MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pneumoniae SPN034183 draft genome

Total Repeats: 41473

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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25002	NC_021028	CTG	2	6	1222070	1222075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480536873
25003	NC_021028	CAT	2	6	1222118	1222123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536873
25004	NC_021028	TTTC	2	8	1222271	1222278	0 %	75 %	0 %	25 %	480536873
25005	NC_021028	T	6	6	1222284	1222289	0 %	100 %	0 %	0 %	480536873
25006	NC_021028	GA	3	6	1222305	1222310	50 %	0 %	50 %	0 %	480536873
25007	NC_021028	T	6	6	1222422	1222427	0 %	100 %	0 %	0 %	480536873
25008	NC_021028	ATA	2	6	1222449	1222454	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480536873
25009	NC_021028	CAAATC	2	12	1222491	1222502	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	480536873
25010	NC_021028	CTG	2	6	1222503	1222508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480536873
25011	NC_021028	GGT	2	6	1222524	1222529	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480536873
25012	NC_021028	TAA	2	6	1222547	1222552	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480536873
25013	NC_021028	CAA	2	6	1222565	1222570	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480536873
25014	NC_021028	A	6	6	1222659	1222664	100 %	0 %	0 %	0 %	480536873
25015	NC_021028	GTC	3	9	1222671	1222679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480536873
25016	NC_021028	ATT	2	6	1222824	1222829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480536873
25017	NC_021028	ATT	2	6	1222831	1222836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480536873
25018	NC_021028	TATCG	2	10	1222842	1222851	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
25019	NC_021028	A	6	6	1222897	1222902	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25020	NC_021028	AAC	2	6	1222977	1222982	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25021	NC_021028	TAGGTA	2	12	1223001	1223012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25022	NC_021028	AGC	2	6	1223057	1223062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25023	NC_021028	TAT	2	6	1223104	1223109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25024	NC_021028	GAGC	2	8	1223128	1223135	25 %	0 %	50 %	25 %	480536874
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25027	NC_021028	T	6	6	1223241	1223246	0 %	100 %	0 %	0 %	480536874
25028	NC_021028	TCCA	2	8	1223249	1223256	25 %	25 %	0 %	50 %	480536874
25029	NC_021028	AGG	2	6	1223277	1223282	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480536874
25030	NC_021028	GTTG	2	8	1223297	1223304	0 %	50 %	50 %	0 %	480536874
25031	NC_021028	TTG	2	6	1223393	1223398	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480536874
25032	NC_021028	TCA	4	12	1223427	1223438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536874
25033	NC_021028	CTG	2	6	1223477	1223482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480536874
25034	NC_021028	ATC	2	6	1223534	1223539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536874
25035	NC_021028	GTA	2	6	1223660	1223665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536874
25036	NC_021028	TCTG	2	8	1223769	1223776	0 %	50 %	25 %	25 %	480536874
25037	NC_021028	TA	3	6	1223810	1223815	50 %	50 %	0 %	0 %	480536874
25038	NC_021028	ATA	2	6	1223883	1223888	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480536874
25039	NC_021028	CAG	2	6	1224010	1224015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480536874
25040	NC_021028	CA	3	6	1224074	1224079	50 %	0 %	0 %	50 %	480536874
25041	NC_021028	A	6	6	1224091	1224096	100 %	0 %	0 %	0 %	480536874
25042	NC_021028	TCTTT	2	10	1224131	1224140	0 %	80 %	0 %	20 %	480536874
25043	NC_021028	T	6	6	1224138	1224143	0 %	100 %	0 %	0 %	480536874
25044	NC_021028	AG	3	6	1224152	1224157	50 %	0 %	50 %	0 %	480536874
25045	NC_021028	CTCTT	2	10	1224215	1224224	0 %	60 %	0 %	40 %	480536874
25046	NC_021028	CTA	2	6	1224243	1224248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536874
25047	NC_021028	T	7	7	1224294	1224300	0 %	100 %	0 %	0 %	480536874
25048	NC_021028	CT	3	6	1224301	1224306	0 %	50 %	0 %	50 %	480536874
25049	NC_021028	T	6	6	1224324	1224329	0 %	100 %	0 %	0 %	480536874
25050	NC_021028	AAT	2	6	1224334	1224339	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480536874
25051	NC_021028	ATG	2	6	1224356	1224361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536874
25052	NC_021028	TCT	2	6	1224385	1224390	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480536874
25053	NC_021028	ATAGG	2	10	1224419	1224428	40 %	20 %	40 %	0 %	480536875
25054	NC_021028	GAC	2	6	1224552	1224557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480536875
25055	NC_021028	GTCAA	2	10	1224569	1224578	40 %	20 %	20 %	20 %	480536875
25056	NC_021028	TTC	2	6	1224772	1224777	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480536875
25057	NC_021028	TGC	2	6	1224799	1224804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480536875
25058	NC_021028	TTTC	2	8	1224901	1224908	0 %	75 %	0 %	25 %	480536875
25059	NC_021028	A	6	6	1224933	1224938	100 %	0 %	0 %	0 %	480536875
25060	NC_021028	ACC	2	6	1224965	1224970	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480536875
25061	NC_021028	CTG	2	6	1224976	1224981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480536875
