MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pneumoniae SPN034183 draft genome

Total Repeats: 41473

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_021028	ATG	2	6	685957	685962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536415
14002	NC_021028	A	7	7	685986	685992	100 %	0 %	0 %	0 %	480536415
14003	NC_021028	ATT	2	6	686142	686147	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480536415
14004	NC_021028	CAA	2	6	686306	686311	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480536415
14005	NC_021028	ATTT	2	8	686350	686357	25 %	75 %	0 %	0 %	480536415
14006	NC_021028	TGA	2	6	686365	686370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536415
14007	NC_021028	CTA	2	6	686376	686381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536415
14008	NC_021028	GCT	2	6	686459	686464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14009	NC_021028	GAG	2	6	686470	686475	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14010	NC_021028	T	6	6	686490	686495	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14011	NC_021028	AGA	2	6	686525	686530	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14012	NC_021028	AAG	2	6	686543	686548	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14013	NC_021028	AGA	2	6	686557	686562	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14014	NC_021028	CTT	2	6	686563	686568	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14015	NC_021028	T	6	6	686607	686612	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14016	NC_021028	T	7	7	686626	686632	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14017	NC_021028	A	8	8	686647	686654	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14018	NC_021028	TAAA	2	8	686711	686718	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14019	NC_021028	ATG	2	6	686735	686740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536416
14020	NC_021028	TGTCT	2	10	686758	686767	0 %	60 %	20 %	20 %	480536416
14021	NC_021028	GCT	2	6	686825	686830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480536416
14022	NC_021028	TGA	2	6	686835	686840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536416
14023	NC_021028	TGA	2	6	686862	686867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536416
14024	NC_021028	CAC	2	6	686883	686888	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480536416
14025	NC_021028	TCA	2	6	686892	686897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536416
14026	NC_021028	G	6	6	686925	686930	0 %	0 %	100 %	0 %	480536416
14027	NC_021028	TTTG	2	8	686950	686957	0 %	75 %	25 %	0 %	480536416
14028	NC_021028	GGA	2	6	686969	686974	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480536416
14029	NC_021028	TGG	2	6	686995	687000	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480536416
14030	NC_021028	CGC	2	6	687007	687012	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	480536416
14031	NC_021028	ACT	2	6	687101	687106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536416
14032	NC_021028	TGG	2	6	687112	687117	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480536416
14033	NC_021028	TCAA	2	8	687119	687126	50 %	25 %	0 %	25 %	480536416
14034	NC_021028	ACA	2	6	687222	687227	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480536416
14035	NC_021028	TAC	2	6	687230	687235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536416
14036	NC_021028	TTC	2	6	687266	687271	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480536416
14037	NC_021028	TTC	2	6	687303	687308	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480536416
14038	NC_021028	TGC	2	6	687334	687339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480536416
14039	NC_021028	AGT	2	6	687349	687354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536416
14040	NC_021028	AAT	2	6	687368	687373	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480536416
14041	NC_021028	CAC	2	6	687470	687475	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480536416
14042	NC_021028	TGG	2	6	687508	687513	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480536416
14043	NC_021028	TTG	2	6	687714	687719	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480536416
14044	NC_021028	ATG	2	6	687767	687772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536416
14045	NC_021028	CATGTT	2	12	687826	687837	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	480536416
14046	NC_021028	TGC	2	6	687880	687885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480536416
14047	NC_021028	CGT	2	6	687901	687906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480536416
14048	NC_021028	TGGTAT	2	12	687973	687984	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	480536416
14049	NC_021028	CTG	2	6	688104	688109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480536416
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14051	NC_021028	CAG	2	6	688126	688131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480536416
14052	NC_021028	GCA	2	6	688145	688150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480536416
14053	NC_021028	CTT	2	6	688178	688183	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480536416
14054	NC_021028	GTTGAT	2	12	688202	688213	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	480536416
14055	NC_021028	TGA	2	6	688305	688310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536416
14056	NC_021028	ACA	2	6	688432	688437	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480536416
