MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pneumoniae SPN034183 draft genome

Total Repeats: 41473

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_021028	ATT	2	6	736075	736080	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15002	NC_021028	T	6	6	736079	736084	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15003	NC_021028	GATA	2	8	736114	736121	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15004	NC_021028	CTT	2	6	736176	736181	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15005	NC_021028	ATA	2	6	736219	736224	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15006	NC_021028	CTA	2	6	736244	736249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15007	NC_021028	TAT	2	6	736257	736262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15008	NC_021028	TC	3	6	736282	736287	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15009	NC_021028	AATT	2	8	736336	736343	50 %	50 %	0 %	0 %	480536463
15010	NC_021028	TCA	2	6	736373	736378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536463
15011	NC_021028	GTTT	2	8	736455	736462	0 %	75 %	25 %	0 %	480536463
15012	NC_021028	CAA	2	6	736533	736538	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480536463
15013	NC_021028	ATA	2	6	736610	736615	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480536463
15014	NC_021028	TCC	2	6	736618	736623	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15015	NC_021028	TAT	2	6	736637	736642	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15016	NC_021028	ATTTT	2	10	736757	736766	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
15017	NC_021028	T	6	6	736794	736799	0 %	100 %	0 %	0 %	480536464
15018	NC_021028	CTT	2	6	736904	736909	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480536464
15019	NC_021028	GTA	3	9	736944	736952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536464
15020	NC_021028	CTG	2	6	737012	737017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480536464
15021	NC_021028	TCAA	2	8	737032	737039	50 %	25 %	0 %	25 %	480536464
15022	NC_021028	TGA	2	6	737059	737064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536464
15023	NC_021028	GAACAA	2	12	737120	737131	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	480536464
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15025	NC_021028	T	6	6	737199	737204	0 %	100 %	0 %	0 %	480536464
15026	NC_021028	TTA	3	9	737253	737261	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15027	NC_021028	A	6	6	737332	737337	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15028	NC_021028	TC	3	6	737340	737345	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15029	NC_021028	GTA	2	6	737363	737368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15030	NC_021028	ACC	2	6	737453	737458	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15031	NC_021028	GATAGA	2	12	737488	737499	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15032	NC_021028	A	8	8	737613	737620	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15033	NC_021028	CTA	2	6	737630	737635	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15034	NC_021028	AAG	2	6	737774	737779	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15035	NC_021028	GAA	2	6	737794	737799	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15036	NC_021028	AATG	2	8	737835	737842	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15037	NC_021028	T	6	6	737890	737895	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15038	NC_021028	TTA	3	9	737945	737953	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15039	NC_021028	TCC	2	6	738030	738035	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15040	NC_021028	GTT	2	6	738110	738115	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15041	NC_021028	AATT	2	8	738210	738217	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15042	NC_021028	CTA	2	6	738263	738268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15043	NC_021028	TA	3	6	738267	738272	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15044	NC_021028	A	7	7	738321	738327	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15045	NC_021028	ATTT	2	8	738367	738374	25 %	75 %	0 %	0 %	480536465
15046	NC_021028	T	6	6	738402	738407	0 %	100 %	0 %	0 %	480536465
15047	NC_021028	GTA	2	6	738480	738485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536465
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15050	NC_021028	TGT	2	6	738608	738613	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480536465
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15055	NC_021028	ATG	2	6	738841	738846	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536465
15056	NC_021028	GAA	2	6	738908	738913	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536465
15057	NC_021028	GA	3	6	738963	738968	50 %	0 %	50 %	0 %	480536465
15058	NC_021028	TCA	2	6	739009	739014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536465
15059	NC_021028	GGA	2	6	739030	739035	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480536465
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15065	NC_021028	TGA	2	6	739388	739393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536465
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15095	NC_021028	GTT	2	6	740749	740754	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15096	NC_021028	A	7	7	740785	740791	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15097	NC_021028	TAG	2	6	740857	740862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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15099	NC_021028	TCG	2	6	740962	740967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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15101	NC_021028	TGA	2	6	741059	741064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15102	NC_021028	AGG	2	6	741129	741134	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15103	NC_021028	A	6	6	741148	741153	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15104	NC_021028	TAAA	2	8	741192	741199	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15105	NC_021028	A	6	6	741206	741211	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15106	NC_021028	T	6	6	741287	741292	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15107	NC_021028	TGT	2	6	741326	741331	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15108	NC_021028	TTGG	2	8	741425	741432	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15109	NC_021028	GAT	2	6	741467	741472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15110	NC_021028	GTG	2	6	741592	741597	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15111	NC_021028	GGC	2	6	741656	741661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15112	NC_021028	ATGCG	2	10	741688	741697	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
