MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pneumoniae SPN034156 draft genome

Total Repeats: 41289

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
31001	NC_021006	TAT	2	6	1512764	1512769	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31002	NC_021006	T	7	7	1512772	1512778	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31003	NC_021006	GATA	2	8	1512808	1512815	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
31004	NC_021006	CTTTTT	2	12	1512823	1512834	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	480533524
31005	NC_021006	TTC	2	6	1512839	1512844	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480533524
31006	NC_021006	GAG	2	6	1512943	1512948	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480533524
31007	NC_021006	AGG	2	6	1512984	1512989	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480533524
31008	NC_021006	TC	3	6	1512992	1512997	0 %	50 %	0 %	50 %	480533524
31009	NC_021006	TTC	2	6	1513061	1513066	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480533524
31010	NC_021006	AGC	2	6	1513338	1513343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480533525
31011	NC_021006	ACGG	2	8	1513365	1513372	25 %	0 %	50 %	25 %	480533525
31012	NC_021006	AGAT	2	8	1513438	1513445	50 %	25 %	25 %	0 %	480533525
31013	NC_021006	CTG	2	6	1513448	1513453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480533525
31014	NC_021006	TTC	2	6	1513458	1513463	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480533525
31015	NC_021006	TAGCAA	2	12	1513565	1513576	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	480533525
31016	NC_021006	T	6	6	1513580	1513585	0 %	100 %	0 %	0 %	480533525
31017	NC_021006	GTT	2	6	1513619	1513624	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480533525
31018	NC_021006	TCAAC	2	10	1513823	1513832	40 %	20 %	0 %	40 %	480533526
31019	NC_021006	AGT	2	6	1513833	1513838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480533526
31020	NC_021006	ATA	2	6	1514023	1514028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480533526
31021	NC_021006	TAA	2	6	1514233	1514238	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31022	NC_021006	ATT	2	6	1514241	1514246	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31023	NC_021006	AGA	2	6	1514310	1514315	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31024	NC_021006	A	6	6	1514315	1514320	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31025	NC_021006	TCTA	2	8	1514343	1514350	25 %	50 %	0 %	25 %	480533527
31026	NC_021006	TTTC	2	8	1514353	1514360	0 %	75 %	0 %	25 %	480533527
31027	NC_021006	AGT	2	6	1514382	1514387	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480533527
31028	NC_021006	TTGGC	2	10	1514406	1514415	0 %	40 %	40 %	20 %	480533527
31029	NC_021006	CAG	2	6	1514488	1514493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480533527
31030	NC_021006	TGG	2	6	1514514	1514519	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480533527
31031	NC_021006	CG	3	6	1514583	1514588	0 %	0 %	50 %	50 %	480533527
31032	NC_021006	GAT	2	6	1514657	1514662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480533527
31033	NC_021006	CAC	2	6	1514779	1514784	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480533527
31034	NC_021006	AAG	2	6	1514805	1514810	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480533527
31035	NC_021006	TTA	2	6	1514823	1514828	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480533527
31036	NC_021006	ACG	2	6	1514885	1514890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480533527
31037	NC_021006	CAG	2	6	1514989	1514994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480533527
31038	NC_021006	CCTT	2	8	1514997	1515004	0 %	50 %	0 %	50 %	480533527
31039	NC_021006	GTT	2	6	1515021	1515026	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480533527
31040	NC_021006	ACC	2	6	1515068	1515073	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480533527
31041	NC_021006	GAA	2	6	1515079	1515084	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480533527
31042	NC_021006	TTC	2	6	1515147	1515152	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480533527
31043	NC_021006	CTT	2	6	1515226	1515231	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480533527
31044	NC_021006	CCT	2	6	1515298	1515303	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480533527
31045	NC_021006	TCAA	2	8	1515336	1515343	50 %	25 %	0 %	25 %	480533527
31046	NC_021006	TCT	2	6	1515459	1515464	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480533527
31047	NC_021006	TCA	2	6	1515501	1515506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480533527
31048	NC_021006	AGT	2	6	1515547	1515552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480533527
31049	NC_021006	T	7	7	1515571	1515577	0 %	100 %	0 %	0 %	480533527
31050	NC_021006	AGC	2	6	1515602	1515607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480533527
31051	NC_021006	CAA	2	6	1515622	1515627	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480533527
31052	NC_021006	GTT	3	9	1515816	1515824	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480533528
31053	NC_021006	TGT	2	6	1515835	1515840	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480533528
31054	NC_021006	AGC	4	12	1515850	1515861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480533528
31055	NC_021006	CAAT	2	8	1515894	1515901	50 %	25 %	0 %	25 %	480533528
31056	NC_021006	GA	3	6	1515924	1515929	50 %	0 %	50 %	0 %	480533528
31057	NC_021006	CAG	2	6	1515933	1515938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480533528
31058	NC_021006	GA	3	6	1516021	1516026	50 %	0 %	50 %	0 %	480533528