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25064	NC_021028	TGA	2	6	1225122	1225127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536875
25065	NC_021028	GTG	2	6	1225186	1225191	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480536875
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25067	NC_021028	CTA	2	6	1225328	1225333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536876
25068	NC_021028	TTC	2	6	1225335	1225340	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480536876
25069	NC_021028	TAT	2	6	1225346	1225351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480536876
25070	NC_021028	GTAG	2	8	1225394	1225401	25 %	25 %	50 %	0 %	480536876
25071	NC_021028	CTC	3	9	1225481	1225489	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480536876
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25075	NC_021028	TAA	2	6	1225686	1225691	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480536876
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25082	NC_021028	CTTGGG	2	12	1226004	1226015	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	480536877
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25087	NC_021028	AAT	2	6	1226182	1226187	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480536877
25088	NC_021028	GCA	2	6	1226220	1226225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480536877
25089	NC_021028	ACC	2	6	1226297	1226302	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480536877
25090	NC_021028	CTGTC	2	10	1226305	1226314	0 %	40 %	20 %	40 %	480536877
25091	NC_021028	ACC	2	6	1226365	1226370	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480536877
25092	NC_021028	TTG	2	6	1226374	1226379	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480536877
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25099	NC_021028	TAA	2	6	1226772	1226777	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480536877
25100	NC_021028	TAC	2	6	1226940	1226945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536877
25101	NC_021028	TGTT	2	8	1226961	1226968	0 %	75 %	25 %	0 %	480536877
25102	NC_021028	TTCTT	2	10	1227063	1227072	0 %	80 %	0 %	20 %	480536878
25103	NC_021028	T	6	6	1227106	1227111	0 %	100 %	0 %	0 %	480536878
25104	NC_021028	TTG	3	9	1227137	1227145	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480536878
25105	NC_021028	CTGT	2	8	1227238	1227245	0 %	50 %	25 %	25 %	480536878
25106	NC_021028	TTGC	2	8	1227294	1227301	0 %	50 %	25 %	25 %	480536878
25107	NC_021028	CTG	2	6	1227310	1227315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480536878
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25109	NC_021028	TTC	2	6	1227411	1227416	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25110	NC_021028	GAC	2	6	1227429	1227434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480536879
25111	NC_021028	T	6	6	1227448	1227453	0 %	100 %	0 %	0 %	480536879
25112	NC_021028	TCT	2	6	1227601	1227606	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480536879
25113	NC_021028	TCA	2	6	1227607	1227612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536879
25114	NC_021028	CAC	3	9	1227647	1227655	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480536879
25115	NC_021028	GTT	2	6	1227680	1227685	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480536879
25116	NC_021028	A	6	6	1227699	1227704	100 %	0 %	0 %	0 %	480536879
25117	NC_021028	ACC	2	6	1227867	1227872	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480536879
25118	NC_021028	ATA	2	6	1228089	1228094	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480536879
25119	NC_021028	AGC	2	6	1228125	1228130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480536879
25120	NC_021028	ATGGG	2	10	1228153	1228162	20 %	20 %	60 %	0 %	480536879
25121	NC_021028	GCCA	2	8	1228185	1228192	25 %	0 %	25 %	50 %	480536879
25122	NC_021028	CCG	2	6	1228202	1228207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	480536879
25123	NC_021028	ATA	2	6	1228246	1228251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480536879
25124	NC_021028	GTTT	2	8	1228300	1228307	0 %	75 %	25 %	0 %	480536879
25125	NC_021028	ATC	2	6	1228359	1228364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536879
25126	NC_021028	CTT	2	6	1228385	1228390	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480536879
25127	NC_021028	TC	3	6	1228402	1228407	0 %	50 %	0 %	50 %	480536879
25128	NC_021028	GAT	2	6	1228448	1228453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536879
25129	NC_021028	CTT	2	6	1228571	1228576	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480536880
25130	NC_021028	TGA	2	6	1228596	1228601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536880
25131	NC_021028	TC	3	6	1228689	1228694	0 %	50 %	0 %	50 %	480536880
25132	NC_021028	AAC	2	6	1228782	1228787	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480536880
25133	NC_021028	ACC	2	6	1228809	1228814	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480536880
25134	NC_021028	ACC	2	6	1228821	1228826	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480536880
25135	NC_021028	ATT	2	6	1228830	1228835	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480536880
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25145	NC_021028	TCC	2	6	1229425	1229430	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480536880
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25148	NC_021028	TGA	2	6	1229468	1229473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536880
25149	NC_021028	CATA	2	8	1229474	1229481	50 %	25 %	0 %	25 %	480536880
