MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pneumoniae SPN994038 draft genome

Total Repeats: 41242

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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37002	NC_021026	TCA	2	6	1823569	1823574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535622
37003	NC_021026	T	7	7	1823575	1823581	0 %	100 %	0 %	0 %	480535622
37004	NC_021026	A	6	6	1823712	1823717	100 %	0 %	0 %	0 %	480535623
37005	NC_021026	T	6	6	1823729	1823734	0 %	100 %	0 %	0 %	480535623
37006	NC_021026	ATG	2	6	1823788	1823793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535623
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37009	NC_021026	CAT	2	6	1823916	1823921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535623
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37012	NC_021026	CTA	2	6	1824166	1824171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535623
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37015	NC_021026	CAT	2	6	1824390	1824395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535623
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37019	NC_021026	TGA	2	6	1824533	1824538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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37021	NC_021026	T	6	6	1824564	1824569	0 %	100 %	0 %	0 %	480535624
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37041	NC_021026	A	6	6	1825550	1825555	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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37113	NC_021026	CTCTT	2	10	1828586	1828595	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
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37241	NC_021026	ATC	2	6	1835274	1835279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535633
37242	NC_021026	CTG	2	6	1835306	1835311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480535633
37243	NC_021026	CTT	2	6	1835324	1835329	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480535633
37244	NC_021026	CTT	2	6	1835372	1835377	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480535633
37245	NC_021026	TTGTT	2	10	1835525	1835534	0 %	80 %	20 %	0 %	480535633
37246	NC_021026	CTT	2	6	1835591	1835596	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480535633
37247	NC_021026	TAA	2	6	1835646	1835651	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480535633
37248	NC_021026	TTCTT	2	10	1835654	1835663	0 %	80 %	0 %	20 %	480535633
37249	NC_021026	A	6	6	1835709	1835714	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37250	NC_021026	A	7	7	1835720	1835726	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37251	NC_021026	TA	3	6	1835966	1835971	50 %	50 %	0 %	0 %	480535634
37252	NC_021026	TAT	2	6	1835977	1835982	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480535634
37253	NC_021026	GTT	2	6	1836116	1836121	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480535634
37254	NC_021026	TA	4	8	1836133	1836140	50 %	50 %	0 %	0 %	480535634
37255	NC_021026	CTG	2	6	1836143	1836148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480535634
37256	NC_021026	TTC	2	6	1836213	1836218	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480535634
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37258	NC_021026	TCT	2	6	1836273	1836278	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480535634
37259	NC_021026	CT	3	6	1836323	1836328	0 %	50 %	0 %	50 %	480535634
37260	NC_021026	T	6	6	1836442	1836447	0 %	100 %	0 %	0 %	480535634
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37266	NC_021026	GTTT	2	8	1836837	1836844	0 %	75 %	25 %	0 %	480535635
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37273	NC_021026	A	6	6	1837248	1837253	100 %	0 %	0 %	0 %	480535635
37274	NC_021026	AG	3	6	1837261	1837266	50 %	0 %	50 %	0 %	480535635
37275	NC_021026	AGAT	2	8	1837349	1837356	50 %	25 %	25 %	0 %	480535635
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37282	NC_021026	TC	3	6	1837736	1837741	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
37283	NC_021026	TGA	2	6	1837746	1837751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37284	NC_021026	CAG	2	6	1837834	1837839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480535636
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37339	NC_021026	TGATT	2	10	1840266	1840275	20 %	60 %	20 %	0 %	480535637
37340	NC_021026	ATT	2	6	1840307	1840312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480535637
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37343	NC_021026	ATC	2	6	1840439	1840444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535637
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37345	NC_021026	ACAA	2	8	1840563	1840570	75 %	0 %	0 %	25 %	480535637
37346	NC_021026	TAA	2	6	1840610	1840615	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480535637
37347	NC_021026	TAC	2	6	1840633	1840638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535637
37348	NC_021026	TAAA	2	8	1840656	1840663	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
37349	NC_021026	ATA	2	6	1840691	1840696	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37350	NC_021026	A	6	6	1840698	1840703	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37351	NC_021026	GAA	2	6	1840709	1840714	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37352	NC_021026	AAC	2	6	1840716	1840721	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37353	NC_021026	ACTAT	2	10	1840731	1840740	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
37354	NC_021026	CGG	2	6	1840743	1840748	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
37355	NC_021026	AAT	2	6	1840904	1840909	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37356	NC_021026	GT	3	6	1840964	1840969	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
37357	NC_021026	CAC	2	6	1840979	1840984	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37358	NC_021026	GGGA	2	8	1841086	1841093	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
37359	NC_021026	CCCGAA	2	12	1841102	1841113	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
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37362	NC_021026	CCG	2	6	1841193	1841198	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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37487	NC_021026	GA	3	6	1848112	1848117	50 %	0 %	50 %	0 %	480535639
37488	NC_021026	CAC	2	6	1848130	1848135	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480535639
37489	NC_021026	CCAA	2	8	1848143	1848150	50 %	0 %	0 %	50 %	480535639
37490	NC_021026	CTTT	2	8	1848190	1848197	0 %	75 %	0 %	25 %	480535639
37491	NC_021026	CTT	2	6	1848245	1848250	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480535639
37492	NC_021026	CCAA	2	8	1848302	1848309	50 %	0 %	0 %	50 %	480535639
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