MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pneumoniae SPN034183 draft genome

Total Repeats: 41473

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
31001	NC_021028	AGAA	2	8	1519737	1519744	75 %	0 %	25 %	0 %	480537137
31002	NC_021028	TCT	2	6	1519759	1519764	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480537137
31003	NC_021028	GGAAA	2	10	1519802	1519811	60 %	0 %	40 %	0 %	480537137
31004	NC_021028	CTG	2	6	1519862	1519867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480537137
31005	NC_021028	CTTT	2	8	1519926	1519933	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
31006	NC_021028	TAA	2	6	1519936	1519941	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480537138
31007	NC_021028	TC	3	6	1519945	1519950	0 %	50 %	0 %	50 %	480537138
31008	NC_021028	GAG	2	6	1519965	1519970	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480537138
31009	NC_021028	ACC	2	6	1519975	1519980	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480537138
31010	NC_021028	TCCA	2	8	1520180	1520187	25 %	25 %	0 %	50 %	480537138
31011	NC_021028	CTTC	2	8	1520459	1520466	0 %	50 %	0 %	50 %	480537138
31012	NC_021028	TCA	2	6	1520527	1520532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480537138
31013	NC_021028	GTT	2	6	1520576	1520581	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480537138
31014	NC_021028	CT	3	6	1520616	1520621	0 %	50 %	0 %	50 %	480537138
31015	NC_021028	AATC	2	8	1520645	1520652	50 %	25 %	0 %	25 %	480537138
31016	NC_021028	TCCAG	2	10	1520713	1520722	20 %	20 %	20 %	40 %	480537138
31017	NC_021028	CAT	2	6	1520864	1520869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480537138
31018	NC_021028	GGCAAC	2	12	1520883	1520894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480537138
31019	NC_021028	TTGG	2	8	1521010	1521017	0 %	50 %	50 %	0 %	480537138
31020	NC_021028	TCC	2	6	1521044	1521049	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480537139
31021	NC_021028	CCT	2	6	1521216	1521221	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480537139
31022	NC_021028	TTC	2	6	1521358	1521363	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480537139
31023	NC_021028	TCA	2	6	1521393	1521398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31024	NC_021028	TCT	2	6	1521460	1521465	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480537140
31025	NC_021028	TGGT	2	8	1521528	1521535	0 %	50 %	50 %	0 %	480537140
31026	NC_021028	GAC	2	6	1521539	1521544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480537140
31027	NC_021028	AT	3	6	1521649	1521654	50 %	50 %	0 %	0 %	480537140
31028	NC_021028	TGGT	2	8	1521673	1521680	0 %	50 %	50 %	0 %	480537140
31029	NC_021028	TAG	2	6	1521751	1521756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480537140
31030	NC_021028	GGA	2	6	1521797	1521802	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480537140
31031	NC_021028	AAGG	2	8	1521852	1521859	50 %	0 %	50 %	0 %	480537140
31032	NC_021028	AGC	2	6	1521873	1521878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480537140
31033	NC_021028	CCA	2	6	1522022	1522027	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480537140
31034	NC_021028	CATCT	2	10	1522050	1522059	20 %	40 %	0 %	40 %	480537140
31035	NC_021028	CTGG	2	8	1522151	1522158	0 %	25 %	50 %	25 %	480537140
31036	NC_021028	AACC	2	8	1522161	1522168	50 %	0 %	0 %	50 %	480537140
31037	NC_021028	CTT	2	6	1522242	1522247	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480537140
31038	NC_021028	AGA	2	6	1522299	1522304	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480537140
31039	NC_021028	ATA	2	6	1522348	1522353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480537140
31040	NC_021028	TGA	2	6	1522421	1522426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480537140
31041	NC_021028	ACGA	2	8	1522609	1522616	50 %	0 %	25 %	25 %	480537141
31042	NC_021028	T	6	6	1522626	1522631	0 %	100 %	0 %	0 %	480537141
31043	NC_021028	ATG	2	6	1522718	1522723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480537141
31044	NC_021028	ATA	2	6	1522783	1522788	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480537141
31045	NC_021028	T	6	6	1522802	1522807	0 %	100 %	0 %	0 %	480537141
31046	NC_021028	CAC	2	6	1522824	1522829	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480537141
31047	NC_021028	GAA	2	6	1522830	1522835	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480537141
