MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pneumoniae SPN034183 draft genome

Total Repeats: 41473

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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13502	NC_021028	GCT	2	6	660009	660014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480536388
13503	NC_021028	GTT	2	6	660024	660029	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480536388
13504	NC_021028	GAA	2	6	660045	660050	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536388
13505	NC_021028	AAG	2	6	660086	660091	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536388
13506	NC_021028	A	7	7	660251	660257	100 %	0 %	0 %	0 %	480536389
13507	NC_021028	CAAT	2	8	660267	660274	50 %	25 %	0 %	25 %	480536389
13508	NC_021028	GAT	2	6	660337	660342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536389
13509	NC_021028	TGC	2	6	660369	660374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480536389
13510	NC_021028	A	6	6	660437	660442	100 %	0 %	0 %	0 %	480536389
13511	NC_021028	ACC	2	6	660535	660540	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480536389
13512	NC_021028	GGC	2	6	660619	660624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	480536389
13513	NC_021028	TGT	2	6	660678	660683	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480536389
13514	NC_021028	AGA	2	6	660702	660707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536389
13515	NC_021028	TAAT	2	8	660760	660767	50 %	50 %	0 %	0 %	480536389
13516	NC_021028	CT	3	6	660930	660935	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13517	NC_021028	AG	3	6	660957	660962	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13518	NC_021028	T	7	7	660963	660969	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13519	NC_021028	GGCCTT	2	12	661052	661063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480536390
13520	NC_021028	CAG	2	6	661102	661107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480536390
13521	NC_021028	GCA	2	6	661116	661121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480536390
13522	NC_021028	CAC	2	6	661213	661218	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480536390
13523	NC_021028	CAA	2	6	661321	661326	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480536390
13524	NC_021028	TCT	2	6	661329	661334	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480536390
13525	NC_021028	TAA	2	6	661354	661359	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480536390
13526	NC_021028	GTA	2	6	661372	661377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536390
13527	NC_021028	GTTT	2	8	661379	661386	0 %	75 %	25 %	0 %	480536390
13528	NC_021028	TCAA	2	8	661410	661417	50 %	25 %	0 %	25 %	480536390
13529	NC_021028	T	6	6	661472	661477	0 %	100 %	0 %	0 %	480536390
13530	NC_021028	GAT	2	6	661490	661495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536390
13531	NC_021028	AGT	2	6	661508	661513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536390
13532	NC_021028	GAG	2	6	661588	661593	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480536390
13533	NC_021028	ACA	2	6	661647	661652	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480536390
13534	NC_021028	TC	3	6	661668	661673	0 %	50 %	0 %	50 %	480536390
13535	NC_021028	CAC	3	9	661708	661716	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480536390
13536	NC_021028	CAAC	2	8	661774	661781	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13537	NC_021028	AGA	2	6	661830	661835	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13538	NC_021028	GTT	2	6	661939	661944	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13539	NC_021028	T	6	6	661948	661953	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13540	NC_021028	TA	3	6	661980	661985	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13541	NC_021028	GAA	2	6	662036	662041	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13542	NC_021028	ATT	2	6	662045	662050	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13543	NC_021028	ATT	2	6	662164	662169	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480536391
13544	NC_021028	A	6	6	662293	662298	100 %	0 %	0 %	0 %	480536391
13545	NC_021028	TTG	2	6	662404	662409	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480536391
13546	NC_021028	GACT	2	8	662442	662449	25 %	25 %	25 %	25 %	480536391
13547	NC_021028	AGA	2	6	662477	662482	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536391
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13550	NC_021028	A	7	7	662634	662640	100 %	0 %	0 %	0 %	480536392
13551	NC_021028	ATG	2	6	662876	662881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536392
13552	NC_021028	GAT	2	6	662890	662895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536392
13553	NC_021028	AAGC	2	8	662931	662938	50 %	0 %	25 %	25 %	480536393
13554	NC_021028	A	6	6	662955	662960	100 %	0 %	0 %	0 %	480536393
13555	NC_021028	ATC	2	6	662985	662990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536393
13556	NC_021028	GAA	3	9	663080	663088	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536393
13557	NC_021028	GAG	2	6	663116	663121	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480536393
13558	NC_021028	TA	3	6	663197	663202	50 %	50 %	0 %	0 %	480536393
13559	NC_021028	ATCTCT	2	12	663223	663234	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	480536393
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13563	NC_021028	AT	3	6	663382	663387	50 %	50 %	0 %	0 %	480536393
13564	NC_021028	CT	3	6	663483	663488	0 %	50 %	0 %	50 %	480536393
13565	NC_021028	A	6	6	663564	663569	100 %	0 %	0 %	0 %	480536393
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13570	NC_021028	AGT	2	6	663979	663984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536393
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13572	NC_021028	CT	3	6	664069	664074	0 %	50 %	0 %	50 %	480536393
13573	NC_021028	TGG	2	6	664146	664151	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480536393
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13580	NC_021028	TGCT	2	8	664593	664600	0 %	50 %	25 %	25 %	480536393
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13591	NC_021028	AG	3	6	665231	665236	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13592	NC_021028	A	7	7	665339	665345	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13593	NC_021028	GCA	2	6	665392	665397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480536394
13594	NC_021028	CGG	2	6	665562	665567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	480536394
13595	NC_021028	GGT	2	6	665593	665598	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480536394
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13599	NC_021028	TGT	2	6	665838	665843	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480536394
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13602	NC_021028	TCAT	2	8	665917	665924	25 %	50 %	0 %	25 %	480536394
13603	NC_021028	TGG	2	6	666009	666014	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480536394
13604	NC_021028	ATC	2	6	666067	666072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536394
13605	NC_021028	GTTG	2	8	666139	666146	0 %	50 %	50 %	0 %	480536394
13606	NC_021028	AGC	2	6	666330	666335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480536394
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13608	NC_021028	AAC	2	6	666400	666405	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480536394
13609	NC_021028	CAA	2	6	666486	666491	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480536394
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13612	NC_021028	GCT	2	6	666637	666642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480536394
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13618	NC_021028	GTT	2	6	666916	666921	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480536394
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13992	NC_021028	AAT	2	6	685689	685694	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480536415
13993	NC_021028	GTA	2	6	685701	685706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536415
13994	NC_021028	ATA	2	6	685732	685737	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480536415
13995	NC_021028	AAG	2	6	685753	685758	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536415
13996	NC_021028	AAT	2	6	685773	685778	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480536415
13997	NC_021028	GAA	2	6	685805	685810	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536415
13998	NC_021028	AGA	2	6	685847	685852	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536415
13999	NC_021028	CT	3	6	685918	685923	0 %	50 %	0 %	50 %	480536415
14000	NC_021028	ATG	2	6	685924	685929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536415

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