MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pneumoniae SPN034183 draft genome

Total Repeats: 41473

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7001	NC_021028	GGT	2	6	338252	338257	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480536111
7002	NC_021028	TTAA	2	8	338291	338298	50 %	50 %	0 %	0 %	480536111
7003	NC_021028	CAG	2	6	338445	338450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480536111
7004	NC_021028	CGC	2	6	338525	338530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	480536111
7005	NC_021028	CAG	2	6	338577	338582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480536111
7006	NC_021028	CTG	2	6	338625	338630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480536111
7007	NC_021028	ATT	2	6	338648	338653	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480536111
7008	NC_021028	GAA	2	6	338705	338710	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536111
7009	NC_021028	AAG	2	6	338739	338744	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536111
7010	NC_021028	CTT	2	6	338761	338766	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480536111
7011	NC_021028	TGA	2	6	338767	338772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536111
7012	NC_021028	CT	4	8	338850	338857	0 %	50 %	0 %	50 %	480536111
7013	NC_021028	CAA	2	6	338883	338888	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480536111
7014	NC_021028	GAA	2	6	338917	338922	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536111
7015	NC_021028	TGC	2	6	338923	338928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480536111
7016	NC_021028	TCG	2	6	338935	338940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480536111
7017	NC_021028	CAG	2	6	338970	338975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480536111
7018	NC_021028	TTC	2	6	338991	338996	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480536111
7019	NC_021028	CAA	2	6	339017	339022	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480536111
7020	NC_021028	CAC	2	6	339023	339028	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480536111
7021	NC_021028	AGC	2	6	339058	339063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480536111
7022	NC_021028	ATT	2	6	339069	339074	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480536111
7023	NC_021028	GCT	2	6	339137	339142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480536111
7024	NC_021028	GGC	2	6	339148	339153	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	480536111
7025	NC_021028	CAAG	2	8	339211	339218	50 %	0 %	25 %	25 %	480536111
7026	NC_021028	AGA	2	6	339235	339240	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536111
7027	NC_021028	AGC	2	6	339247	339252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480536111
7028	NC_021028	GGAAA	2	10	339283	339292	60 %	0 %	40 %	0 %	480536111
7029	NC_021028	CA	3	6	339302	339307	50 %	0 %	0 %	50 %	480536111
7030	NC_021028	CGT	2	6	339488	339493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480536111
7031	NC_021028	TGA	2	6	339508	339513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536111
7032	NC_021028	ACA	2	6	339680	339685	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480536111
7033	NC_021028	ATG	2	6	339702	339707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536111
7034	NC_021028	TCG	2	6	339736	339741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480536111
7035	NC_021028	TTA	2	6	339795	339800	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480536111
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7037	NC_021028	GAT	2	6	339821	339826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536111
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7039	NC_021028	AGA	2	6	339925	339930	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536111
7040	NC_021028	CTT	2	6	339967	339972	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480536111
7041	NC_021028	AAGA	2	8	340088	340095	75 %	0 %	25 %	0 %	480536111
7042	NC_021028	AGTC	2	8	340108	340115	25 %	25 %	25 %	25 %	480536111
7043	NC_021028	AGA	2	6	340138	340143	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536111
7044	NC_021028	ACG	2	6	340149	340154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480536111
7045	NC_021028	A	6	6	340318	340323	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7046	NC_021028	A	7	7	340338	340344	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7047	NC_021028	ACG	2	6	340362	340367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7048	NC_021028	TAG	2	6	340379	340384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7049	NC_021028	TAG	2	6	340414	340419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7050	NC_021028	ATT	2	6	340492	340497	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7051	NC_021028	AGTT	2	8	340520	340527	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7052	NC_021028	CCG	2	6	340531	340536	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7053	NC_021028	GTAC	2	8	340548	340555	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7054	NC_021028	GGT	2	6	340556	340561	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7055	NC_021028	CAT	2	6	340619	340624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536112
7056	NC_021028	AGA	2	6	340670	340675	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536112
7057	NC_021028	AGT	3	9	340734	340742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536112
7058	NC_021028	GAT	2	6	340971	340976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536112
7059	NC_021028	TTC	2	6	340995	341000	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480536112
7060	NC_021028	CTT	2	6	341066	341071	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480536112
7061	NC_021028	TCT	2	6	341097	341102	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7062	NC_021028	AG	3	6	341134	341139	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7063	NC_021028	TTAC	2	8	341173	341180	25 %	50 %	0 %	25 %	480536113
7064	NC_021028	GTA	2	6	341200	341205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536113
7065	NC_021028	TCA	2	6	341255	341260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536113
7066	NC_021028	GAT	2	6	341266	341271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536113
7067	NC_021028	GCTTC	2	10	341282	341291	0 %	40 %	20 %	40 %	480536113
7068	NC_021028	TTC	2	6	341308	341313	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480536113
7069	NC_021028	GCA	2	6	341324	341329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480536113
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7071	NC_021028	GAT	2	6	341406	341411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536113
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7078	NC_021028	CGG	2	6	341738	341743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	480536113
7079	NC_021028	CAG	2	6	341769	341774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480536113
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7081	NC_021028	CAT	2	6	341958	341963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536113
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7085	NC_021028	CAA	2	6	342330	342335	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480536113
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7089	NC_021028	CAACCT	2	12	342450	342461	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	480536113
7090	NC_021028	TGT	2	6	342492	342497	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480536113
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7092	NC_021028	AGC	2	6	342523	342528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480536113
7093	NC_021028	TCT	2	6	342536	342541	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480536113
7094	NC_021028	T	6	6	342649	342654	0 %	100 %	0 %	0 %	480536113
7095	NC_021028	T	6	6	342657	342662	0 %	100 %	0 %	0 %	480536113
7096	NC_021028	TAT	2	6	342675	342680	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7097	NC_021028	A	6	6	342684	342689	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7098	NC_021028	A	6	6	342715	342720	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7099	NC_021028	ATT	2	6	342784	342789	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7100	NC_021028	AAT	2	6	342792	342797	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7101	NC_021028	AAG	2	6	342803	342808	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7102	NC_021028	TGG	2	6	342821	342826	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480536114
7103	NC_021028	ATGGAG	2	12	342876	342887	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	480536114
7104	NC_021028	AGCTA	2	10	342928	342937	40 %	20 %	20 %	20 %	480536114
7105	NC_021028	GAT	2	6	342983	342988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536114
7106	NC_021028	GGA	2	6	343042	343047	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480536114
7107	NC_021028	AAG	2	6	343073	343078	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536114
7108	NC_021028	ATC	2	6	343091	343096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536114
7109	NC_021028	TGG	2	6	343104	343109	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480536114
7110	NC_021028	ACT	2	6	343179	343184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536114
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7112	NC_021028	TGG	2	6	343372	343377	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480536114
7113	NC_021028	AAT	2	6	343433	343438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480536114
7114	NC_021028	ACTCT	2	10	343546	343555	20 %	40 %	0 %	40 %	480536114
7115	NC_021028	CAA	2	6	343681	343686	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480536114
7116	NC_021028	CAGA	2	8	343691	343698	50 %	0 %	25 %	25 %	480536114
7117	NC_021028	AAC	2	6	343736	343741	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480536114
7118	NC_021028	CCTC	2	8	343747	343754	0 %	25 %	0 %	75 %	480536114
7119	NC_021028	GAG	2	6	343862	343867	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480536114
7120	NC_021028	AGA	2	6	343909	343914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536114
7121	NC_021028	TC	3	6	343922	343927	0 %	50 %	0 %	50 %	480536114
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7123	NC_021028	GAT	2	6	344095	344100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536114
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