MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pneumoniae SPN034183 draft genome

Total Repeats: 41473

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_021028	AGA	2	6	612880	612885	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536342
12502	NC_021028	GAA	2	6	612896	612901	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536342
12503	NC_021028	GAC	2	6	612926	612931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480536342
12504	NC_021028	AGA	2	6	612946	612951	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536342
12505	NC_021028	AGA	2	6	612958	612963	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536342
12506	NC_021028	CAG	2	6	612966	612971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480536342
12507	NC_021028	GAA	2	6	612986	612991	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536342
12508	NC_021028	ACC	2	6	613087	613092	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480536342
12509	NC_021028	AAC	2	6	613116	613121	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480536342
12510	NC_021028	ATC	2	6	613165	613170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536342
12511	NC_021028	ACA	2	6	613171	613176	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480536342
12512	NC_021028	AGA	2	6	613189	613194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536342
12513	NC_021028	AAG	2	6	613221	613226	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536342
12514	NC_021028	CAGC	2	8	613232	613239	25 %	0 %	25 %	50 %	480536342
12515	NC_021028	GAA	2	6	613262	613267	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536342
12516	NC_021028	AAC	2	6	613308	613313	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480536342
12517	NC_021028	CTG	2	6	613329	613334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480536342
12518	NC_021028	AAAC	2	8	613340	613347	75 %	0 %	0 %	25 %	480536342
12519	NC_021028	ACT	2	6	613394	613399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536342
12520	NC_021028	GTT	2	6	613442	613447	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480536342
12521	NC_021028	AAGG	2	8	613448	613455	50 %	0 %	50 %	0 %	480536342
12522	NC_021028	TAC	2	6	613477	613482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536342
12523	NC_021028	AT	3	6	613486	613491	50 %	50 %	0 %	0 %	480536342
12524	NC_021028	TGA	2	6	613537	613542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536342
12525	NC_021028	GTT	2	6	613562	613567	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480536342
12526	NC_021028	ACTT	2	8	613654	613661	25 %	50 %	0 %	25 %	480536342
12527	NC_021028	A	7	7	613694	613700	100 %	0 %	0 %	0 %	480536342
12528	NC_021028	AG	3	6	613756	613761	50 %	0 %	50 %	0 %	480536342
12529	NC_021028	GAA	2	6	613844	613849	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536342
12530	NC_021028	GAA	2	6	613862	613867	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536342
12531	NC_021028	AAG	2	6	613889	613894	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536342
12532	NC_021028	TTGAA	2	10	613896	613905	40 %	40 %	20 %	0 %	480536342
12533	NC_021028	CTA	2	6	613917	613922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536342
12534	NC_021028	CTT	2	6	613966	613971	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480536342
12535	NC_021028	TAC	2	6	614000	614005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536342
12536	NC_021028	ATA	2	6	614025	614030	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480536342
12537	NC_021028	A	6	6	614052	614057	100 %	0 %	0 %	0 %	480536342
12538	NC_021028	TAT	2	6	614162	614167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480536342
12539	NC_021028	A	6	6	614172	614177	100 %	0 %	0 %	0 %	480536342
12540	NC_021028	TAC	2	6	614201	614206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536342
12541	NC_021028	AACAAA	2	12	614234	614245	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	480536342
12542	NC_021028	ATA	2	6	614370	614375	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480536342
12543	NC_021028	TAA	2	6	614392	614397	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480536342
12544	NC_021028	TAT	2	6	614398	614403	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480536342
12545	NC_021028	ATT	2	6	614486	614491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480536342
12546	NC_021028	ATAG	2	8	614573	614580	50 %	25 %	25 %	0 %	480536342
12547	NC_021028	GGT	2	6	614636	614641	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480536342
12548	NC_021028	TTG	2	6	614658	614663	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480536342
12549	NC_021028	GAA	2	6	614719	614724	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536342
12550	NC_021028	GTAG	2	8	614780	614787	25 %	25 %	50 %	0 %	480536342
12551	NC_021028	TGG	2	6	614851	614856	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480536342
12552	NC_021028	TA	3	6	614885	614890	50 %	50 %	0 %	0 %	480536342
12553	NC_021028	ATG	2	6	614906	614911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536342
12554	NC_021028	TTG	2	6	615000	615005	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480536342
12555	NC_021028	ACA	2	6	615046	615051	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480536342
12556	NC_021028	CAG	2	6	615114	615119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480536342
12557	NC_021028	TAAA	2	8	615147	615154	75 %	25 %	0 %	0 %	480536342
12558	NC_021028	AAC	2	6	615190	615195	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480536342
12559	NC_021028	TAA	2	6	615286	615291	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480536342
12560	NC_021028	ATT	2	6	615310	615315	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480536342
12561	NC_021028	TAT	2	6	615327	615332	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480536342
12562	NC_021028	TGAC	2	8	615363	615370	25 %	25 %	25 %	25 %	480536342
12563	NC_021028	AGA	2	6	615418	615423	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536342
12564	NC_021028	GTT	2	6	615494	615499	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480536342
12565	NC_021028	ATTG	2	8	615535	615542	25 %	50 %	25 %	0 %	480536342
12566	NC_021028	GTC	2	6	615562	615567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480536342
12567	NC_021028	GAA	2	6	615623	615628	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536342
12568	NC_021028	GTC	2	6	615639	615644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480536342
12569	NC_021028	GAA	2	6	615674	615679	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536342
12570	NC_021028	AGC	2	6	615763	615768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480536342
