MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pneumoniae SPN034183 draft genome

Total Repeats: 41473

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_021028	AGA	2	6	241505	241510	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536027
5002	NC_021028	TGA	2	6	241594	241599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536027
5003	NC_021028	AAG	2	6	241600	241605	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536027
5004	NC_021028	GAC	2	6	241620	241625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480536027
5005	NC_021028	GAT	2	6	241739	241744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536027
5006	NC_021028	GAA	2	6	241776	241781	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536027
5007	NC_021028	AAACTC	2	12	241785	241796	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	480536027
5008	NC_021028	ATAA	2	8	241822	241829	75 %	25 %	0 %	0 %	480536027
5009	NC_021028	AGG	2	6	241830	241835	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5010	NC_021028	AATC	2	8	241923	241930	50 %	25 %	0 %	25 %	480536028
5011	NC_021028	A	6	6	241974	241979	100 %	0 %	0 %	0 %	480536028
5012	NC_021028	GTG	2	6	241998	242003	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480536028
5013	NC_021028	TGCA	2	8	242007	242014	25 %	25 %	25 %	25 %	480536028
5014	NC_021028	CGT	2	6	242015	242020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480536028
5015	NC_021028	AGC	2	6	242023	242028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480536028
5016	NC_021028	CGTA	2	8	242035	242042	25 %	25 %	25 %	25 %	480536028
5017	NC_021028	ATG	2	6	242064	242069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536028
5018	NC_021028	CTA	2	6	242091	242096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536028
5019	NC_021028	CGT	2	6	242183	242188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480536028
5020	NC_021028	ATC	2	6	242210	242215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536028
5021	NC_021028	ATC	2	6	242229	242234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5022	NC_021028	TTG	2	6	242239	242244	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5023	NC_021028	ATG	3	9	242251	242259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5024	NC_021028	TCA	2	6	242322	242327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5025	NC_021028	TAG	2	6	242338	242343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5026	NC_021028	T	6	6	242363	242368	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5027	NC_021028	AAC	2	6	242375	242380	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5028	NC_021028	AAG	2	6	242470	242475	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5029	NC_021028	TGT	2	6	242508	242513	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480536029
5030	NC_021028	TTG	2	6	242534	242539	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480536029
5031	NC_021028	TC	3	6	242588	242593	0 %	50 %	0 %	50 %	480536029
5032	NC_021028	GAT	2	6	242619	242624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536029
5033	NC_021028	TGT	2	6	242628	242633	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480536029
5034	NC_021028	TGA	2	6	242640	242645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536029
5035	NC_021028	AGG	2	6	242756	242761	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480536029
5036	NC_021028	TCA	2	6	242762	242767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536030
5037	NC_021028	GAG	2	6	242806	242811	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480536030
5038	NC_021028	TGC	2	6	242883	242888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480536030
5039	NC_021028	A	6	6	242903	242908	100 %	0 %	0 %	0 %	480536030
5040	NC_021028	GGC	2	6	242919	242924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	480536030
5041	NC_021028	TAG	2	6	242930	242935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536030
5042	NC_021028	TGA	2	6	242943	242948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536030
5043	NC_021028	TAA	2	6	242979	242984	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480536030
5044	NC_021028	TGG	2	6	243099	243104	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480536030
5045	NC_021028	GAGAT	2	10	243140	243149	40 %	20 %	40 %	0 %	480536030
5046	NC_021028	TCA	2	6	243152	243157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536030
5047	NC_021028	ATTCC	2	10	243158	243167	20 %	40 %	0 %	40 %	480536030
5048	NC_021028	GTCA	2	8	243201	243208	25 %	25 %	25 %	25 %	480536030
5049	NC_021028	GTTG	2	8	243309	243316	0 %	50 %	50 %	0 %	480536030
5050	NC_021028	ATC	2	6	243388	243393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536030
5051	NC_021028	TGGTG	2	10	243414	243423	0 %	40 %	60 %	0 %	480536030
5052	NC_021028	GTA	2	6	243463	243468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536030
5053	NC_021028	TTGG	2	8	243517	243524	0 %	50 %	50 %	0 %	480536030
5054	NC_021028	GA	3	6	243538	243543	50 %	0 %	50 %	0 %	480536030
