MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pneumoniae SPN034183 draft genome

Total Repeats: 41473

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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17502	NC_021028	AAC	2	6	861955	861960	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480536561
17503	NC_021028	ATA	2	6	861969	861974	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480536561
17504	NC_021028	GAA	2	6	861977	861982	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536561
17505	NC_021028	AAGA	2	8	861990	861997	75 %	0 %	25 %	0 %	480536561
17506	NC_021028	ATT	2	6	862012	862017	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480536562
17507	NC_021028	AG	3	6	862029	862034	50 %	0 %	50 %	0 %	480536562
17508	NC_021028	TGG	2	6	862071	862076	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480536562
17509	NC_021028	GCTT	2	8	862103	862110	0 %	50 %	25 %	25 %	480536562
17510	NC_021028	CTC	2	6	862145	862150	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480536562
17511	NC_021028	TTG	2	6	862192	862197	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480536562
17512	NC_021028	AGA	2	6	862317	862322	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536562
17513	NC_021028	TCG	2	6	862326	862331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480536562
17514	NC_021028	GAA	2	6	862350	862355	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536562
17515	NC_021028	CGA	2	6	862512	862517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480536562
17516	NC_021028	AGAA	2	8	862535	862542	75 %	0 %	25 %	0 %	480536562
17517	NC_021028	GCTG	2	8	862586	862593	0 %	25 %	50 %	25 %	480536563
17518	NC_021028	AAG	2	6	862606	862611	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536563
17519	NC_021028	ATC	2	6	862653	862658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536563
17520	NC_021028	TTGG	2	8	862828	862835	0 %	50 %	50 %	0 %	480536563
17521	NC_021028	AAG	2	6	862950	862955	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536563
17522	NC_021028	AAGA	2	8	862989	862996	75 %	0 %	25 %	0 %	480536563
17523	NC_021028	AAG	2	6	863023	863028	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536563
17524	NC_021028	ACA	3	9	863056	863064	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480536563
17525	NC_021028	GCCA	2	8	863081	863088	25 %	0 %	25 %	50 %	480536563
17526	NC_021028	TACC	2	8	863124	863131	25 %	25 %	0 %	50 %	480536563
17527	NC_021028	ATA	2	6	863137	863142	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480536563
17528	NC_021028	AGCG	2	8	863163	863170	25 %	0 %	50 %	25 %	480536563
17529	NC_021028	GC	3	6	863205	863210	0 %	0 %	50 %	50 %	480536563
17530	NC_021028	GAT	2	6	863294	863299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536563
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17532	NC_021028	GGT	2	6	863412	863417	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480536563
17533	NC_021028	GAT	2	6	863594	863599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536564
17534	NC_021028	TGA	2	6	863602	863607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536564
17535	NC_021028	GGA	2	6	863623	863628	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480536564
17536	NC_021028	TAA	2	6	863743	863748	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17537	NC_021028	AG	3	6	863766	863771	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17538	NC_021028	GAA	2	6	863871	863876	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17539	NC_021028	GAA	3	9	864075	864083	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17540	NC_021028	ATA	2	6	864094	864099	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17541	NC_021028	ATG	2	6	864163	864168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17542	NC_021028	GA	3	6	864292	864297	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17543	NC_021028	TTC	2	6	864307	864312	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17544	NC_021028	CCTTA	2	10	864339	864348	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
17545	NC_021028	ATG	2	6	864358	864363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17546	NC_021028	AAC	2	6	864392	864397	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17547	NC_021028	GGAC	2	8	864450	864457	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
17548	NC_021028	GAT	2	6	864462	864467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17549	NC_021028	CAT	2	6	864503	864508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17550	NC_021028	GAT	2	6	864551	864556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17551	NC_021028	TGAT	2	8	864610	864617	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
17552	NC_021028	CATC	2	8	864638	864645	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
17553	NC_021028	TGT	2	6	864692	864697	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17554	NC_021028	GA	3	6	864786	864791	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17555	NC_021028	TGA	2	6	864876	864881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17556	NC_021028	GAT	2	6	864941	864946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536565
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17559	NC_021028	TGA	2	6	865190	865195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536565
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17561	NC_021028	GTT	2	6	865410	865415	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480536565
