MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pneumoniae SPN034183 draft genome

Total Repeats: 41473

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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17002	NC_021028	CTA	2	6	837491	837496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536538
17003	NC_021028	TTGG	2	8	837705	837712	0 %	50 %	50 %	0 %	480536538
17004	NC_021028	AT	3	6	837773	837778	50 %	50 %	0 %	0 %	480536538
17005	NC_021028	AAG	2	6	837805	837810	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536538
17006	NC_021028	AGAA	2	8	837821	837828	75 %	0 %	25 %	0 %	480536538
17007	NC_021028	GAT	2	6	837843	837848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536538
17008	NC_021028	CTCC	2	8	837974	837981	0 %	25 %	0 %	75 %	480536538
17009	NC_021028	TTA	2	6	838018	838023	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480536538
17010	NC_021028	TGA	2	6	838085	838090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536539
17011	NC_021028	GAT	2	6	838097	838102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536539
17012	NC_021028	GGTA	2	8	838218	838225	25 %	25 %	50 %	0 %	480536539
17013	NC_021028	GAT	2	6	838267	838272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536539
17014	NC_021028	T	6	6	838312	838317	0 %	100 %	0 %	0 %	480536539
17015	NC_021028	AGAA	2	8	838399	838406	75 %	0 %	25 %	0 %	480536539
17016	NC_021028	TCTT	2	8	838430	838437	0 %	75 %	0 %	25 %	480536539
17017	NC_021028	TGA	2	6	838482	838487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536539
17018	NC_021028	TAT	2	6	838635	838640	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17019	NC_021028	AGTG	2	8	838648	838655	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
17020	NC_021028	GGA	2	6	838894	838899	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17021	NC_021028	ATATA	2	10	838969	838978	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
17022	NC_021028	GAT	2	6	839158	839163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536540
17023	NC_021028	AATGA	2	10	839173	839182	60 %	20 %	20 %	0 %	480536540
17024	NC_021028	AAAG	2	8	839217	839224	75 %	0 %	25 %	0 %	480536540
17025	NC_021028	GTG	2	6	839240	839245	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480536540
17026	NC_021028	CGG	2	6	839247	839252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	480536540
17027	NC_021028	TGC	2	6	839355	839360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480536540
17028	NC_021028	GAT	2	6	839368	839373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536540
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17030	NC_021028	GAT	2	6	839428	839433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536540
17031	NC_021028	ATC	2	6	839443	839448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536540
17032	NC_021028	GAAG	2	8	839526	839533	50 %	0 %	50 %	0 %	480536540
17033	NC_021028	CAT	2	6	839538	839543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536540
17034	NC_021028	CTT	2	6	839565	839570	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480536540
17035	NC_021028	TCAA	2	8	839612	839619	50 %	25 %	0 %	25 %	480536540
17036	NC_021028	GTT	2	6	839679	839684	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480536540
17037	NC_021028	A	6	6	839698	839703	100 %	0 %	0 %	0 %	480536540
17038	NC_021028	ACC	2	6	839705	839710	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480536540
17039	NC_021028	AAGG	2	8	839728	839735	50 %	0 %	50 %	0 %	480536540
17040	NC_021028	A	6	6	839740	839745	100 %	0 %	0 %	0 %	480536540
17041	NC_021028	TAC	2	6	839764	839769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536540
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17043	NC_021028	GGAA	2	8	839835	839842	50 %	0 %	50 %	0 %	480536540
17044	NC_021028	A	7	7	839841	839847	100 %	0 %	0 %	0 %	480536540
17045	NC_021028	GCT	2	6	840018	840023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480536541
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17049	NC_021028	ACT	2	6	840256	840261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536541
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17054	NC_021028	GTCGAA	2	12	840516	840527	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	480536541
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17056	NC_021028	CAATT	2	10	840754	840763	40 %	40 %	0 %	20 %	480536541
17057	NC_021028	ATCTAC	2	12	840870	840881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536541
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17062	NC_021028	TATC	2	8	841268	841275	25 %	50 %	0 %	25 %	480536542
17063	NC_021028	GAA	2	6	841319	841324	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536542
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17073	NC_021028	ATG	2	6	842230	842235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536542
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17075	NC_021028	CAG	2	6	842267	842272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480536543
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17080	NC_021028	CTAT	2	8	842421	842428	25 %	50 %	0 %	25 %	480536543
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17089	NC_021028	TGC	2	6	842880	842885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480536543
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17091	NC_021028	CTG	2	6	842897	842902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480536543
17092	NC_021028	GTT	2	6	842905	842910	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480536543
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17102	NC_021028	GCT	2	6	843415	843420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480536544
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17109	NC_021028	GCA	2	6	843925	843930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480536544
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17111	NC_021028	TCC	2	6	844033	844038	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480536544
17112	NC_021028	AAG	3	9	844085	844093	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536544
17113	NC_021028	CTGTT	2	10	844094	844103	0 %	60 %	20 %	20 %	480536544
17114	NC_021028	AGA	2	6	844165	844170	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536544
17115	NC_021028	GA	3	6	844213	844218	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17116	NC_021028	CTT	2	6	844237	844242	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17117	NC_021028	A	6	6	844337	844342	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17118	NC_021028	CTTTT	2	10	844371	844380	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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17242	NC_021028	CAGC	2	8	849821	849828	25 %	0 %	25 %	50 %	480536550
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17264	NC_021028	AAT	2	6	850874	850879	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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17357	NC_021028	ATGA	2	8	855828	855835	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
17358	NC_021028	AAAG	2	8	855837	855844	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
17359	NC_021028	A	6	6	855865	855870	100 %	0 %	0 %	0 %	480536556
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