MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pneumoniae SPN034183 draft genome

Total Repeats: 41473

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_021028	GCT	2	6	385686	385691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480536144
8002	NC_021028	AAG	2	6	385762	385767	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536144
8003	NC_021028	CGAACG	2	12	385796	385807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480536144
8004	NC_021028	CAA	2	6	385808	385813	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480536144
8005	NC_021028	CTGA	2	8	385815	385822	25 %	25 %	25 %	25 %	480536144
8006	NC_021028	GCT	3	9	385839	385847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480536144
8007	NC_021028	TGT	2	6	385862	385867	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480536144
8008	NC_021028	CGG	2	6	385907	385912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	480536144
8009	NC_021028	ACTTGG	2	12	385931	385942	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	480536144
8010	NC_021028	AGA	2	6	386027	386032	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536144
8011	NC_021028	AGA	2	6	386042	386047	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536144
8012	NC_021028	AAG	2	6	386059	386064	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536144
8013	NC_021028	AAG	2	6	386101	386106	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536144
8014	NC_021028	TGA	2	6	386141	386146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536144
8015	NC_021028	GAAA	2	8	386171	386178	75 %	0 %	25 %	0 %	480536144
8016	NC_021028	GCT	3	9	386196	386204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480536144
8017	NC_021028	AGA	2	6	386207	386212	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536144
8018	NC_021028	GCA	2	6	386238	386243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480536144
8019	NC_021028	AGA	2	6	386285	386290	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536144
8020	NC_021028	GAA	2	6	386301	386306	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536144
8021	NC_021028	ACT	2	6	386388	386393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536144
8022	NC_021028	AAG	2	6	386395	386400	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536144
8023	NC_021028	AGA	3	9	386495	386503	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536144
8024	NC_021028	AAG	2	6	386512	386517	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536144
8025	NC_021028	GCA	2	6	386529	386534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480536144
8026	NC_021028	ACA	2	6	386539	386544	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480536144
8027	NC_021028	GCTT	2	8	386566	386573	0 %	50 %	25 %	25 %	480536144
8028	NC_021028	A	6	6	386607	386612	100 %	0 %	0 %	0 %	480536144
8029	NC_021028	TAA	2	6	386655	386660	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8030	NC_021028	TGG	2	6	386680	386685	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8031	NC_021028	GTCTGT	2	12	386723	386734	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	480536145
8032	NC_021028	TTC	2	6	386768	386773	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480536145
8033	NC_021028	TTG	2	6	386828	386833	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480536145
8034	NC_021028	TTC	2	6	386837	386842	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480536145
8035	NC_021028	ATGA	2	8	387245	387252	50 %	25 %	25 %	0 %	480536145
8036	NC_021028	TC	3	6	387258	387263	0 %	50 %	0 %	50 %	480536145
8037	NC_021028	GAG	2	6	387280	387285	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480536145
8038	NC_021028	TGAT	2	8	387339	387346	25 %	50 %	25 %	0 %	480536145
8039	NC_021028	GGC	2	6	387422	387427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	480536145
8040	NC_021028	T	6	6	387436	387441	0 %	100 %	0 %	0 %	480536145
8041	NC_021028	TGG	2	6	387445	387450	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480536145
8042	NC_021028	T	8	8	387494	387501	0 %	100 %	0 %	0 %	480536145
8043	NC_021028	CTAG	2	8	387540	387547	25 %	25 %	25 %	25 %	480536145
8044	NC_021028	CTTTG	2	10	387565	387574	0 %	60 %	20 %	20 %	480536145
8045	NC_021028	T	6	6	387583	387588	0 %	100 %	0 %	0 %	480536145
8046	NC_021028	AGA	2	6	387698	387703	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536145
8047	NC_021028	GCCA	2	8	387726	387733	25 %	0 %	25 %	50 %	480536145
8048	NC_021028	CCA	2	6	387739	387744	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480536145
8049	NC_021028	GAT	2	6	387761	387766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536145
8050	NC_021028	ATC	2	6	387803	387808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536145
8051	NC_021028	ATTC	2	8	387862	387869	25 %	50 %	0 %	25 %	480536145
8052	NC_021028	CGA	2	6	387873	387878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480536145
8053	NC_021028	AGC	2	6	387896	387901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480536145
8054	NC_021028	AAG	2	6	387902	387907	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536145