12571	NC_021028	GC	3	6	615772	615777	0 %	0 %	50 %	50 %	480536342
12572	NC_021028	TTAA	2	8	615779	615786	50 %	50 %	0 %	0 %	480536342
12573	NC_021028	ATG	2	6	615815	615820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536342
12574	NC_021028	ATG	2	6	615884	615889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536342
12575	NC_021028	GAAA	2	8	615956	615963	75 %	0 %	25 %	0 %	480536342
12576	NC_021028	TTACA	2	10	616043	616052	40 %	40 %	0 %	20 %	480536342
12577	NC_021028	AAC	2	6	616131	616136	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480536342
12578	NC_021028	CAA	2	6	616159	616164	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480536342
12579	NC_021028	A	6	6	616163	616168	100 %	0 %	0 %	0 %	480536342
12580	NC_021028	TAA	2	6	616189	616194	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480536342
12581	NC_021028	GAT	2	6	616210	616215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536342
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12584	NC_021028	CTT	2	6	616421	616426	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480536342
12585	NC_021028	ATA	2	6	616467	616472	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480536342
12586	NC_021028	TAG	2	6	616489	616494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536342
12587	NC_021028	ATATGG	2	12	616576	616587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536342
12588	NC_021028	GCATAT	2	12	616589	616600	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	480536342
12589	NC_021028	GCA	2	6	616607	616612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480536342
12590	NC_021028	GATG	2	8	616621	616628	25 %	25 %	50 %	0 %	480536342
12591	NC_021028	ACT	2	6	616691	616696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536342
12592	NC_021028	TGG	2	6	616723	616728	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480536342
12593	NC_021028	ATG	2	6	616854	616859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536342
12594	NC_021028	GAA	2	6	616924	616929	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536342
12595	NC_021028	ATG	2	6	616946	616951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536342
12596	NC_021028	GGAC	2	8	617041	617048	25 %	0 %	50 %	25 %	480536342
12597	NC_021028	GAAGA	2	10	617087	617096	60 %	0 %	40 %	0 %	480536342
12598	NC_021028	ATA	2	6	617130	617135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480536342
12599	NC_021028	AATATG	2	12	617207	617218	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	480536342
12600	NC_021028	GCT	2	6	617264	617269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480536342
12601	NC_021028	ATA	2	6	617280	617285	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480536342
12602	NC_021028	TAA	2	6	617341	617346	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480536342
12603	NC_021028	AT	3	6	617392	617397	50 %	50 %	0 %	0 %	480536342
12604	NC_021028	TGG	2	6	617413	617418	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480536342
12605	NC_021028	GAA	2	6	617443	617448	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536342
12606	NC_021028	AATTGA	2	12	617497	617508	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	480536342
12607	NC_021028	GAA	2	6	617564	617569	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536342
12608	NC_021028	ACAA	2	8	617622	617629	75 %	0 %	0 %	25 %	480536342
12609	NC_021028	CAC	2	6	617673	617678	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480536342
12610	NC_021028	GAAT	2	8	617686	617693	50 %	25 %	25 %	0 %	480536342
12611	NC_021028	TGAT	2	8	617771	617778	25 %	50 %	25 %	0 %	480536343
12612	NC_021028	GA	3	6	617794	617799	50 %	0 %	50 %	0 %	480536343
12613	NC_021028	ATT	2	6	617894	617899	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480536343
12614	NC_021028	TGG	2	6	617903	617908	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480536343
12615	NC_021028	GAG	2	6	617941	617946	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480536343
12616	NC_021028	CTTTA	2	10	617989	617998	20 %	60 %	0 %	20 %	480536343
12617	NC_021028	TGG	2	6	618215	618220	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480536343
12618	NC_021028	AGG	2	6	618227	618232	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480536343
12619	NC_021028	T	6	6	618295	618300	0 %	100 %	0 %	0 %	480536343
12620	NC_021028	ACA	2	6	618322	618327	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480536343
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12641	NC_021028	ACAGG	2	10	619363	619372	40 %	0 %	40 %	20 %	480536343
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12651	NC_021028	GAAA	2	8	620137	620144	75 %	0 %	25 %	0 %	480536345
12652	NC_021028	GAA	2	6	620222	620227	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536345
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12678	NC_021028	TAC	2	6	621242	621247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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12733	NC_021028	CTC	2	6	623417	623422	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12734	NC_021028	CTGA	2	8	623439	623446	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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12736	NC_021028	A	6	6	623474	623479	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12737	NC_021028	A	6	6	623496	623501	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12740	NC_021028	CTG	2	6	623537	623542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480536349
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12861	NC_021028	T	7	7	629975	629981	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12989	NC_021028	A	6	6	635769	635774	100 %	0 %	0 %	0 %	480536363
12990	NC_021028	ACA	2	6	635865	635870	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480536363
12991	NC_021028	ATC	2	6	635916	635921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536363
12992	NC_021028	ATG	2	6	635923	635928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536363
12993	NC_021028	TGA	2	6	636085	636090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536363
12994	NC_021028	CT	3	6	636114	636119	0 %	50 %	0 %	50 %	480536363
12995	NC_021028	AGG	2	6	636155	636160	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480536363
12996	NC_021028	AACC	2	8	636226	636233	50 %	0 %	0 %	50 %	480536363
12997	NC_021028	A	6	6	636287	636292	100 %	0 %	0 %	0 %	480536363
12998	NC_021028	TAT	3	9	636305	636313	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480536363
12999	NC_021028	GAT	2	6	636382	636387	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536363
13000	NC_021028	AGA	2	6	636404	636409	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

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