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25173	NC_021028	AG	4	8	1230632	1230639	50 %	0 %	50 %	0 %	480536881
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25177	NC_021028	CTG	2	6	1230908	1230913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480536882
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25181	NC_021028	TGG	2	6	1231046	1231051	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480536882
25182	NC_021028	CTTG	2	8	1231081	1231088	0 %	50 %	25 %	25 %	480536882
25183	NC_021028	CA	3	6	1231112	1231117	50 %	0 %	0 %	50 %	480536882
25184	NC_021028	T	6	6	1231169	1231174	0 %	100 %	0 %	0 %	480536882
25185	NC_021028	GAAC	2	8	1231186	1231193	50 %	0 %	25 %	25 %	480536882
25186	NC_021028	CTGA	2	8	1231206	1231213	25 %	25 %	25 %	25 %	480536882
25187	NC_021028	GATT	2	8	1231239	1231246	25 %	50 %	25 %	0 %	480536882
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25192	NC_021028	TAT	2	6	1231334	1231339	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480536882
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25197	NC_021028	GCTA	2	8	1231675	1231682	25 %	25 %	25 %	25 %	480536883
25198	NC_021028	GA	3	6	1231761	1231766	50 %	0 %	50 %	0 %	480536883
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25201	NC_021028	CTT	2	6	1232199	1232204	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480536883
25202	NC_021028	ATG	2	6	1232231	1232236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536883
25203	NC_021028	CCT	2	6	1232274	1232279	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480536883
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25205	NC_021028	TAC	2	6	1232351	1232356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536884
25206	NC_021028	T	6	6	1232364	1232369	0 %	100 %	0 %	0 %	480536884
25207	NC_021028	CTG	2	6	1232384	1232389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480536884
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25224	NC_021028	TCCT	2	8	1233348	1233355	0 %	50 %	0 %	50 %	480536884
25225	NC_021028	CTT	2	6	1233438	1233443	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480536884
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25228	NC_021028	T	6	6	1233531	1233536	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25229	NC_021028	CTT	2	6	1233540	1233545	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25230	NC_021028	A	6	6	1233548	1233553	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25231	NC_021028	A	6	6	1233607	1233612	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25232	NC_021028	GGA	2	6	1233627	1233632	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25233	NC_021028	AG	3	6	1233707	1233712	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25234	NC_021028	TGTC	2	8	1233730	1233737	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
25235	NC_021028	GTA	2	6	1233754	1233759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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25237	NC_021028	GAA	2	6	1233770	1233775	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25238	NC_021028	AATA	2	8	1233852	1233859	75 %	25 %	0 %	0 %	480536885
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25372	NC_021028	GCA	2	6	1241519	1241524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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25478	NC_021028	TAC	2	6	1247609	1247614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25479	NC_021028	AAAG	2	8	1247676	1247683	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
25480	NC_021028	CCCAAG	2	12	1247692	1247703	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
25481	NC_021028	AGCAAC	2	12	1247764	1247775	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
25482	NC_021028	TAA	2	6	1247780	1247785	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25483	NC_021028	TCT	2	6	1247804	1247809	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25484	NC_021028	T	6	6	1247832	1247837	0 %	100 %	0 %	0 %	480536896
25485	NC_021028	CCTT	2	8	1247932	1247939	0 %	50 %	0 %	50 %	480536896
25486	NC_021028	ATC	2	6	1247976	1247981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536896
25487	NC_021028	CAA	2	6	1248047	1248052	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480536896
25488	NC_021028	C	6	6	1248164	1248169	0 %	0 %	0 %	100 %	480536896
25489	NC_021028	CAT	2	6	1248200	1248205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536896
25490	NC_021028	TGTC	2	8	1248236	1248243	0 %	50 %	25 %	25 %	480536896
25491	NC_021028	CTGG	2	8	1248335	1248342	0 %	25 %	50 %	25 %	480536896
25492	NC_021028	CAAT	2	8	1248383	1248390	50 %	25 %	0 %	25 %	480536896
25493	NC_021028	ACC	2	6	1248462	1248467	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480536896
25494	NC_021028	GCCA	2	8	1248474	1248481	25 %	0 %	25 %	50 %	480536896
25495	NC_021028	GTATT	2	10	1248496	1248505	20 %	60 %	20 %	0 %	480536896
25496	NC_021028	AAT	2	6	1248508	1248513	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480536896
25497	NC_021028	GA	3	6	1248611	1248616	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25498	NC_021028	AAG	2	6	1248635	1248640	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25499	NC_021028	A	8	8	1248642	1248649	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25500	NC_021028	GAA	2	6	1248686	1248691	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536897

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