MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pneumoniae SPN034183 draft genome

Total Repeats: 41473

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16501	NC_021028	T	6	6	811292	811297	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16502	NC_021028	ACT	2	6	811349	811354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16503	NC_021028	AAT	2	6	811410	811415	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16504	NC_021028	TTAAAA	2	12	811468	811479	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16505	NC_021028	TA	3	6	811497	811502	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16506	NC_021028	GAA	2	6	811519	811524	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16507	NC_021028	GTT	2	6	811554	811559	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16508	NC_021028	TGTT	2	8	811600	811607	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
16509	NC_021028	TTA	2	6	811615	811620	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16510	NC_021028	ATA	2	6	811697	811702	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16511	NC_021028	GCT	2	6	811744	811749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16512	NC_021028	T	6	6	811965	811970	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16513	NC_021028	TAT	2	6	811999	812004	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480536520
16514	NC_021028	TGG	2	6	812019	812024	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480536520
16515	NC_021028	T	6	6	812031	812036	0 %	100 %	0 %	0 %	480536520
16516	NC_021028	TTC	2	6	812040	812045	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480536520
16517	NC_021028	GAT	2	6	812079	812084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536520
16518	NC_021028	AGAC	2	8	812086	812093	50 %	0 %	25 %	25 %	480536520
16519	NC_021028	TAG	2	6	812184	812189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536520
16520	NC_021028	ATA	2	6	812286	812291	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480536520
16521	NC_021028	TCT	2	6	812299	812304	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480536520
16522	NC_021028	AAG	2	6	812382	812387	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536520
16523	NC_021028	T	6	6	812419	812424	0 %	100 %	0 %	0 %	480536520
16524	NC_021028	TGG	2	6	812446	812451	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480536520
16525	NC_021028	ATA	2	6	812470	812475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480536520
16526	NC_021028	AAGGT	2	10	812493	812502	40 %	20 %	40 %	0 %	480536521
16527	NC_021028	AGT	2	6	812572	812577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536521
16528	NC_021028	CTT	2	6	812604	812609	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480536521
16529	NC_021028	TCCA	2	8	812648	812655	25 %	25 %	0 %	50 %	480536521
16530	NC_021028	CTA	2	6	812676	812681	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536521
16531	NC_021028	TTGT	2	8	812882	812889	0 %	75 %	25 %	0 %	480536521
16532	NC_021028	TGAGC	2	10	812910	812919	20 %	20 %	40 %	20 %	480536521
16533	NC_021028	CTT	2	6	813069	813074	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480536521
16534	NC_021028	ATTG	2	8	813242	813249	25 %	50 %	25 %	0 %	480536521
16535	NC_021028	CTTTA	2	10	813391	813400	20 %	60 %	0 %	20 %	480536521
16536	NC_021028	ACC	2	6	813586	813591	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480536521
16537	NC_021028	GTA	2	6	813619	813624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536521
16538	NC_021028	ATG	2	6	813633	813638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536521
16539	NC_021028	TGT	2	6	813727	813732	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480536521
16540	NC_021028	CTTGA	2	10	813760	813769	20 %	40 %	20 %	20 %	480536521
16541	NC_021028	GGAA	2	8	813926	813933	50 %	0 %	50 %	0 %	480536521
16542	NC_021028	AG	3	6	814092	814097	50 %	0 %	50 %	0 %	480536521
16543	NC_021028	TGA	2	6	814127	814132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536521
16544	NC_021028	GCTG	2	8	814138	814145	0 %	25 %	50 %	25 %	480536521
16545	NC_021028	ATG	2	6	814148	814153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536521
16546	NC_021028	AAT	2	6	814183	814188	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480536521
16547	NC_021028	AGT	2	6	814305	814310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536521
16548	NC_021028	TCC	2	6	814322	814327	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480536521
16549	NC_021028	T	6	6	814372	814377	0 %	100 %	0 %	0 %	480536521
16550	NC_021028	TCAA	2	8	814409	814416	50 %	25 %	0 %	25 %	480536521
16551	NC_021028	AT	3	6	814423	814428	50 %	50 %	0 %	0 %	480536521
16552	NC_021028	A	6	6	814518	814523	100 %	0 %	0 %	0 %	480536521
16553	NC_021028	CTG	2	6	814527	814532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480536521
16554	NC_021028	TCT	2	6	814541	814546	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480536521
16555	NC_021028	A	6	6	814552	814557	100 %	0 %	0 %	0 %	480536521
16556	NC_021028	CAG	2	6	814561	814566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480536521
16557	NC_021028	T	7	7	814572	814578	0 %	100 %	0 %	0 %	480536521
16558	NC_021028	GCT	2	6	814583	814588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480536521
16559	NC_021028	ACG	2	6	814633	814638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480536521
16560	NC_021028	T	7	7	814696	814702	0 %	100 %	0 %	0 %	480536521