8055	NC_021028	TTC	2	6	387924	387929	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480536145
8056	NC_021028	AAGTC	2	10	387933	387942	40 %	20 %	20 %	20 %	480536145
8057	NC_021028	GAT	2	6	387965	387970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536145
8058	NC_021028	TACCAG	2	12	387991	388002	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	480536145
8059	NC_021028	AGT	2	6	388097	388102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536145
8060	NC_021028	TGT	2	6	388204	388209	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480536145
8061	NC_021028	CTG	2	6	388229	388234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480536145
8062	NC_021028	TCT	2	6	388242	388247	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480536145
8063	NC_021028	ACGGG	2	10	388296	388305	20 %	0 %	60 %	20 %	480536145
8064	NC_021028	TTC	2	6	388535	388540	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480536145
8065	NC_021028	TTG	2	6	388572	388577	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480536145
8066	NC_021028	ATC	2	6	388608	388613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536145
8067	NC_021028	TCCGT	2	10	388614	388623	0 %	40 %	20 %	40 %	480536145
8068	NC_021028	AG	3	6	388667	388672	50 %	0 %	50 %	0 %	480536145
8069	NC_021028	GTT	2	6	388852	388857	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480536145
8070	NC_021028	ATC	2	6	388952	388957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536145
8071	NC_021028	TCG	2	6	388977	388982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480536145
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8073	NC_021028	AAT	2	6	389027	389032	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480536145
8074	NC_021028	TTCTG	2	10	389103	389112	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
8075	NC_021028	AGA	3	9	389148	389156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8076	NC_021028	GGC	2	6	389275	389280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	480536146
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8079	NC_021028	CCA	2	6	389614	389619	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480536146
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8083	NC_021028	AGA	2	6	390011	390016	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536147
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8085	NC_021028	TCT	2	6	390051	390056	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480536147
8086	NC_021028	ATCA	2	8	390131	390138	50 %	25 %	0 %	25 %	480536147
8087	NC_021028	AGG	2	6	390168	390173	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480536147
8088	NC_021028	AGAT	2	8	390174	390181	50 %	25 %	25 %	0 %	480536147
8089	NC_021028	GA	3	6	390258	390263	50 %	0 %	50 %	0 %	480536147
8090	NC_021028	T	6	6	390283	390288	0 %	100 %	0 %	0 %	480536147
8091	NC_021028	GGTC	2	8	390322	390329	0 %	25 %	50 %	25 %	480536147
8092	NC_021028	CCA	2	6	390411	390416	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480536147
8093	NC_021028	TAGA	2	8	390555	390562	50 %	25 %	25 %	0 %	480536147
8094	NC_021028	GTGTGA	2	12	390670	390681	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	480536147
8095	NC_021028	A	6	6	390814	390819	100 %	0 %	0 %	0 %	480536148
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8099	NC_021028	CTCAG	2	10	390968	390977	20 %	20 %	20 %	40 %	480536148
8100	NC_021028	AGA	2	6	391014	391019	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536148
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8102	NC_021028	TTA	2	6	391154	391159	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480536149
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8104	NC_021028	CTTT	2	8	391270	391277	0 %	75 %	0 %	25 %	480536149
8105	NC_021028	CTTG	2	8	391334	391341	0 %	50 %	25 %	25 %	480536149
8106	NC_021028	TCT	2	6	391379	391384	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480536149
8107	NC_021028	A	6	6	391404	391409	100 %	0 %	0 %	0 %	480536149
8108	NC_021028	GTT	2	6	391421	391426	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480536149
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8110	NC_021028	TCG	2	6	391543	391548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480536149
8111	NC_021028	CAT	2	6	391556	391561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536149
8112	NC_021028	AAC	2	6	391577	391582	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480536149
8113	NC_021028	CAAA	2	8	391592	391599	75 %	0 %	0 %	25 %	480536149
8114	NC_021028	TTG	2	6	391792	391797	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480536150
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8116	NC_021028	TCG	2	6	391898	391903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480536150
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8118	NC_021028	GAG	2	6	391987	391992	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480536150
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8123	NC_021028	GGAA	2	8	392271	392278	50 %	0 %	50 %	0 %	480536150
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