MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pneumoniae SPN034183 draft genome

Total Repeats: 41473

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
30001	NC_021028	CTA	2	6	1470762	1470767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30002	NC_021028	ATA	2	6	1470791	1470796	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30003	NC_021028	TAC	2	6	1470801	1470806	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30004	NC_021028	GCT	2	6	1470887	1470892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30005	NC_021028	ACC	2	6	1470973	1470978	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30006	NC_021028	GCTT	2	8	1471085	1471092	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
30007	NC_021028	GCTTG	2	10	1471122	1471131	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
30008	NC_021028	CT	4	8	1471153	1471160	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
30009	NC_021028	AGC	2	6	1471213	1471218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30010	NC_021028	ACG	2	6	1471225	1471230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30011	NC_021028	CTT	2	6	1471299	1471304	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30012	NC_021028	T	6	6	1471303	1471308	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30013	NC_021028	TTC	2	6	1471381	1471386	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30014	NC_021028	TGA	2	6	1471393	1471398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30015	NC_021028	CACTTC	2	12	1471503	1471514	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
30016	NC_021028	CTT	2	6	1471608	1471613	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30017	NC_021028	CTGA	2	8	1471686	1471693	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
30018	NC_021028	GTC	2	6	1471698	1471703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30019	NC_021028	TTC	2	6	1471831	1471836	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30020	NC_021028	GTT	2	6	1471895	1471900	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30021	NC_021028	GTC	2	6	1471916	1471921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30022	NC_021028	CTA	2	6	1471950	1471955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30023	NC_021028	CAT	2	6	1471972	1471977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30024	NC_021028	A	6	6	1471994	1471999	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30025	NC_021028	CAC	2	6	1472105	1472110	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480537101
30026	NC_021028	GAT	2	6	1472183	1472188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480537101
30027	NC_021028	TCA	2	6	1472274	1472279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480537101
30028	NC_021028	CG	3	6	1472309	1472314	0 %	0 %	50 %	50 %	480537101
30029	NC_021028	GCTGG	2	10	1472350	1472359	0 %	20 %	60 %	20 %	480537101
30030	NC_021028	AAAC	2	8	1472494	1472501	75 %	0 %	0 %	25 %	480537101
30031	NC_021028	CAT	2	6	1472506	1472511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480537101
30032	NC_021028	TGG	2	6	1472532	1472537	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480537101
30033	NC_021028	TCA	2	6	1472583	1472588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480537101
30034	NC_021028	AAG	2	6	1472606	1472611	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480537101
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30036	NC_021028	ACCC	2	8	1472768	1472775	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
30037	NC_021028	CAAA	2	8	1472781	1472788	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
30038	NC_021028	CTC	2	6	1472794	1472799	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30039	NC_021028	TC	3	6	1472805	1472810	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
30040	NC_021028	TAT	2	6	1472916	1472921	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30041	NC_021028	TTA	2	6	1472972	1472977	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30042	NC_021028	TCT	2	6	1473009	1473014	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30043	NC_021028	AAAAT	2	10	1473017	1473026	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
30044	NC_021028	CTG	2	6	1473043	1473048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30045	NC_021028	T	6	6	1473091	1473096	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30046	NC_021028	TCC	2	6	1473152	1473157	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30047	NC_021028	T	6	6	1473188	1473193	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30048	NC_021028	TGCCA	2	10	1473323	1473332	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
30049	NC_021028	TAG	2	6	1473334	1473339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30050	NC_021028	ATCT	2	8	1473353	1473360	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
30051	NC_021028	AGG	2	6	1473365	1473370	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30052	NC_021028	AAT	2	6	1473420	1473425	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30053	NC_021028	TTA	2	6	1473471	1473476	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30054	NC_021028	GCC	2	6	1473494	1473499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
30055	NC_021028	TCC	2	6	1473645	1473650	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30056	NC_021028	CAA	2	6	1473728	1473733	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30057	NC_021028	AGC	2	6	1473758	1473763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30058	NC_021028	CTG	2	6	1473875	1473880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30059	NC_021028	TC	3	6	1473940	1473945	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
30060	NC_021028	CAT	2	6	1473995	1474000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30061	NC_021028	CCAA	2	8	1474055	1474062	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
30062	NC_021028	AACC	3	12	1474082	1474093	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
30063	NC_021028	GA	3	6	1474111	1474116	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30064	NC_021028	GAC	2	6	1474144	1474149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30065	NC_021028	ATC	2	6	1474163	1474168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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30067	NC_021028	AAT	2	6	1474225	1474230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30068	NC_021028	AGG	2	6	1474271	1474276	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30069	NC_021028	AATA	2	8	1474350	1474357	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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30072	NC_021028	CTT	2	6	1474396	1474401	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30073	NC_021028	T	6	6	1474413	1474418	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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30079	NC_021028	ATC	2	6	1474916	1474921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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30082	NC_021028	GCTG	2	8	1475047	1475054	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
30083	NC_021028	TGC	2	6	1475121	1475126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30084	NC_021028	TC	3	6	1475154	1475159	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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30091	NC_021028	GTA	2	6	1475489	1475494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480537102
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30093	NC_021028	TCG	2	6	1475517	1475522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480537102
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30098	NC_021028	TCA	3	9	1475784	1475792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480537102
30099	NC_021028	ACG	2	6	1475825	1475830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480537102
30100	NC_021028	TCA	2	6	1475847	1475852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480537102
