MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pneumoniae SPN034183 draft genome

Total Repeats: 41473

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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33002	NC_021028	CATAG	2	10	1620041	1620050	40 %	20 %	20 %	20 %	480537245
33003	NC_021028	AAG	2	6	1620107	1620112	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480537245
33004	NC_021028	GTT	2	6	1620123	1620128	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480537245
33005	NC_021028	GAC	2	6	1620232	1620237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480537245
33006	NC_021028	AAG	2	6	1620245	1620250	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480537245
33007	NC_021028	ATG	2	6	1620333	1620338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480537245
33008	NC_021028	GATT	2	8	1620430	1620437	25 %	50 %	25 %	0 %	480537245
33009	NC_021028	AGA	2	6	1620473	1620478	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480537245
33010	NC_021028	CCA	2	6	1620516	1620521	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480537245
33011	NC_021028	CAT	2	6	1620598	1620603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480537245
33012	NC_021028	TTC	2	6	1620662	1620667	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480537245
33013	NC_021028	GA	3	6	1620701	1620706	50 %	0 %	50 %	0 %	480537245
33014	NC_021028	AAT	2	6	1620803	1620808	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480537245
33015	NC_021028	CCT	2	6	1620839	1620844	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480537246
33016	NC_021028	AGA	2	6	1620861	1620866	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480537246
33017	NC_021028	CT	3	6	1620889	1620894	0 %	50 %	0 %	50 %	480537246
33018	NC_021028	ATG	2	6	1620943	1620948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480537246
33019	NC_021028	TCA	2	6	1620955	1620960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480537246
33020	NC_021028	TCT	2	6	1620985	1620990	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480537246
33021	NC_021028	TCAA	2	8	1621000	1621007	50 %	25 %	0 %	25 %	480537246
33022	NC_021028	CATG	2	8	1621097	1621104	25 %	25 %	25 %	25 %	480537246
33023	NC_021028	ACC	2	6	1621128	1621133	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480537246
33024	NC_021028	TGG	2	6	1621153	1621158	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480537246
33025	NC_021028	CAAA	2	8	1621161	1621168	75 %	0 %	0 %	25 %	480537246
33026	NC_021028	CTT	2	6	1621182	1621187	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480537246
33027	NC_021028	ACCAGG	2	12	1621239	1621250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480537246
33028	NC_021028	AGACC	2	10	1621256	1621265	40 %	0 %	20 %	40 %	480537246
33029	NC_021028	CTT	2	6	1621280	1621285	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480537246
33030	NC_021028	ATC	2	6	1621299	1621304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480537246
33031	NC_021028	TCAA	2	8	1621378	1621385	50 %	25 %	0 %	25 %	480537246
33032	NC_021028	CAG	2	6	1621666	1621671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480537247
33033	NC_021028	GCAA	2	8	1621710	1621717	50 %	0 %	25 %	25 %	480537247
33034	NC_021028	CTG	2	6	1621855	1621860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480537247
33035	NC_021028	TCA	2	6	1621869	1621874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480537247
33036	NC_021028	GAG	2	6	1621877	1621882	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480537247
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33038	NC_021028	GAT	2	6	1622000	1622005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480537247
33039	NC_021028	CTG	2	6	1622098	1622103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480537247
33040	NC_021028	GCTG	2	8	1622110	1622117	0 %	25 %	50 %	25 %	480537247
33041	NC_021028	GTG	2	6	1622215	1622220	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480537247
33042	NC_021028	TCT	2	6	1622344	1622349	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480537247
33043	NC_021028	CTT	2	6	1622351	1622356	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480537247
33044	NC_021028	TTC	2	6	1622438	1622443	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480537247
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33048	NC_021028	CT	3	6	1622667	1622672	0 %	50 %	0 %	50 %	480537247
33049	NC_021028	ATGA	2	8	1622735	1622742	50 %	25 %	25 %	0 %	480537247
33050	NC_021028	TC	3	6	1622872	1622877	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33051	NC_021028	ATG	2	6	1622936	1622941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33052	NC_021028	TCT	2	6	1622945	1622950	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33053	NC_021028	CT	3	6	1623009	1623014	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33054	NC_021028	GA	3	6	1623017	1623022	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
33055	NC_021028	TAT	2	6	1623044	1623049	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33056	NC_021028	T	6	6	1623049	1623054	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33057	NC_021028	TGA	2	6	1623110	1623115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33058	NC_021028	TTC	2	6	1623157	1623162	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33059	NC_021028	T	6	6	1623345	1623350	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33060	NC_021028	TAG	2	6	1623380	1623385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33061	NC_021028	TAGA	2	8	1623400	1623407	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
