
37112	NC_021028	TAC	2	6	1827838	1827843	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480537434
37113	NC_021028	TCC	2	6	1827855	1827860	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37114	NC_021028	TTAT	2	8	1827861	1827868	25 %	75 %	0 %	0 %	480537435
37115	NC_021028	CTTTT	2	10	1827894	1827903	0 %	80 %	0 %	20 %	480537435
37116	NC_021028	TAC	2	6	1827931	1827936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480537435
37117	NC_021028	ATT	2	6	1827967	1827972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480537435
37118	NC_021028	CAT	2	6	1828081	1828086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480537435
37119	NC_021028	TTG	2	6	1828121	1828126	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480537435
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37138	NC_021028	TCA	2	6	1829116	1829121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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37141	NC_021028	T	6	6	1829187	1829192	0 %	100 %	0 %	0 %	480537437
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37198	NC_021028	ATG	2	6	1831688	1831693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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37477	NC_021028	CTT	2	6	1845980	1845985	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480537454
37478	NC_021028	TAA	2	6	1846035	1846040	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480537454
37479	NC_021028	TTCTT	2	10	1846043	1846052	0 %	80 %	0 %	20 %	480537454
37480	NC_021028	A	6	6	1846098	1846103	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37481	NC_021028	A	7	7	1846109	1846115	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37482	NC_021028	TA	3	6	1846355	1846360	50 %	50 %	0 %	0 %	480537455
37483	NC_021028	TAT	2	6	1846366	1846371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480537455
37484	NC_021028	GTT	2	6	1846505	1846510	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480537455
37485	NC_021028	TA	4	8	1846522	1846529	50 %	50 %	0 %	0 %	480537455
37486	NC_021028	CTG	2	6	1846532	1846537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480537455
37487	NC_021028	TTC	2	6	1846602	1846607	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480537455
37488	NC_021028	GCAC	2	8	1846623	1846630	25 %	0 %	25 %	50 %	480537455
37489	NC_021028	TCT	2	6	1846662	1846667	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480537455
37490	NC_021028	CT	3	6	1846712	1846717	0 %	50 %	0 %	50 %	480537455
37491	NC_021028	T	6	6	1846831	1846836	0 %	100 %	0 %	0 %	480537455
37492	NC_021028	AG	3	6	1846912	1846917	50 %	0 %	50 %	0 %	480537456
37493	NC_021028	CCAA	2	8	1846943	1846950	50 %	0 %	0 %	50 %	480537456
37494	NC_021028	GTC	2	6	1847073	1847078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480537456
37495	NC_021028	AGT	2	6	1847091	1847096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480537456
37496	NC_021028	AT	3	6	1847177	1847182	50 %	50 %	0 %	0 %	480537456
37497	NC_021028	GTTT	2	8	1847226	1847233	0 %	75 %	25 %	0 %	480537456
37498	NC_021028	ATC	2	6	1847258	1847263	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480537456
37499	NC_021028	AGGC	2	8	1847314	1847321	25 %	0 %	50 %	25 %	480537456
37500	NC_021028	TCA	2	6	1847422	1847427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480537456

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