14057	NC_021028	GTT	2	6	688496	688501	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480536416
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14059	NC_021028	CAA	2	6	688623	688628	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480536416
14060	NC_021028	GCA	2	6	688748	688753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480536416
14061	NC_021028	GCA	2	6	688793	688798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480536416
14062	NC_021028	AGT	2	6	688816	688821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536416
14063	NC_021028	A	6	6	688862	688867	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14064	NC_021028	CAG	2	6	688889	688894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14065	NC_021028	TGGA	2	8	688996	689003	25 %	25 %	50 %	0 %	480536417
14066	NC_021028	AAG	2	6	689006	689011	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536417
14067	NC_021028	TGATT	2	10	689061	689070	20 %	60 %	20 %	0 %	480536417
14068	NC_021028	CAG	2	6	689141	689146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480536417
14069	NC_021028	TAC	2	6	689215	689220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536417
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14072	NC_021028	TGG	2	6	689419	689424	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480536417
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14075	NC_021028	AAC	2	6	689509	689514	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480536417
14076	NC_021028	CAG	2	6	689516	689521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480536417
14077	NC_021028	TAC	2	6	689673	689678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536417
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14081	NC_021028	AGAT	2	8	689898	689905	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
14082	NC_021028	GGA	2	6	689968	689973	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480536418
14083	NC_021028	TAG	2	6	690042	690047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536418
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14091	NC_021028	TGA	2	6	690685	690690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536418
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14094	NC_021028	ATG	2	6	690867	690872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536418
14095	NC_021028	T	7	7	690892	690898	0 %	100 %	0 %	0 %	480536418
14096	NC_021028	TGA	2	6	690967	690972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536418
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14099	NC_021028	TTGGT	2	10	691113	691122	0 %	60 %	40 %	0 %	480536418
14100	NC_021028	AAAAAG	2	12	691124	691135	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	480536418
14101	NC_021028	A	6	6	691136	691141	100 %	0 %	0 %	0 %	480536418
14102	NC_021028	AAG	2	6	691157	691162	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536418
14103	NC_021028	TGA	2	6	691180	691185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536418
14104	NC_021028	TTG	2	6	691271	691276	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14105	NC_021028	GAAC	2	8	691308	691315	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
14106	NC_021028	TAC	2	6	691330	691335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14107	NC_021028	TA	3	6	691381	691386	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14108	NC_021028	GGTA	2	8	691400	691407	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
14109	NC_021028	TTA	2	6	691409	691414	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14110	NC_021028	T	6	6	691457	691462	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14111	NC_021028	G	6	6	691465	691470	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
14112	NC_021028	ATT	2	6	691493	691498	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480536419
14113	NC_021028	TGC	2	6	691601	691606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480536419
14114	NC_021028	TA	3	6	691618	691623	50 %	50 %	0 %	0 %	480536419
14115	NC_021028	CTG	2	6	691738	691743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480536419
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14121	NC_021028	TCT	2	6	692154	692159	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480536419
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14137	NC_021028	CTTT	2	8	693119	693126	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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14241	NC_021028	AGTG	2	8	697984	697991	25 %	25 %	50 %	0 %	480536425
14242	NC_021028	T	7	7	698013	698019	0 %	100 %	0 %	0 %	480536425
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14492	NC_021028	GTT	2	6	710561	710566	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480536441
14493	NC_021028	GTCAA	2	10	710598	710607	40 %	20 %	20 %	20 %	480536441
14494	NC_021028	TC	3	6	710649	710654	0 %	50 %	0 %	50 %	480536441
14495	NC_021028	A	7	7	710657	710663	100 %	0 %	0 %	0 %	480536441
14496	NC_021028	AGGAAG	2	12	710715	710726	50 %	0 %	50 %	0 %	480536441
14497	NC_021028	ATT	2	6	710909	710914	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480536441
14498	NC_021028	GA	3	6	710929	710934	50 %	0 %	50 %	0 %	480536441
14499	NC_021028	AT	3	6	711098	711103	50 %	50 %	0 %	0 %	480536441
14500	NC_021028	TGG	2	6	711109	711114	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480536441

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