31048	NC_021028	GTT	2	6	1522859	1522864	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480537141
31049	NC_021028	CTT	2	6	1522869	1522874	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480537141
31050	NC_021028	TTTG	2	8	1522893	1522900	0 %	75 %	25 %	0 %	480537141
31051	NC_021028	AGC	2	6	1522906	1522911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480537141
31052	NC_021028	AAATC	2	10	1523043	1523052	60 %	20 %	0 %	20 %	480537141
31053	NC_021028	TCA	2	6	1523087	1523092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480537141
31054	NC_021028	TGA	2	6	1523115	1523120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480537141
31055	NC_021028	CTT	3	9	1523274	1523282	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480537141
31056	NC_021028	CTT	2	6	1523319	1523324	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480537141
31057	NC_021028	TCT	2	6	1523369	1523374	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480537141
31058	NC_021028	CTT	2	6	1523457	1523462	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480537141
31059	NC_021028	TATT	2	8	1523466	1523473	25 %	75 %	0 %	0 %	480537141
31060	NC_021028	CAAATC	2	12	1523658	1523669	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	480537142
31061	NC_021028	CTTG	2	8	1523680	1523687	0 %	50 %	25 %	25 %	480537142
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31063	NC_021028	TGT	2	6	1523712	1523717	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480537142
31064	NC_021028	TCTT	2	8	1523742	1523749	0 %	75 %	0 %	25 %	480537142
31065	NC_021028	TCA	3	9	1523768	1523776	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480537142
31066	NC_021028	ATCAT	2	10	1523806	1523815	40 %	40 %	0 %	20 %	480537142
31067	NC_021028	CAA	2	6	1523846	1523851	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480537142
31068	NC_021028	GTT	2	6	1523856	1523861	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480537142
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31070	NC_021028	CTT	2	6	1523978	1523983	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480537142
31071	NC_021028	TGA	2	6	1524239	1524244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480537142
31072	NC_021028	GTT	2	6	1524275	1524280	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480537142
31073	NC_021028	CAT	2	6	1524290	1524295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480537142
31074	NC_021028	GCT	2	6	1524352	1524357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480537142
31075	NC_021028	TCA	2	6	1524452	1524457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480537142
31076	NC_021028	ATC	2	6	1524459	1524464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480537142
31077	NC_021028	GAC	2	6	1524506	1524511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480537142
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31083	NC_021028	ACCA	2	8	1524786	1524793	50 %	0 %	0 %	50 %	480537142
31084	NC_021028	AAG	2	6	1524870	1524875	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480537142
31085	NC_021028	TTG	2	6	1524908	1524913	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480537142
31086	NC_021028	TGT	2	6	1524932	1524937	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480537142
31087	NC_021028	TTC	3	9	1524951	1524959	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480537142
31088	NC_021028	T	6	6	1524993	1524998	0 %	100 %	0 %	0 %	480537142
31089	NC_021028	CTT	2	6	1525067	1525072	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480537142
31090	NC_021028	ACG	2	6	1525107	1525112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480537142
31091	NC_021028	CAC	2	6	1525170	1525175	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480537142
31092	NC_021028	ATG	2	6	1525195	1525200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480537142
31093	NC_021028	GAT	2	6	1525338	1525343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480537142
31094	NC_021028	ACTG	2	8	1525394	1525401	25 %	25 %	25 %	25 %	480537142
31095	NC_021028	TCAA	2	8	1525450	1525457	50 %	25 %	0 %	25 %	480537142
31096	NC_021028	AGTT	2	8	1525562	1525569	25 %	50 %	25 %	0 %	480537142
31097	NC_021028	AGTA	2	8	1525571	1525578	50 %	25 %	25 %	0 %	480537142
31098	NC_021028	CTT	2	6	1525595	1525600	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480537142
