MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pneumoniae SPN034183 draft genome

Total Repeats: 41473

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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27502	NC_021028	ATCG	2	8	1345552	1345559	25 %	25 %	25 %	25 %	480536986
27503	NC_021028	AATA	2	8	1345752	1345759	75 %	25 %	0 %	0 %	480536986
27504	NC_021028	CAA	2	6	1345783	1345788	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480536986
27505	NC_021028	GAT	2	6	1345834	1345839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536986
27506	NC_021028	TTC	2	6	1345852	1345857	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480536986
27507	NC_021028	TCC	2	6	1345867	1345872	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
27508	NC_021028	TCT	2	6	1345877	1345882	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27509	NC_021028	TATT	2	8	1345892	1345899	25 %	75 %	0 %	0 %	480536987
27510	NC_021028	ATA	2	6	1345902	1345907	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480536987
27511	NC_021028	AAAG	2	8	1345928	1345935	75 %	0 %	25 %	0 %	480536987
27512	NC_021028	TCA	2	6	1346026	1346031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536987
27513	NC_021028	TAAAA	2	10	1346110	1346119	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
27514	NC_021028	TACT	2	8	1346122	1346129	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
27515	NC_021028	AAATTT	2	12	1346143	1346154	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27516	NC_021028	TAA	2	6	1346184	1346189	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27517	NC_021028	ATT	2	6	1346192	1346197	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27518	NC_021028	TCAAGT	2	12	1346214	1346225	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
27519	NC_021028	TCT	2	6	1346240	1346245	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27520	NC_021028	T	6	6	1346269	1346274	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27521	NC_021028	GTT	2	6	1346281	1346286	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27522	NC_021028	CTT	2	6	1346310	1346315	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27523	NC_021028	TGT	2	6	1346364	1346369	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27524	NC_021028	ATA	2	6	1346413	1346418	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27525	NC_021028	CTC	2	6	1346425	1346430	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
27526	NC_021028	TGT	2	6	1346495	1346500	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27527	NC_021028	ACC	2	6	1346528	1346533	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
27528	NC_021028	AATC	2	8	1346551	1346558	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
27529	NC_021028	GAT	2	6	1346560	1346565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27530	NC_021028	CAAG	2	8	1346595	1346602	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
27531	NC_021028	AGT	2	6	1346604	1346609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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27533	NC_021028	CTTTTC	2	12	1346742	1346753	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27534	NC_021028	TGCT	2	8	1346771	1346778	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
27535	NC_021028	ATG	2	6	1346794	1346799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27536	NC_021028	CAT	2	6	1346851	1346856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27537	NC_021028	ATT	2	6	1346943	1346948	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27538	NC_021028	GAG	2	6	1347053	1347058	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27539	NC_021028	AG	3	6	1347070	1347075	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
27540	NC_021028	CTT	2	6	1347098	1347103	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27541	NC_021028	T	6	6	1347102	1347107	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27542	NC_021028	GTA	2	6	1347157	1347162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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27546	NC_021028	AG	3	6	1347387	1347392	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
27547	NC_021028	TAAA	2	8	1347402	1347409	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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27550	NC_021028	CT	3	6	1347591	1347596	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
27551	NC_021028	TAT	2	6	1347600	1347605	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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27556	NC_021028	CTCTT	2	10	1347942	1347951	0 %	60 %	0 %	40 %	480536988
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27558	NC_021028	CATA	2	8	1348237	1348244	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
27559	NC_021028	GAGT	2	8	1348305	1348312	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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27606	NC_021028	T	6	6	1350639	1350644	0 %	100 %	0 %	0 %	480536991
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27612	NC_021028	AGAC	2	8	1350852	1350859	50 %	0 %	25 %	25 %	480536991
27613	NC_021028	ACC	2	6	1350876	1350881	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480536991
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27622	NC_021028	CTTG	2	8	1351111	1351118	0 %	50 %	25 %	25 %	480536991
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27624	NC_021028	TCT	2	6	1351200	1351205	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480536992
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27629	NC_021028	CTAG	2	8	1351437	1351444	25 %	25 %	25 %	25 %	480536992
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27687	NC_021028	CTG	2	6	1354414	1354419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480536995
27688	NC_021028	TTCT	2	8	1354433	1354440	0 %	75 %	0 %	25 %	480536995
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27722	NC_021028	A	6	6	1356562	1356567	100 %	0 %	0 %	0 %	480536995
27723	NC_021028	ATC	2	6	1356572	1356577	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536995
27724	NC_021028	TTC	3	9	1356596	1356604	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480536995
27725	NC_021028	TGA	2	6	1356640	1356645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536995
27726	NC_021028	TAT	2	6	1356740	1356745	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27727	NC_021028	CTT	2	6	1356846	1356851	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480536996
27728	NC_021028	CTTC	2	8	1356896	1356903	0 %	50 %	0 %	50 %	480536996
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27733	NC_021028	ATT	2	6	1357180	1357185	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480536996
27734	NC_021028	T	6	6	1357247	1357252	0 %	100 %	0 %	0 %	480536996
27735	NC_021028	TCT	2	6	1357422	1357427	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480536996
27736	NC_021028	CTT	2	6	1357434	1357439	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480536996
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27977	NC_021028	TCT	2	6	1370096	1370101	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480537007
27978	NC_021028	T	6	6	1370101	1370106	0 %	100 %	0 %	0 %	480537007
27979	NC_021028	TCCAG	2	10	1370124	1370133	20 %	20 %	20 %	40 %	480537007
27980	NC_021028	TCG	2	6	1370145	1370150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480537007
27981	NC_021028	TCC	2	6	1370221	1370226	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480537007
27982	NC_021028	CAA	2	6	1370387	1370392	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480537007
27983	NC_021028	ACA	2	6	1370480	1370485	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480537008
27984	NC_021028	CAG	2	6	1370520	1370525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480537008
27985	NC_021028	TCA	2	6	1370555	1370560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480537008
27986	NC_021028	CGG	2	6	1370585	1370590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	480537008
27987	NC_021028	AGGTG	2	10	1370594	1370603	20 %	20 %	60 %	0 %	480537008
27988	NC_021028	ACC	2	6	1370647	1370652	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480537008
27989	NC_021028	TTTC	2	8	1370661	1370668	0 %	75 %	0 %	25 %	480537008
27990	NC_021028	AGGT	2	8	1370677	1370684	25 %	25 %	50 %	0 %	480537008
27991	NC_021028	CAC	2	6	1370751	1370756	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480537008
27992	NC_021028	CCAGTT	2	12	1370825	1370836	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	480537008
27993	NC_021028	ATA	2	6	1370867	1370872	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480537008
27994	NC_021028	CAT	2	6	1370889	1370894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480537008
27995	NC_021028	TACCA	2	10	1371052	1371061	40 %	20 %	0 %	40 %	480537008
27996	NC_021028	TCT	3	9	1371089	1371097	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480537008
27997	NC_021028	GA	3	6	1371338	1371343	50 %	0 %	50 %	0 %	480537008
27998	NC_021028	GCAAGT	2	12	1371351	1371362	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	480537008
27999	NC_021028	GATA	2	8	1371393	1371400	50 %	25 %	25 %	0 %	480537008
28000	NC_021028	TCT	2	6	1371401	1371406	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480537008

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