33062	NC_021028	TCA	2	6	1623416	1623421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33063	NC_021028	TAA	2	6	1623438	1623443	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33064	NC_021028	ACG	2	6	1623456	1623461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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33066	NC_021028	CA	4	8	1623476	1623483	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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33068	NC_021028	ACT	2	6	1623645	1623650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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33070	NC_021028	CAC	2	6	1623671	1623676	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33071	NC_021028	TTG	2	6	1623714	1623719	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33072	NC_021028	T	6	6	1623739	1623744	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33073	NC_021028	T	6	6	1623757	1623762	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33074	NC_021028	T	7	7	1623767	1623773	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33075	NC_021028	GAACAT	2	12	1623810	1623821	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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33088	NC_021028	ATC	2	6	1624526	1624531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480537248
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33090	NC_021028	CTA	2	6	1624561	1624566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480537248
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33093	NC_021028	AT	3	6	1624729	1624734	50 %	50 %	0 %	0 %	480537248
33094	NC_021028	CTT	2	6	1624741	1624746	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480537248
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33100	NC_021028	TCC	2	6	1624942	1624947	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33101	NC_021028	T	8	8	1624984	1624991	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33102	NC_021028	ATT	2	6	1625010	1625015	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33103	NC_021028	AATT	2	8	1625036	1625043	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33104	NC_021028	TTC	2	6	1625053	1625058	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480537249
33105	NC_021028	A	6	6	1625065	1625070	100 %	0 %	0 %	0 %	480537249
33106	NC_021028	AAAT	2	8	1625124	1625131	75 %	25 %	0 %	0 %	480537249
33107	NC_021028	A	6	6	1625141	1625146	100 %	0 %	0 %	0 %	480537249
33108	NC_021028	ATA	2	6	1625205	1625210	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480537249
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33110	NC_021028	TCA	2	6	1625276	1625281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480537249
33111	NC_021028	AAAT	2	8	1625328	1625335	75 %	25 %	0 %	0 %	480537249
33112	NC_021028	ATT	2	6	1625356	1625361	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480537249
33113	NC_021028	GAT	2	6	1625447	1625452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33114	NC_021028	A	6	6	1625463	1625468	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33115	NC_021028	TTC	2	6	1625517	1625522	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480537250
33116	NC_021028	ATAA	2	8	1625526	1625533	75 %	25 %	0 %	0 %	480537250
33117	NC_021028	TTC	2	6	1625553	1625558	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480537250
33118	NC_021028	TAA	2	6	1625600	1625605	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480537250
33119	NC_021028	T	7	7	1625615	1625621	0 %	100 %	0 %	0 %	480537250
33120	NC_021028	TA	3	6	1625754	1625759	50 %	50 %	0 %	0 %	480537250
33121	NC_021028	T	7	7	1625793	1625799	0 %	100 %	0 %	0 %	480537250
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33233	NC_021028	CTT	2	6	1630797	1630802	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33234	NC_021028	T	6	6	1630801	1630806	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33235	NC_021028	T	8	8	1630878	1630885	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33236	NC_021028	ATC	2	6	1630963	1630968	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33237	NC_021028	T	6	6	1630986	1630991	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33238	NC_021028	TGT	2	6	1631036	1631041	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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33482	NC_021028	TG	3	6	1644753	1644758	0 %	50 %	50 %	0 %	480537267
33483	NC_021028	TCC	2	6	1644771	1644776	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480537267
33484	NC_021028	CAA	2	6	1644787	1644792	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480537267
33485	NC_021028	GTCG	2	8	1644838	1644845	0 %	25 %	50 %	25 %	480537267
33486	NC_021028	TCT	2	6	1644939	1644944	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480537267
33487	NC_021028	TTA	2	6	1644987	1644992	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480537267
33488	NC_021028	CTTG	2	8	1645072	1645079	0 %	50 %	25 %	25 %	480537267
33489	NC_021028	GTT	2	6	1645163	1645168	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480537267
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33492	NC_021028	TC	3	6	1645206	1645211	0 %	50 %	0 %	50 %	480537267
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33497	NC_021028	A	6	6	1645502	1645507	100 %	0 %	0 %	0 %	480537267
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