MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pneumoniae SPN034183 draft genome

Total Repeats: 41473

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_021028	ATG	2	6	264954	264959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5502	NC_021028	ATC	2	6	264972	264977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5503	NC_021028	GCA	2	6	265008	265013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5504	NC_021028	TTA	2	6	265125	265130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5505	NC_021028	AGTA	2	8	265248	265255	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5506	NC_021028	TGAA	2	8	265288	265295	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5507	NC_021028	GGA	2	6	265331	265336	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5508	NC_021028	CTC	2	6	265363	265368	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5509	NC_021028	AAG	2	6	265511	265516	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5510	NC_021028	CTTAA	2	10	265519	265528	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
5511	NC_021028	ATA	2	6	265546	265551	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5512	NC_021028	GGC	2	6	265583	265588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5513	NC_021028	T	7	7	265592	265598	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5514	NC_021028	AATA	2	8	265622	265629	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5515	NC_021028	AGA	2	6	265640	265645	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5516	NC_021028	T	6	6	265709	265714	0 %	100 %	0 %	0 %	480536048
5517	NC_021028	AAGA	2	8	265715	265722	75 %	0 %	25 %	0 %	480536048
5518	NC_021028	CAT	3	9	265771	265779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536048
5519	NC_021028	A	6	6	265802	265807	100 %	0 %	0 %	0 %	480536048
5520	NC_021028	CAA	2	6	265876	265881	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480536048
5521	NC_021028	TTA	2	6	265896	265901	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480536048
5522	NC_021028	AAT	2	6	266012	266017	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480536048
5523	NC_021028	GCCT	2	8	266049	266056	0 %	25 %	25 %	50 %	480536048
5524	NC_021028	AAC	2	6	266102	266107	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480536048
5525	NC_021028	GATT	2	8	266112	266119	25 %	50 %	25 %	0 %	480536048
5526	NC_021028	TGG	2	6	266140	266145	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480536048
5527	NC_021028	ATTG	2	8	266230	266237	25 %	50 %	25 %	0 %	480536048
5528	NC_021028	TTCC	2	8	266327	266334	0 %	50 %	0 %	50 %	480536048
5529	NC_021028	TCG	2	6	266428	266433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480536048
5530	NC_021028	GGA	2	6	266447	266452	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480536048
5531	NC_021028	AGG	2	6	266457	266462	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480536048
5532	NC_021028	CATG	2	8	266589	266596	25 %	25 %	25 %	25 %	480536049
5533	NC_021028	T	6	6	266697	266702	0 %	100 %	0 %	0 %	480536049
5534	NC_021028	CT	3	6	266879	266884	0 %	50 %	0 %	50 %	480536049
5535	NC_021028	GACA	2	8	266907	266914	50 %	0 %	25 %	25 %	480536049
5536	NC_021028	GTG	2	6	266915	266920	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480536049
5537	NC_021028	TTG	2	6	266927	266932	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480536049
5538	NC_021028	TAA	2	6	266976	266981	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480536049
5539	NC_021028	GGT	2	6	267001	267006	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480536049
5540	NC_021028	ACAGT	2	10	267050	267059	40 %	20 %	20 %	20 %	480536049
5541	NC_021028	TGG	2	6	267198	267203	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480536049
5542	NC_021028	GGA	2	6	267280	267285	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5543	NC_021028	ATT	2	6	267328	267333	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480536050
5544	NC_021028	GTG	2	6	267337	267342	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480536050
5545	NC_021028	TGA	2	6	267507	267512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536050
5546	NC_021028	TGA	2	6	267558	267563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536050
5547	NC_021028	TC	3	6	267585	267590	0 %	50 %	0 %	50 %	480536050
5548	NC_021028	A	6	6	267595	267600	100 %	0 %	0 %	0 %	480536050
5549	NC_021028	CCCT	2	8	267614	267621	0 %	25 %	0 %	75 %	480536050
5550	NC_021028	GAA	3	9	267679	267687	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536050
5551	NC_021028	A	6	6	267686	267691	100 %	0 %	0 %	0 %	480536050
5552	NC_021028	GTT	3	9	267841	267849	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480536050
5553	NC_021028	T	6	6	267848	267853	0 %	100 %	0 %	0 %	480536050
5554	NC_021028	GTG	2	6	267875	267880	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480536050
5555	NC_021028	ACAA	2	8	268082	268089	75 %	0 %	0 %	25 %	480536050
5556	NC_021028	GGT	2	6	268177	268182	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480536050
5557	NC_021028	CTG	3	9	268190	268198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480536050
5558	NC_021028	TC	3	6	268215	268220	0 %	50 %	0 %	50 %	480536050
5559	NC_021028	AGT	2	6	268291	268296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536050
5560	NC_021028	TGC	2	6	268299	268304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480536050
5561	NC_021028	CTT	2	6	268332	268337	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480536050
5562	NC_021028	TGG	2	6	268395	268400	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480536050
5563	NC_021028	CCG	2	6	268431	268436	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	480536050
5564	NC_021028	TCA	2	6	268487	268492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536050
5565	NC_021028	TGA	2	6	268502	268507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536050
5566	NC_021028	T	6	6	268540	268545	0 %	100 %	0 %	0 %	480536050
5567	NC_021028	CAG	2	6	268670	268675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480536051
5568	NC_021028	CAT	2	6	268728	268733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536051
5569	NC_021028	CTT	2	6	268783	268788	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480536051
5570	NC_021028	GAA	2	6	268894	268899	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536051
5571	NC_021028	TGA	2	6	268983	268988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536051
5572	NC_021028	CTT	2	6	269008	269013	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480536051
5573	NC_021028	ATG	2	6	269084	269089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536051
5574	NC_021028	AGC	2	6	269097	269102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480536051