15113	NC_021028	ACA	2	6	741822	741827	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15114	NC_021028	ACA	2	6	741834	741839	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15115	NC_021028	GCA	2	6	741870	741875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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15120	NC_021028	AAG	2	6	742172	742177	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15121	NC_021028	CAA	2	6	742220	742225	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15122	NC_021028	CTT	2	6	742231	742236	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15123	NC_021028	AG	3	6	742314	742319	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15124	NC_021028	GCA	2	6	742390	742395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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15126	NC_021028	GTT	2	6	742610	742615	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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15251	NC_021028	TGATT	2	10	749049	749058	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
15252	NC_021028	GAT	2	6	749101	749106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15253	NC_021028	GAT	2	6	749209	749214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15254	NC_021028	AAGA	2	8	749218	749225	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
15255	NC_021028	TTCTC	2	10	749247	749256	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
15256	NC_021028	GAT	2	6	749281	749286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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15260	NC_021028	TTA	2	6	749542	749547	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15261	NC_021028	GAT	2	6	749572	749577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15262	NC_021028	GTT	2	6	749587	749592	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15263	NC_021028	TGT	2	6	749868	749873	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15264	NC_021028	ATA	2	6	749888	749893	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15265	NC_021028	AATG	2	8	749964	749971	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15266	NC_021028	TCT	2	6	750079	750084	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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15271	NC_021028	A	6	6	750433	750438	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15272	NC_021028	GC	3	6	750439	750444	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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15278	NC_021028	CTA	2	6	750796	750801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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15281	NC_021028	AGTT	2	8	750936	750943	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
15282	NC_021028	TAC	2	6	750963	750968	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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15284	NC_021028	AGTC	2	8	751104	751111	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
15285	NC_021028	AT	3	6	751114	751119	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15286	NC_021028	AGA	2	6	751157	751162	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15287	NC_021028	CTGAA	2	10	751257	751266	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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15291	NC_021028	GT	3	6	751449	751454	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15292	NC_021028	TTTGA	2	10	751455	751464	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
15293	NC_021028	CTGA	2	8	751496	751503	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
15294	NC_021028	TCT	2	6	751546	751551	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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15377	NC_021028	GCAA	2	8	755307	755314	50 %	0 %	25 %	25 %	480536477
15378	NC_021028	TGG	2	6	755359	755364	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480536477
15379	NC_021028	A	6	6	755387	755392	100 %	0 %	0 %	0 %	480536477
15380	NC_021028	GGA	2	6	755422	755427	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480536477
15381	NC_021028	A	6	6	755453	755458	100 %	0 %	0 %	0 %	480536477
15382	NC_021028	A	8	8	755516	755523	100 %	0 %	0 %	0 %	480536478
15383	NC_021028	GAC	2	6	755643	755648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480536478
15384	NC_021028	TGG	2	6	755745	755750	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480536478
15385	NC_021028	CTC	2	6	755780	755785	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480536478
15386	NC_021028	TTG	2	6	755786	755791	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480536478
15387	NC_021028	GTGGTC	2	12	755822	755833	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	480536478
15388	NC_021028	TGA	2	6	756044	756049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536478
15389	NC_021028	TGA	2	6	756126	756131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536478
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15394	NC_021028	AGA	2	6	756617	756622	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536478
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15396	NC_021028	A	6	6	756674	756679	100 %	0 %	0 %	0 %	480536478
15397	NC_021028	TGA	2	6	756726	756731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536478
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15402	NC_021028	TA	3	6	756804	756809	50 %	50 %	0 %	0 %	480536479
15403	NC_021028	A	6	6	756840	756845	100 %	0 %	0 %	0 %	480536479
15404	NC_021028	TGT	2	6	756859	756864	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480536479
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15406	NC_021028	A	6	6	756927	756932	100 %	0 %	0 %	0 %	480536479
15407	NC_021028	AGT	2	6	756965	756970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536479
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15410	NC_021028	AGT	2	6	757121	757126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536479
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15414	NC_021028	TTG	2	6	757195	757200	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480536479
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15420	NC_021028	GCTA	2	8	757573	757580	25 %	25 %	25 %	25 %	480536480
15421	NC_021028	GA	3	6	757600	757605	50 %	0 %	50 %	0 %	480536480
15422	NC_021028	ATTG	2	8	757653	757660	25 %	50 %	25 %	0 %	480536480
15423	NC_021028	T	6	6	757723	757728	0 %	100 %	0 %	0 %	480536480
15424	NC_021028	CAAT	2	8	757865	757872	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
15425	NC_021028	AGG	2	6	757905	757910	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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15450	NC_021028	ATGG	2	8	758970	758977	25 %	25 %	50 %	0 %	480536481
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15454	NC_021028	TGG	2	6	759161	759166	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480536482
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15497	NC_021028	CAT	2	6	761241	761246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536483
15498	NC_021028	AAC	2	6	761280	761285	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480536483
15499	NC_021028	TAT	2	6	761361	761366	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480536483
15500	NC_021028	CTAT	2	8	761368	761375	25 %	50 %	0 %	25 %	480536483

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