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17566	NC_021028	GGC	2	6	865562	865567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17567	NC_021028	TCT	2	6	865627	865632	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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17569	NC_021028	ATA	2	6	865685	865690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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17571	NC_021028	A	6	6	865778	865783	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17572	NC_021028	TA	4	8	865823	865830	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17573	NC_021028	AAG	2	6	865833	865838	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17574	NC_021028	TA	3	6	865870	865875	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17575	NC_021028	TGA	2	6	866014	866019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17576	NC_021028	CTTTT	2	10	866055	866064	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
17577	NC_021028	GCCA	2	8	866206	866213	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
17578	NC_021028	TTTG	2	8	866414	866421	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
17579	NC_021028	CATCT	2	10	866424	866433	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
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17582	NC_021028	TGAA	2	8	866516	866523	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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17584	NC_021028	GA	3	6	866572	866577	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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17588	NC_021028	GAT	2	6	866664	866669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17589	NC_021028	ACC	2	6	866700	866705	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17590	NC_021028	CCA	2	6	866722	866727	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17591	NC_021028	GCTT	2	8	866728	866735	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
17592	NC_021028	CTCA	2	8	866781	866788	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
17593	NC_021028	GAG	2	6	866796	866801	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17594	NC_021028	TGT	2	6	866847	866852	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17595	NC_021028	TGC	2	6	866856	866861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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17597	NC_021028	GAAGA	2	10	866910	866919	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
17598	NC_021028	TCG	2	6	866923	866928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17599	NC_021028	CAAC	2	8	866972	866979	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
17600	NC_021028	CTG	2	6	866981	866986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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17602	NC_021028	ACTA	2	8	867099	867106	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
17603	NC_021028	ACCT	2	8	867190	867197	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
17604	NC_021028	T	6	6	867310	867315	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17605	NC_021028	TTGG	2	8	867345	867352	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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17609	NC_021028	GATT	2	8	867625	867632	25 %	50 %	25 %	0 %	480536566
17610	NC_021028	AAG	2	6	867641	867646	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536566
17611	NC_021028	AGCT	2	8	867723	867730	25 %	25 %	25 %	25 %	480536566
17612	NC_021028	AAAT	2	8	867919	867926	75 %	25 %	0 %	0 %	480536566
17613	NC_021028	T	6	6	867955	867960	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17614	NC_021028	AAT	2	6	867973	867978	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17615	NC_021028	AG	3	6	867982	867987	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17616	NC_021028	ATC	2	6	868032	868037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536567
17617	NC_021028	GCTT	2	8	868057	868064	0 %	50 %	25 %	25 %	480536567
17618	NC_021028	GAA	2	6	868182	868187	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536567
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17620	NC_021028	GTAG	2	8	868269	868276	25 %	25 %	50 %	0 %	480536567
17621	NC_021028	ATG	2	6	868285	868290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536567
17622	NC_021028	TGG	2	6	868304	868309	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480536567
17623	NC_021028	AGCA	2	8	868318	868325	50 %	0 %	25 %	25 %	480536567
17624	NC_021028	TGA	2	6	868361	868366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536567
17625	NC_021028	CTA	2	6	868384	868389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536567
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17994	NC_021028	TTA	2	6	886634	886639	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480536587
17995	NC_021028	GTG	2	6	886710	886715	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480536587
17996	NC_021028	CT	3	6	886751	886756	0 %	50 %	0 %	50 %	480536587
17997	NC_021028	TAT	2	6	886790	886795	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480536587
17998	NC_021028	GAA	2	6	886905	886910	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536587
17999	NC_021028	A	7	7	886916	886922	100 %	0 %	0 %	0 %	480536587
18000	NC_021028	TTC	2	6	887068	887073	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480536587

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