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5579	NC_021028	GAA	3	9	269422	269430	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536051
5580	NC_021028	TGA	2	6	269466	269471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536051
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5582	NC_021028	TTG	2	6	269543	269548	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480536051
5583	NC_021028	GAA	3	9	269632	269640	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536051
5584	NC_021028	TGT	2	6	269649	269654	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480536051
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5586	NC_021028	AGCA	2	8	269931	269938	50 %	0 %	25 %	25 %	480536051
5587	NC_021028	ATC	2	6	269980	269985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536051
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5590	NC_021028	GAA	2	6	270160	270165	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536051
5591	NC_021028	AAGC	2	8	270191	270198	50 %	0 %	25 %	25 %	480536051
5592	NC_021028	AACG	2	8	270238	270245	50 %	0 %	25 %	25 %	480536051
5593	NC_021028	A	6	6	270307	270312	100 %	0 %	0 %	0 %	480536051
5594	NC_021028	AGA	2	6	270429	270434	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5595	NC_021028	A	6	6	270444	270449	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5596	NC_021028	T	6	6	270470	270475	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5597	NC_021028	CAGA	2	8	270568	270575	50 %	0 %	25 %	25 %	480536052
5598	NC_021028	CA	3	6	270730	270735	50 %	0 %	0 %	50 %	480536052
5599	NC_021028	GATGGT	2	12	270904	270915	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	480536052
5600	NC_021028	TTTTG	2	10	270961	270970	0 %	80 %	20 %	0 %	480536052
5601	NC_021028	ATG	2	6	271046	271051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536052
5602	NC_021028	CAG	2	6	271116	271121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480536052
5603	NC_021028	CTG	2	6	271214	271219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480536052
5604	NC_021028	TCTT	2	8	271261	271268	0 %	75 %	0 %	25 %	480536052
5605	NC_021028	ATA	2	6	271373	271378	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480536052
5606	NC_021028	ACT	2	6	271400	271405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536052
5607	NC_021028	CTC	2	6	271427	271432	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480536052
5608	NC_021028	AG	3	6	271449	271454	50 %	0 %	50 %	0 %	480536052
5609	NC_021028	GAA	2	6	271630	271635	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536052
5610	NC_021028	GAT	2	6	271663	271668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536052
5611	NC_021028	CTG	2	6	271767	271772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480536052
5612	NC_021028	CGT	2	6	271837	271842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480536052
5613	NC_021028	GAA	2	6	271845	271850	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536052
5614	NC_021028	ATA	2	6	271880	271885	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480536052
5615	NC_021028	CTGA	2	8	271905	271912	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5616	NC_021028	GAAA	2	8	271988	271995	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5617	NC_021028	TA	3	6	272000	272005	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5618	NC_021028	TA	3	6	272081	272086	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5619	NC_021028	TG	3	6	272090	272095	0 %	50 %	50 %	0 %	480536053
5620	NC_021028	TTG	2	6	272099	272104	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480536053
5621	NC_021028	GTT	2	6	272107	272112	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480536053
5622	NC_021028	AAC	2	6	272277	272282	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480536053
5623	NC_021028	GAA	2	6	272413	272418	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536053
5624	NC_021028	CAC	2	6	272431	272436	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480536053
5625	NC_021028	CAGA	2	8	272446	272453	50 %	0 %	25 %	25 %	480536053
5626	NC_021028	GAA	3	9	272491	272499	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536053
5627	NC_021028	A	6	6	272524	272529	100 %	0 %	0 %	0 %	480536053
5628	NC_021028	CAT	2	6	272538	272543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536053
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5631	NC_021028	ATG	2	6	272759	272764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536053
5632	NC_021028	GCTA	2	8	272782	272789	25 %	25 %	25 %	25 %	480536053
5633	NC_021028	ACTTG	2	10	272799	272808	20 %	40 %	20 %	20 %	480536053
5634	NC_021028	TAC	2	6	272836	272841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536053
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5637	NC_021028	GAT	2	6	272902	272907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536053
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5647	NC_021028	CT	3	6	273635	273640	0 %	50 %	0 %	50 %	480536053
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5650	NC_021028	CGA	2	6	273747	273752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480536053
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5652	NC_021028	AAT	2	6	273970	273975	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5655	NC_021028	GGTT	2	8	274135	274142	0 %	50 %	50 %	0 %	480536054
5656	NC_021028	CT	3	6	274408	274413	0 %	50 %	0 %	50 %	480536054
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5872	NC_021028	GGA	2	6	284172	284177	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480536059
5873	NC_021028	ACG	2	6	284251	284256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480536059
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5875	NC_021028	TGA	2	6	284334	284339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536059
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5986	NC_021028	AGG	2	6	290814	290819	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5987	NC_021028	TGC	2	6	290905	290910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480536066
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5994	NC_021028	AAGA	2	8	291428	291435	75 %	0 %	25 %	0 %	480536066
5995	NC_021028	CCA	2	6	291485	291490	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480536066
5996	NC_021028	AAC	2	6	291524	291529	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480536066
5997	NC_021028	CAC	2	6	291552	291557	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480536066
5998	NC_021028	AGA	2	6	291592	291597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536066
5999	NC_021028	CTG	2	6	291624	291629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480536066
6000	NC_021028	TGGT	2	8	291675	291682	0 %	50 %	50 %	0 %	480536066

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