31059	NC_021006	AAATC	2	10	1516065	1516074	60 %	20 %	0 %	20 %	480533528
31060	NC_021006	CTT	2	6	1516132	1516137	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480533528
31061	NC_021006	GTA	2	6	1516138	1516143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480533528
31062	NC_021006	GTA	2	6	1516150	1516155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480533528
31063	NC_021006	TGA	2	6	1516159	1516164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480533528
31064	NC_021006	CTT	2	6	1516200	1516205	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480533528
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31068	NC_021006	TGA	2	6	1516318	1516323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480533528
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31083	NC_021006	TAG	2	6	1517299	1517304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480533529
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31085	NC_021006	GTA	2	6	1517401	1517406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480533529
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31088	NC_021006	GCA	2	6	1517482	1517487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480533529
31089	NC_021006	TCT	2	6	1517491	1517496	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480533529
31090	NC_021006	GT	3	6	1517529	1517534	0 %	50 %	50 %	0 %	480533529
31091	NC_021006	CTT	2	6	1517540	1517545	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480533529
31092	NC_021006	ATG	2	6	1517577	1517582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31093	NC_021006	AGGG	2	8	1517624	1517631	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
31094	NC_021006	AGAAAT	2	12	1517642	1517653	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31095	NC_021006	A	7	7	1517656	1517662	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31096	NC_021006	AAAG	2	8	1517756	1517763	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
31097	NC_021006	AAG	2	6	1517781	1517786	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480533530
31098	NC_021006	CGT	2	6	1517798	1517803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480533530
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31100	NC_021006	GAA	2	6	1517905	1517910	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480533530
31101	NC_021006	TGGA	2	8	1517936	1517943	25 %	25 %	50 %	0 %	480533530
31102	NC_021006	ACG	2	6	1517997	1518002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480533530
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31105	NC_021006	GAA	2	6	1518236	1518241	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480533530
31106	NC_021006	GCTA	2	8	1518254	1518261	25 %	25 %	25 %	25 %	480533530
31107	NC_021006	AGA	2	6	1518367	1518372	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480533530
31108	NC_021006	CTGG	2	8	1518473	1518480	0 %	25 %	50 %	25 %	480533530
31109	NC_021006	CCTT	2	8	1518534	1518541	0 %	50 %	0 %	50 %	480533530
31110	NC_021006	TCGTA	2	10	1518691	1518700	20 %	40 %	20 %	20 %	480533530
31111	NC_021006	A	6	6	1518883	1518888	100 %	0 %	0 %	0 %	480533530
31112	NC_021006	TTTGAA	2	12	1518893	1518904	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	480533530
31113	NC_021006	AAG	2	6	1519002	1519007	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480533530
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31115	NC_021006	CGTT	2	8	1519150	1519157	0 %	50 %	25 %	25 %	480533530
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31117	NC_021006	ACCA	2	8	1519227	1519234	50 %	0 %	0 %	50 %	480533530
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31119	NC_021006	TTG	2	6	1519349	1519354	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31120	NC_021006	ACTA	2	8	1519393	1519400	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
31121	NC_021006	TAA	2	6	1519445	1519450	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31122	NC_021006	GGC	2	6	1519465	1519470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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31124	NC_021006	GTAG	2	8	1519542	1519549	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
31125	NC_021006	ACTA	2	8	1519566	1519573	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
31126	NC_021006	ACGA	2	8	1519673	1519680	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
31127	NC_021006	AAT	2	6	1519690	1519695	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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31141	NC_021006	A	6	6	1520261	1520266	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31142	NC_021006	AGG	2	6	1520330	1520335	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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31197	NC_021006	T	6	6	1522760	1522765	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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31227	NC_021006	GGT	2	6	1524322	1524327	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480533535
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31232	NC_021006	ATG	2	6	1524781	1524786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480533536
31233	NC_021006	ATC	2	6	1524798	1524803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480533536
31234	NC_021006	AG	3	6	1524910	1524915	50 %	0 %	50 %	0 %	480533536
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31478	NC_021006	T	7	7	1537602	1537608	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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31481	NC_021006	AGAAA	2	10	1537650	1537659	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
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