5055	NC_021028	GGT	2	6	243727	243732	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480536030
5056	NC_021028	TGC	2	6	243777	243782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480536030
5057	NC_021028	CT	3	6	243795	243800	0 %	50 %	0 %	50 %	480536030
5058	NC_021028	TCTGT	2	10	243833	243842	0 %	60 %	20 %	20 %	480536030
5059	NC_021028	TGGAT	2	10	243843	243852	20 %	40 %	40 %	0 %	480536030
5060	NC_021028	AGA	2	6	243867	243872	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536030
5061	NC_021028	CTG	2	6	243878	243883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480536030
5062	NC_021028	AGC	2	6	243912	243917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480536030
5063	NC_021028	ACA	2	6	243940	243945	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480536030
5064	NC_021028	TGG	2	6	243993	243998	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480536030
5065	NC_021028	TC	3	6	244055	244060	0 %	50 %	0 %	50 %	480536030
5066	NC_021028	TAAA	2	8	244161	244168	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5067	NC_021028	CCT	2	6	244171	244176	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5068	NC_021028	ATT	2	6	244180	244185	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5069	NC_021028	TTTA	2	8	244235	244242	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5070	NC_021028	ATA	2	6	244263	244268	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5071	NC_021028	TTTTA	2	10	244300	244309	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5072	NC_021028	TCAT	2	8	244310	244317	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5073	NC_021028	ATA	2	6	244321	244326	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5074	NC_021028	GGA	2	6	244336	244341	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5075	NC_021028	CG	3	6	244408	244413	0 %	0 %	50 %	50 %	480536031
5076	NC_021028	CTG	2	6	244439	244444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480536031
5077	NC_021028	GC	3	6	244506	244511	0 %	0 %	50 %	50 %	480536031
5078	NC_021028	GAA	2	6	244561	244566	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536031
5079	NC_021028	ATG	2	6	244646	244651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536031
5080	NC_021028	ATT	2	6	244669	244674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480536031
5081	NC_021028	AAGG	2	8	244795	244802	50 %	0 %	50 %	0 %	480536031
5082	NC_021028	TTG	2	6	244853	244858	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480536031
5083	NC_021028	GCAT	2	8	244904	244911	25 %	25 %	25 %	25 %	480536031
5084	NC_021028	GAA	2	6	245023	245028	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536031
5085	NC_021028	CTTG	2	8	245051	245058	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5086	NC_021028	A	6	6	245096	245101	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5087	NC_021028	AGG	2	6	245306	245311	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480536032
5088	NC_021028	AG	3	6	245320	245325	50 %	0 %	50 %	0 %	480536032
5089	NC_021028	AAGAT	2	10	245346	245355	60 %	20 %	20 %	0 %	480536032
5090	NC_021028	CAT	2	6	245380	245385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536032
5091	NC_021028	GAC	2	6	245415	245420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480536032
5092	NC_021028	CAG	2	6	245436	245441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480536032
5093	NC_021028	CTT	2	6	245442	245447	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480536032
5094	NC_021028	TGT	2	6	245465	245470	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480536032
5095	NC_021028	TCT	2	6	245506	245511	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480536032
5096	NC_021028	GAAG	2	8	245587	245594	50 %	0 %	50 %	0 %	480536032
5097	NC_021028	TAGG	2	8	245692	245699	25 %	25 %	50 %	0 %	480536032
5098	NC_021028	AAC	2	6	245719	245724	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480536032
5099	NC_021028	ATACC	2	10	245826	245835	40 %	20 %	0 %	40 %	480536032
5100	NC_021028	AGATAA	2	12	245886	245897	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	480536032
5101	NC_021028	T	7	7	245943	245949	0 %	100 %	0 %	0 %	480536032
5102	NC_021028	TGGA	2	8	245959	245966	25 %	25 %	50 %	0 %	480536032
5103	NC_021028	TCC	2	6	246064	246069	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480536032
5104	NC_021028	TAA	2	6	246078	246083	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480536032
5105	NC_021028	CAAG	2	8	246171	246178	50 %	0 %	25 %	25 %	480536033
5106	NC_021028	GCT	2	6	246181	246186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480536033
5107	NC_021028	AAC	2	6	246213	246218	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480536033
5108	NC_021028	GCT	2	6	246259	246264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480536033
5109	NC_021028	TGA	2	6	246413	246418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536033
5110	NC_021028	TTC	2	6	246508	246513	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480536033
