MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pneumoniae SPN034183 draft genome

Total Repeats: 41473

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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24005	NC_021028	T	7	7	1176403	1176409	0 %	100 %	0 %	0 %	480536828
24006	NC_021028	ATT	2	6	1176419	1176424	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480536828
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24013	NC_021028	ATAC	2	8	1176804	1176811	50 %	25 %	0 %	25 %	480536829
24014	NC_021028	TCA	2	6	1176886	1176891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536829
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24016	NC_021028	CT	3	6	1176983	1176988	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24017	NC_021028	GTTTT	2	10	1177071	1177080	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
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24019	NC_021028	CTATA	2	10	1177087	1177096	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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24033	NC_021028	T	7	7	1177637	1177643	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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24114	NC_021028	A	6	6	1181723	1181728	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24115	NC_021028	T	7	7	1181744	1181750	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24116	NC_021028	AAT	2	6	1181877	1181882	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24117	NC_021028	TTC	2	6	1182141	1182146	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480536835
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24119	NC_021028	G	8	8	1182189	1182196	0 %	0 %	100 %	0 %	480536835
24120	NC_021028	CTG	2	6	1182203	1182208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480536835
24121	NC_021028	TTG	2	6	1182248	1182253	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480536835
24122	NC_021028	CCA	2	6	1182301	1182306	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480536835
24123	NC_021028	ATC	2	6	1182325	1182330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536835
24124	NC_021028	GTT	2	6	1182415	1182420	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480536835
24125	NC_021028	TGC	2	6	1182432	1182437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480536835
24126	NC_021028	AAAAGG	2	12	1182450	1182461	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536835
24127	NC_021028	CATTC	2	10	1182474	1182483	20 %	40 %	0 %	40 %	480536835
24128	NC_021028	GGT	2	6	1182499	1182504	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480536835
24129	NC_021028	CTTGG	2	10	1182523	1182532	0 %	40 %	40 %	20 %	480536835
24130	NC_021028	GGT	2	6	1182601	1182606	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480536835
24131	NC_021028	CCTT	2	8	1182794	1182801	0 %	50 %	0 %	50 %	480536835
24132	NC_021028	TGG	2	6	1182963	1182968	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480536835
24133	NC_021028	TCA	2	6	1183058	1183063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536835
24134	NC_021028	CTTGGA	2	12	1183084	1183095	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	480536835
24135	NC_021028	ATC	2	6	1183159	1183164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536835
24136	NC_021028	ATA	2	6	1183254	1183259	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24137	NC_021028	ATT	2	6	1183276	1183281	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24138	NC_021028	A	6	6	1183288	1183293	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24139	NC_021028	TCA	2	6	1183363	1183368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24140	NC_021028	TCT	2	6	1183406	1183411	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480536836
24141	NC_021028	TTC	2	6	1183417	1183422	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480536836
24142	NC_021028	CCA	2	6	1183489	1183494	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480536836
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24145	NC_021028	TCC	2	6	1183593	1183598	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480536836
24146	NC_021028	TCA	2	6	1183649	1183654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536836
24147	NC_021028	TGA	2	6	1183715	1183720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536836
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24152	NC_021028	TTG	2	6	1183888	1183893	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480536836
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24157	NC_021028	ACAG	2	8	1184179	1184186	50 %	0 %	25 %	25 %	480536836
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24173	NC_021028	ATG	3	9	1184653	1184661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536836
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24179	NC_021028	TTC	2	6	1184969	1184974	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24180	NC_021028	TAT	2	6	1184986	1184991	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480536837
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24187	NC_021028	T	6	6	1185295	1185300	0 %	100 %	0 %	0 %	480536837
24188	NC_021028	TAT	2	6	1185317	1185322	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24189	NC_021028	A	6	6	1185326	1185331	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24190	NC_021028	AGCT	2	8	1185466	1185473	25 %	25 %	25 %	25 %	480536838
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24198	NC_021028	AAT	2	6	1185897	1185902	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480536839
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24201	NC_021028	TC	3	6	1186009	1186014	0 %	50 %	0 %	50 %	480536839
24202	NC_021028	ACG	2	6	1186040	1186045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480536839
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24206	NC_021028	GCT	2	6	1186116	1186121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480536839
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24208	NC_021028	TAA	2	6	1186304	1186309	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480536839
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24213	NC_021028	TGAC	2	8	1186669	1186676	25 %	25 %	25 %	25 %	480536839
24214	NC_021028	GAT	2	6	1186689	1186694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536839
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24219	NC_021028	CT	3	6	1186986	1186991	0 %	50 %	0 %	50 %	480536839
24220	NC_021028	TTGA	2	8	1187115	1187122	25 %	50 %	25 %	0 %	480536839
24221	NC_021028	AGA	2	6	1187152	1187157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536839
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24224	NC_021028	GAC	2	6	1187328	1187333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480536840
24225	NC_021028	GA	3	6	1187342	1187347	50 %	0 %	50 %	0 %	480536840
24226	NC_021028	CATG	2	8	1187483	1187490	25 %	25 %	25 %	25 %	480536840
24227	NC_021028	TCT	2	6	1187575	1187580	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480536840
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24229	NC_021028	TGGC	2	8	1187599	1187606	0 %	25 %	50 %	25 %	480536840
24230	NC_021028	TGC	2	6	1187654	1187659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480536840
24231	NC_021028	A	6	6	1187665	1187670	100 %	0 %	0 %	0 %	480536840
24232	NC_021028	ACT	2	6	1187692	1187697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536840
24233	NC_021028	CAA	2	6	1187702	1187707	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480536840
24234	NC_021028	GAA	2	6	1187823	1187828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536840
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24236	NC_021028	ACC	2	6	1187913	1187918	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480536840
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24340	NC_021028	A	8	8	1192765	1192772	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24341	NC_021028	T	6	6	1192811	1192816	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24342	NC_021028	A	8	8	1192827	1192834	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24343	NC_021028	TAA	2	6	1192855	1192860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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24354	NC_021028	GGTTT	2	10	1193528	1193537	0 %	60 %	40 %	0 %	480536848
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24485	NC_021028	TCAA	2	8	1199272	1199279	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
24486	NC_021028	C	6	6	1199294	1199299	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
24487	NC_021028	CTT	2	6	1199510	1199515	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480536851
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24489	NC_021028	TCC	2	6	1199530	1199535	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24490	NC_021028	CT	3	6	1199579	1199584	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24491	NC_021028	CAG	2	6	1199586	1199591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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