31099	NC_021028	T	6	6	1525599	1525604	0 %	100 %	0 %	0 %	480537142
31100	NC_021028	CCAAG	2	10	1525648	1525657	40 %	0 %	20 %	40 %	480537142
31101	NC_021028	TTCCC	2	10	1525777	1525786	0 %	40 %	0 %	60 %	480537142
31102	NC_021028	GAA	2	6	1525817	1525822	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480537142
31103	NC_021028	C	7	7	1525827	1525833	0 %	0 %	0 %	100 %	480537142
31104	NC_021028	GTC	2	6	1525977	1525982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480537142
31105	NC_021028	AGC	2	6	1525989	1525994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480537142
31106	NC_021028	GAC	2	6	1526039	1526044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480537142
31107	NC_021028	ATT	2	6	1526157	1526162	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31108	NC_021028	GAA	2	6	1526169	1526174	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31109	NC_021028	ATAA	2	8	1526273	1526280	75 %	25 %	0 %	0 %	480537143
31110	NC_021028	GACT	2	8	1526325	1526332	25 %	25 %	25 %	25 %	480537143
31111	NC_021028	ATG	2	6	1526393	1526398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480537143
31112	NC_021028	AGA	2	6	1526445	1526450	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480537143
31113	NC_021028	CAG	2	6	1526464	1526469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480537143
31114	NC_021028	TAA	2	6	1526502	1526507	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480537143
31115	NC_021028	T	6	6	1526654	1526659	0 %	100 %	0 %	0 %	480537144
31116	NC_021028	T	6	6	1526776	1526781	0 %	100 %	0 %	0 %	480537144
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31118	NC_021028	TC	3	6	1526910	1526915	0 %	50 %	0 %	50 %	480537144
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31241	NC_021028	GAAT	2	8	1532835	1532842	50 %	25 %	25 %	0 %	480537152
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31319	NC_021028	GAACG	2	10	1536429	1536438	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
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31349	NC_021028	ATC	2	6	1538106	1538111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480537158
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31351	NC_021028	TCT	2	6	1538299	1538304	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480537158
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31474	NC_021028	CTT	2	6	1543680	1543685	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480537161
31475	NC_021028	TAA	2	6	1543701	1543706	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480537161
31476	NC_021028	ATT	2	6	1543792	1543797	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480537161
31477	NC_021028	GCT	2	6	1543805	1543810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480537161
31478	NC_021028	GCA	2	6	1543910	1543915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480537161
31479	NC_021028	TA	3	6	1543947	1543952	50 %	50 %	0 %	0 %	480537161
31480	NC_021028	TAT	2	6	1543997	1544002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31481	NC_021028	A	6	6	1544040	1544045	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31482	NC_021028	TCTA	2	8	1544049	1544056	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
31483	NC_021028	GATT	2	8	1544075	1544082	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
31484	NC_021028	TCA	2	6	1544096	1544101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31485	NC_021028	TATT	2	8	1544195	1544202	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
31486	NC_021028	T	6	6	1544223	1544228	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31487	NC_021028	T	6	6	1544232	1544237	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31488	NC_021028	T	6	6	1544255	1544260	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31489	NC_021028	GGA	2	6	1544298	1544303	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31490	NC_021028	GAATG	2	10	1544306	1544315	40 %	20 %	40 %	0 %	480537162
31491	NC_021028	CGT	2	6	1544326	1544331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480537162
31492	NC_021028	AAG	2	6	1544357	1544362	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480537162
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31497	NC_021028	GTC	2	6	1544845	1544850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480537162
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