5111	NC_021028	CATA	2	8	246524	246531	50 %	25 %	0 %	25 %	480536033
5112	NC_021028	AGT	2	6	246620	246625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5113	NC_021028	AAAG	2	8	246636	246643	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5114	NC_021028	AAGA	2	8	246735	246742	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5115	NC_021028	GAA	2	6	246744	246749	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5116	NC_021028	AGG	2	6	246752	246757	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5117	NC_021028	T	6	6	246774	246779	0 %	100 %	0 %	0 %	480536034
5118	NC_021028	TTC	3	9	246886	246894	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480536034
5119	NC_021028	TTC	2	6	246904	246909	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480536034
5120	NC_021028	CTC	2	6	247057	247062	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480536034
5121	NC_021028	ATA	2	6	247151	247156	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480536034
5122	NC_021028	TTG	2	6	247228	247233	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480536034
5123	NC_021028	CTT	3	9	247281	247289	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480536034
5124	NC_021028	GAG	2	6	247402	247407	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480536034
5125	NC_021028	GTT	3	9	247449	247457	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480536034
5126	NC_021028	CCA	2	6	247460	247465	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480536034
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5128	NC_021028	TTC	2	6	247543	247548	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480536034
5129	NC_021028	CTT	2	6	247558	247563	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480536034
5130	NC_021028	ATT	2	6	247663	247668	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480536034
5131	NC_021028	ATC	2	6	247678	247683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536034
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5139	NC_021028	TAG	2	6	248040	248045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5140	NC_021028	CTT	2	6	248070	248075	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5141	NC_021028	GA	3	6	248076	248081	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5142	NC_021028	TAA	2	6	248082	248087	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5143	NC_021028	T	6	6	248125	248130	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5144	NC_021028	AGC	2	6	248137	248142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5145	NC_021028	CTT	2	6	248166	248171	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5146	NC_021028	CTG	2	6	248217	248222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5147	NC_021028	AG	3	6	248233	248238	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5148	NC_021028	ATC	2	6	248452	248457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5149	NC_021028	ACC	2	6	248464	248469	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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5152	NC_021028	ACC	2	6	248749	248754	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5153	NC_021028	CTT	2	6	248778	248783	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5154	NC_021028	T	6	6	248797	248802	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5155	NC_021028	TTC	2	6	248854	248859	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5156	NC_021028	ACC	2	6	248920	248925	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5157	NC_021028	AGA	2	6	248965	248970	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5158	NC_021028	AGC	2	6	248974	248979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5162	NC_021028	AATT	2	8	249132	249139	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5163	NC_021028	AGA	2	6	249209	249214	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5167	NC_021028	TA	3	6	249441	249446	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5168	NC_021028	TGG	2	6	249511	249516	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480536036
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5189	NC_021028	CTATC	2	10	250292	250301	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
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5229	NC_021028	T	6	6	252155	252160	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5230	NC_021028	TA	3	6	252188	252193	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5231	NC_021028	TGT	2	6	252211	252216	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5232	NC_021028	TAT	2	6	252234	252239	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5233	NC_021028	GAG	2	6	252312	252317	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5240	NC_021028	CT	3	6	252544	252549	0 %	50 %	0 %	50 %	480536039
5241	NC_021028	TTCA	2	8	252553	252560	25 %	50 %	0 %	25 %	480536039
5242	NC_021028	ATC	2	6	252565	252570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536039
