MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pneumoniae SPN034183 draft genome

Total Repeats: 41473

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
34501	NC_021028	TAA	2	6	1697795	1697800	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34502	NC_021028	AGG	2	6	1697807	1697812	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34503	NC_021028	CACG	2	8	1697829	1697836	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
34504	NC_021028	TCC	2	6	1697891	1697896	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34505	NC_021028	GCG	2	6	1697996	1698001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
34506	NC_021028	CT	3	6	1698331	1698336	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
34507	NC_021028	ACG	2	6	1698343	1698348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34508	NC_021028	GGT	2	6	1698380	1698385	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34509	NC_021028	TCT	2	6	1698417	1698422	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34510	NC_021028	AT	3	6	1698605	1698610	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34511	NC_021028	ACT	2	6	1698897	1698902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34512	NC_021028	ATTCA	2	10	1699008	1699017	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
34513	NC_021028	TATTAG	2	12	1699069	1699080	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34514	NC_021028	CACTTC	2	12	1699100	1699111	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
34515	NC_021028	ATC	2	6	1699127	1699132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34516	NC_021028	TC	3	6	1699131	1699136	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
34517	NC_021028	AT	3	6	1699150	1699155	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34518	NC_021028	TCCCT	2	10	1699213	1699222	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
34519	NC_021028	ACG	2	6	1699355	1699360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34520	NC_021028	CGA	2	6	1699435	1699440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34521	NC_021028	ACC	2	6	1699550	1699555	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34522	NC_021028	AGG	2	6	1699686	1699691	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34523	NC_021028	GTA	2	6	1699774	1699779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34524	NC_021028	CCTA	2	8	1699826	1699833	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
34525	NC_021028	TC	3	6	1699946	1699951	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
34526	NC_021028	GCC	2	6	1700043	1700048	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
34527	NC_021028	CTC	2	6	1700091	1700096	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34528	NC_021028	CAT	2	6	1700134	1700139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34529	NC_021028	AG	3	6	1700153	1700158	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34530	NC_021028	TC	3	6	1700269	1700274	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
34531	NC_021028	CTA	2	6	1700382	1700387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34532	NC_021028	AGAC	2	8	1700457	1700464	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
34533	NC_021028	TTAG	2	8	1700482	1700489	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
34534	NC_021028	TGT	2	6	1700539	1700544	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34535	NC_021028	TC	3	6	1700565	1700570	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
34536	NC_021028	CTC	2	6	1700695	1700700	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34537	NC_021028	TCA	2	6	1700712	1700717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34538	NC_021028	CA	3	6	1700716	1700721	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
34539	NC_021028	TGAA	2	8	1700835	1700842	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
34540	NC_021028	GCT	2	6	1700845	1700850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34541	NC_021028	ATT	2	6	1700905	1700910	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34542	NC_021028	TGG	2	6	1700924	1700929	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34543	NC_021028	GA	3	6	1701105	1701110	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34544	NC_021028	TCC	2	6	1701191	1701196	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34545	NC_021028	CAT	2	6	1701324	1701329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34546	NC_021028	TTG	2	6	1701390	1701395	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34547	NC_021028	CTCCC	2	10	1701424	1701433	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
34548	NC_021028	TCC	2	6	1701509	1701514	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34549	NC_021028	CCG	2	6	1701541	1701546	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
34550	NC_021028	CT	3	6	1701597	1701602	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
34551	NC_021028	TTC	2	6	1701624	1701629	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34552	NC_021028	TCGC	2	8	1701702	1701709	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
34553	NC_021028	CTA	2	6	1701712	1701717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34554	NC_021028	TCC	2	6	1701778	1701783	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34555	NC_021028	TAC	2	6	1701813	1701818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34556	NC_021028	ATC	2	6	1701850	1701855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34557	NC_021028	CTTA	2	8	1701857	1701864	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
34558	NC_021028	TCG	2	6	1701882	1701887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34559	NC_021028	TCG	2	6	1701901	1701906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34560	NC_021028	TTA	2	6	1701939	1701944	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34561	NC_021028	TTA	2	6	1701982	1701987	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34562	NC_021028	TAC	2	6	1701989	1701994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34563	NC_021028	TC	3	6	1702066	1702071	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
34564	NC_021028	CCT	2	6	1702104	1702109	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34565	NC_021028	TCCTTA	2	12	1702188	1702199	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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34569	NC_021028	GTG	2	6	1702329	1702334	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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34571	NC_021028	GT	3	6	1702513	1702518	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
34572	NC_021028	ATG	2	6	1702538	1702543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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34574	NC_021028	TTA	2	6	1702573	1702578	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34575	NC_021028	ATG	2	6	1702608	1702613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34576	NC_021028	CACGA	2	10	1702663	1702672	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
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34581	NC_021028	TCC	2	6	1703028	1703033	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34582	NC_021028	AT	3	6	1703034	1703039	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34583	NC_021028	CTA	2	6	1703111	1703116	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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34588	NC_021028	CTG	2	6	1703386	1703391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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34592	NC_021028	AAGC	2	8	1703660	1703667	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
34593	NC_021028	TCC	2	6	1703668	1703673	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34594	NC_021028	CGC	2	6	1703703	1703708	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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34597	NC_021028	TGT	2	6	1703818	1703823	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34598	NC_021028	TC	3	6	1703880	1703885	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
34599	NC_021028	T	6	6	1703934	1703939	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34600	NC_021028	T	7	7	1703953	1703959	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34601	NC_021028	T	7	7	1703964	1703970	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34602	NC_021028	CCG	2	6	1704028	1704033	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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34604	NC_021028	TAT	2	6	1704095	1704100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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34606	NC_021028	T	7	7	1704138	1704144	0 %	100 %	0 %	0 %	480537316
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34608	NC_021028	CGAC	2	8	1704191	1704198	25 %	0 %	25 %	50 %	480537316
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34610	NC_021028	T	6	6	1704281	1704286	0 %	100 %	0 %	0 %	480537316
34611	NC_021028	TAAG	2	8	1704295	1704302	50 %	25 %	25 %	0 %	480537316
34612	NC_021028	TAA	2	6	1704312	1704317	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480537316
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34625	NC_021028	TGTATT	2	12	1704753	1704764	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	480537316
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