16561	NC_021028	TTA	2	6	814791	814796	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16562	NC_021028	A	9	9	814801	814809	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16563	NC_021028	AAT	2	6	814840	814845	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16564	NC_021028	AATA	2	8	814901	814908	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16565	NC_021028	TATAT	2	10	814936	814945	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
16566	NC_021028	TA	3	6	814958	814963	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16567	NC_021028	TATAAA	2	12	814972	814983	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16568	NC_021028	ATG	2	6	814985	814990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16569	NC_021028	AAAT	2	8	815012	815019	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16570	NC_021028	TGA	2	6	815028	815033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16571	NC_021028	TCGA	2	8	815162	815169	25 %	25 %	25 %	25 %	480536522
16572	NC_021028	AGC	2	6	815182	815187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480536522
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16574	NC_021028	A	7	7	815266	815272	100 %	0 %	0 %	0 %	480536522
16575	NC_021028	GAT	2	6	815318	815323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536522
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16583	NC_021028	GA	3	6	815833	815838	50 %	0 %	50 %	0 %	480536522
16584	NC_021028	TAGAC	2	10	815893	815902	40 %	20 %	20 %	20 %	480536522
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16592	NC_021028	GTA	2	6	816192	816197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536522
16593	NC_021028	CAAG	2	8	816238	816245	50 %	0 %	25 %	25 %	480536522
16594	NC_021028	TTGC	2	8	816408	816415	0 %	50 %	25 %	25 %	480536522
16595	NC_021028	TGA	2	6	816511	816516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536522
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16598	NC_021028	TTGC	2	8	816623	816630	0 %	50 %	25 %	25 %	480536522
16599	NC_021028	GAA	2	6	816659	816664	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536522
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16604	NC_021028	GGA	2	6	816898	816903	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480536522
16605	NC_021028	ATGAG	2	10	817041	817050	40 %	20 %	40 %	0 %	480536522
16606	NC_021028	GCCTAC	2	12	817160	817171	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	480536522
16607	NC_021028	T	6	6	817221	817226	0 %	100 %	0 %	0 %	480536522
16608	NC_021028	ATT	2	6	817242	817247	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480536522
16609	NC_021028	CT	3	6	817297	817302	0 %	50 %	0 %	50 %	480536522
16610	NC_021028	CAA	2	6	817339	817344	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480536522
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16612	NC_021028	TA	3	6	817352	817357	50 %	50 %	0 %	0 %	480536522
16613	NC_021028	ATT	2	6	817403	817408	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480536522
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16615	NC_021028	TAA	2	6	817543	817548	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480536522
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16617	NC_021028	GCTAT	2	10	817761	817770	20 %	40 %	20 %	20 %	480536522
16618	NC_021028	CTT	2	6	817831	817836	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480536522
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16621	NC_021028	CT	3	6	817872	817877	0 %	50 %	0 %	50 %	480536522
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16623	NC_021028	TCA	2	6	818091	818096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536522
16624	NC_021028	CAT	2	6	818135	818140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536522
16625	NC_021028	TGAA	2	8	818175	818182	50 %	25 %	25 %	0 %	480536522
16626	NC_021028	AGA	2	6	818223	818228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16627	NC_021028	AAG	2	6	818255	818260	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16628	NC_021028	GCT	2	6	818343	818348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480536523
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16643	NC_021028	ATC	2	6	818940	818945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536523
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16653	NC_021028	AT	4	8	819332	819339	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16654	NC_021028	GTG	2	6	819410	819415	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480536524
16655	NC_021028	A	6	6	819418	819423	100 %	0 %	0 %	0 %	480536524
16656	NC_021028	ATTG	2	8	819489	819496	25 %	50 %	25 %	0 %	480536524
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16659	NC_021028	A	6	6	819598	819603	100 %	0 %	0 %	0 %	480536524
16660	NC_021028	CTT	2	6	819613	819618	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480536524
16661	NC_021028	A	6	6	819692	819697	100 %	0 %	0 %	0 %	480536524
16662	NC_021028	AATCA	2	10	819720	819729	60 %	20 %	0 %	20 %	480536524
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16688	NC_021028	GCAATC	2	12	821116	821127	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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16745	NC_021028	ATCA	2	8	823632	823639	50 %	25 %	0 %	25 %	480536526
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16995	NC_021028	TAG	2	6	837163	837168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536538
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16999	NC_021028	TAAT	2	8	837337	837344	50 %	50 %	0 %	0 %	480536538
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