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5244	NC_021028	ATT	2	6	252609	252614	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480536039
5245	NC_021028	A	6	6	252636	252641	100 %	0 %	0 %	0 %	480536039
5246	NC_021028	TAT	2	6	252653	252658	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5247	NC_021028	TTA	2	6	252664	252669	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5248	NC_021028	AGG	2	6	252676	252681	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5249	NC_021028	GTTT	2	8	252703	252710	0 %	75 %	25 %	0 %	480536040
5250	NC_021028	GCA	2	6	252714	252719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480536040
5251	NC_021028	ATA	2	6	252745	252750	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480536040
5252	NC_021028	GAT	2	6	252929	252934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536040
5253	NC_021028	A	6	6	252957	252962	100 %	0 %	0 %	0 %	480536040
5254	NC_021028	TAT	2	6	253011	253016	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480536041
5255	NC_021028	GATG	2	8	253023	253030	25 %	25 %	50 %	0 %	480536041
5256	NC_021028	GAT	2	6	253050	253055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536041
5257	NC_021028	AGT	2	6	253122	253127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536041
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5259	NC_021028	TATCTG	2	12	253331	253342	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	480536041
5260	NC_021028	ATC	2	6	253362	253367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536041
5261	NC_021028	GTTTG	2	10	253414	253423	0 %	60 %	40 %	0 %	480536041
5262	NC_021028	GTA	2	6	253462	253467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536041
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5265	NC_021028	TCT	2	6	253585	253590	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480536041
5266	NC_021028	TA	3	6	253598	253603	50 %	50 %	0 %	0 %	480536041
5267	NC_021028	TGG	2	6	253735	253740	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480536041
5268	NC_021028	GTA	2	6	253762	253767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536041
5269	NC_021028	AGT	2	6	253773	253778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536041
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5271	NC_021028	CAA	2	6	253870	253875	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480536041
5272	NC_021028	GCA	2	6	253945	253950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480536041
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5274	NC_021028	TTA	2	6	254221	254226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480536041
5275	NC_021028	TG	3	6	254321	254326	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5276	NC_021028	CA	3	6	254340	254345	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5277	NC_021028	AG	3	6	254361	254366	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5278	NC_021028	TAT	2	6	254413	254418	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5280	NC_021028	GAAA	2	8	254446	254453	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5281	NC_021028	AAC	2	6	254487	254492	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480536042
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5283	NC_021028	A	6	6	254560	254565	100 %	0 %	0 %	0 %	480536042
5284	NC_021028	GA	3	6	254581	254586	50 %	0 %	50 %	0 %	480536042
5285	NC_021028	AAC	2	6	254624	254629	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480536042
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5287	NC_021028	GAAA	2	8	254658	254665	75 %	0 %	25 %	0 %	480536042
5288	NC_021028	TCTA	2	8	254680	254687	25 %	50 %	0 %	25 %	480536042
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5290	NC_021028	CTT	2	6	254723	254728	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480536042
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5302	NC_021028	AT	3	6	255372	255377	50 %	50 %	0 %	0 %	480536042
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5361	NC_021028	TTAT	2	8	257989	257996	25 %	75 %	0 %	0 %	480536044
5362	NC_021028	TTA	2	6	258093	258098	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480536044
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5365	NC_021028	GAA	2	6	258222	258227	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536044
5366	NC_021028	GTG	2	6	258276	258281	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480536044
5367	NC_021028	TTG	2	6	258301	258306	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480536044
5368	NC_021028	GGA	2	6	258345	258350	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480536044
5369	NC_021028	GCG	2	6	258357	258362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	480536044
5370	NC_021028	TCA	2	6	258404	258409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536044
5371	NC_021028	TAT	2	6	258454	258459	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480536044
5372	NC_021028	AGA	2	6	258476	258481	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536044
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