MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pneumoniae SPN034156 draft genome

Total Repeats: 41289

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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33002	NC_021006	CTT	2	6	1609556	1609561	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480533604
33003	NC_021006	ACA	2	6	1609564	1609569	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480533604
33004	NC_021006	GTC	2	6	1609647	1609652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480533604
33005	NC_021006	GCA	2	6	1609760	1609765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480533604
33006	NC_021006	AAC	2	6	1609797	1609802	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480533604
33007	NC_021006	ATC	2	6	1609880	1609885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480533604
33008	NC_021006	CGGT	2	8	1609977	1609984	0 %	25 %	50 %	25 %	480533604
33009	NC_021006	CAA	2	6	1610072	1610077	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480533604
33010	NC_021006	GAA	2	6	1610141	1610146	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480533604
33011	NC_021006	GAA	2	6	1610177	1610182	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480533604
33012	NC_021006	ATG	2	6	1610319	1610324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480533604
33013	NC_021006	AAG	2	6	1610364	1610369	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480533604
33014	NC_021006	TGA	2	6	1610394	1610399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480533604
33015	NC_021006	GATG	2	8	1610422	1610429	25 %	25 %	50 %	0 %	480533604
33016	NC_021006	GAA	2	6	1610453	1610458	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480533604
33017	NC_021006	T	6	6	1610473	1610478	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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33019	NC_021006	GCAA	2	8	1610504	1610511	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
33020	NC_021006	CAC	2	6	1610595	1610600	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33021	NC_021006	AAG	2	6	1610606	1610611	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33022	NC_021006	AAG	2	6	1610657	1610662	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33023	NC_021006	CTG	2	6	1610679	1610684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33024	NC_021006	AAAG	2	8	1610789	1610796	75 %	0 %	25 %	0 %	480533605
33025	NC_021006	TTA	2	6	1610870	1610875	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480533605
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33027	NC_021006	T	6	6	1611091	1611096	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33028	NC_021006	GGA	2	6	1611100	1611105	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33029	NC_021006	AT	3	6	1611145	1611150	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33030	NC_021006	TTTCA	2	10	1611233	1611242	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
33031	NC_021006	A	6	6	1611247	1611252	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33032	NC_021006	T	6	6	1611264	1611269	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33033	NC_021006	T	7	7	1611293	1611299	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33034	NC_021006	ATA	2	6	1611309	1611314	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33035	NC_021006	A	6	6	1611326	1611331	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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33040	NC_021006	TTA	2	6	1611560	1611565	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480533606
33041	NC_021006	TC	3	6	1611654	1611659	0 %	50 %	0 %	50 %	480533606
33042	NC_021006	TGAGT	2	10	1611721	1611730	20 %	40 %	40 %	0 %	480533606
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33054	NC_021006	GTT	2	6	1612230	1612235	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480533607
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33062	NC_021006	TATAA	2	10	1612531	1612540	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
33063	NC_021006	TA	3	6	1612603	1612608	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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33065	NC_021006	ATC	2	6	1612784	1612789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480533609
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33099	NC_021006	TTTTA	2	10	1615255	1615264	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
33100	NC_021006	GGT	2	6	1615297	1615302	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33101	NC_021006	CTTTT	2	10	1615346	1615355	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
33102	NC_021006	AGG	2	6	1615369	1615374	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33103	NC_021006	TAA	2	6	1615400	1615405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33104	NC_021006	TAT	2	6	1615410	1615415	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33105	NC_021006	TTTTA	2	10	1615427	1615436	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
33106	NC_021006	GA	4	8	1615526	1615533	50 %	0 %	50 %	0 %	480533613
33107	NC_021006	GCAGA	2	10	1615539	1615548	40 %	0 %	40 %	20 %	480533613
33108	NC_021006	TGA	2	6	1615583	1615588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480533613
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33112	NC_021006	TTG	2	6	1615789	1615794	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480533613
33113	NC_021006	TCA	2	6	1615921	1615926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480533613
33114	NC_021006	A	6	6	1615926	1615931	100 %	0 %	0 %	0 %	480533613
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33118	NC_021006	TAT	2	6	1616104	1616109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480533614
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33120	NC_021006	CAG	2	6	1616153	1616158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480533614
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33122	NC_021006	GAT	2	6	1616227	1616232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480533614
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33219	NC_021006	TAA	2	6	1621821	1621826	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33220	NC_021006	AAG	2	6	1621917	1621922	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33221	NC_021006	CAT	2	6	1621928	1621933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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33223	NC_021006	TTGT	2	8	1622088	1622095	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
33224	NC_021006	CTT	2	6	1622278	1622283	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33225	NC_021006	TAG	3	9	1622505	1622513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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33227	NC_021006	TCTT	2	8	1622590	1622597	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
33228	NC_021006	TCC	2	6	1622609	1622614	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33229	NC_021006	T	6	6	1622636	1622641	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33230	NC_021006	CT	5	10	1622668	1622677	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33231	NC_021006	CAA	2	6	1622686	1622691	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33232	NC_021006	AAG	2	6	1622729	1622734	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33233	NC_021006	T	6	6	1622844	1622849	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33234	NC_021006	T	6	6	1622852	1622857	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33235	NC_021006	ATCA	2	8	1622879	1622886	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
33236	NC_021006	ATTT	2	8	1622926	1622933	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
33237	NC_021006	ATC	2	6	1622987	1622992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33238	NC_021006	AGTT	2	8	1622996	1623003	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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