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30109	NC_021028	AAAGG	2	10	1476262	1476271	60 %	0 %	40 %	0 %	480537103
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30123	NC_021028	ATA	2	6	1476645	1476650	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30124	NC_021028	T	6	6	1476674	1476679	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30125	NC_021028	TTC	2	6	1476707	1476712	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480537104
30126	NC_021028	TTC	2	6	1476723	1476728	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480537104
30127	NC_021028	TCC	2	6	1476749	1476754	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480537104
30128	NC_021028	ATA	2	6	1476756	1476761	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480537104
30129	NC_021028	C	6	6	1476770	1476775	0 %	0 %	0 %	100 %	480537104
30130	NC_021028	GAATG	2	10	1476788	1476797	40 %	20 %	40 %	0 %	480537104
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30139	NC_021028	T	6	6	1477097	1477102	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30140	NC_021028	T	7	7	1477104	1477110	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30141	NC_021028	A	7	7	1477139	1477145	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30142	NC_021028	TAAAA	2	10	1477162	1477171	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
30143	NC_021028	AAATA	3	15	1477186	1477200	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
30144	NC_021028	TAATA	2	10	1477201	1477210	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
30145	NC_021028	TA	3	6	1477233	1477238	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30146	NC_021028	TTG	2	6	1477245	1477250	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30147	NC_021028	TAC	2	6	1477308	1477313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30148	NC_021028	TTG	2	6	1477343	1477348	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30149	NC_021028	ATAA	2	8	1477382	1477389	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
30150	NC_021028	A	6	6	1477388	1477393	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30151	NC_021028	CAT	2	6	1477396	1477401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30152	NC_021028	TCT	2	6	1477461	1477466	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30153	NC_021028	TCT	2	6	1477540	1477545	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480537105
30154	NC_021028	CTG	2	6	1477592	1477597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480537105
30155	NC_021028	TTG	2	6	1477598	1477603	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480537105
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30159	NC_021028	TCT	2	6	1477960	1477965	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480537105
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30200	NC_021028	GAC	2	6	1480169	1480174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480537105
30201	NC_021028	ATA	2	6	1480306	1480311	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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30203	NC_021028	TC	4	8	1480387	1480394	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
30204	NC_021028	TTC	2	6	1480647	1480652	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30205	NC_021028	CTT	2	6	1480684	1480689	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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30207	NC_021028	TTC	3	9	1480836	1480844	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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30213	NC_021028	TTC	2	6	1481031	1481036	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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30215	NC_021028	CTT	2	6	1481105	1481110	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30216	NC_021028	CAA	2	6	1481112	1481117	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30217	NC_021028	TGA	2	6	1481140	1481145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30218	NC_021028	GCC	2	6	1481170	1481175	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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30223	NC_021028	CTT	2	6	1481351	1481356	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30224	NC_021028	ATG	2	6	1481408	1481413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30225	NC_021028	ACTT	2	8	1481434	1481441	25 %	50 %	0 %	25 %	480537106
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30229	NC_021028	TCAA	2	8	1481604	1481611	50 %	25 %	0 %	25 %	480537106
30230	NC_021028	TCC	2	6	1481739	1481744	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480537106
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30232	NC_021028	CTG	2	6	1481801	1481806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480537106
30233	NC_021028	TTC	2	6	1481828	1481833	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480537106
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30235	NC_021028	ATTG	2	8	1481875	1481882	25 %	50 %	25 %	0 %	480537106
30236	NC_021028	GA	3	6	1481948	1481953	50 %	0 %	50 %	0 %	480537106
30237	NC_021028	AAT	2	6	1481983	1481988	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480537106
30238	NC_021028	TAA	2	6	1481996	1482001	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480537106
30239	NC_021028	ACTC	2	8	1482013	1482020	25 %	25 %	0 %	50 %	480537106
30240	NC_021028	ACT	2	6	1482035	1482040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480537106
30241	NC_021028	CAAG	2	8	1482045	1482052	50 %	0 %	25 %	25 %	480537106
30242	NC_021028	TGA	2	6	1482090	1482095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480537106
30243	NC_021028	A	6	6	1482114	1482119	100 %	0 %	0 %	0 %	480537106
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30365	NC_021028	TCT	2	6	1488171	1488176	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480537114
30366	NC_021028	ATC	2	6	1488222	1488227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480537114
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30385	NC_021028	AGT	2	6	1489517	1489522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480537115
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30482	NC_021028	CAT	2	6	1494927	1494932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480537119
30483	NC_021028	TTC	2	6	1494961	1494966	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480537119
30484	NC_021028	CCA	2	6	1495044	1495049	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480537119
30485	NC_021028	CAG	2	6	1495053	1495058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480537119
30486	NC_021028	AAG	2	6	1495177	1495182	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480537119
30487	NC_021028	AACCA	2	10	1495198	1495207	60 %	0 %	0 %	40 %	480537119
30488	NC_021028	CCT	2	6	1495260	1495265	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30489	NC_021028	TTAGA	2	10	1495267	1495276	40 %	40 %	20 %	0 %	480537120
30490	NC_021028	GCA	2	6	1495306	1495311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480537120
30491	NC_021028	TCT	2	6	1495333	1495338	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480537120
30492	NC_021028	GAAC	2	8	1495360	1495367	50 %	0 %	25 %	25 %	480537120
30493	NC_021028	CTT	2	6	1495403	1495408	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480537120
30494	NC_021028	TGA	2	6	1495409	1495414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480537120
30495	NC_021028	AAG	2	6	1495528	1495533	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480537120
30496	NC_021028	ACC	2	6	1495557	1495562	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480537120
30497	NC_021028	TCC	2	6	1495590	1495595	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480537120
30498	NC_021028	TCA	2	6	1495606	1495611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480537120
30499	NC_021028	TCT	2	6	1495633	1495638	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480537120
30500	NC_021028	CCA	2	6	1495639	1495644	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480537120

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