MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pneumoniae SPN034156 draft genome

Total Repeats: 41289

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
24501	NC_021006	AAT	2	6	1196620	1196625	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24502	NC_021006	CCG	2	6	1196628	1196633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
24503	NC_021006	GAT	2	6	1196651	1196656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24504	NC_021006	TGG	2	6	1196718	1196723	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24505	NC_021006	CTG	2	6	1196724	1196729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24506	NC_021006	TTG	2	6	1196753	1196758	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480533238
24507	NC_021006	GAA	2	6	1196776	1196781	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480533238
24508	NC_021006	CAT	3	9	1196799	1196807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480533238
24509	NC_021006	A	6	6	1196837	1196842	100 %	0 %	0 %	0 %	480533238
24510	NC_021006	CAG	2	6	1196843	1196848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480533238
24511	NC_021006	GTT	2	6	1196887	1196892	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480533238
24512	NC_021006	AGA	2	6	1196931	1196936	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480533238
24513	NC_021006	ATC	3	9	1196959	1196967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480533238
24514	NC_021006	TGG	2	6	1196976	1196981	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480533238
24515	NC_021006	AAC	2	6	1197015	1197020	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480533238
24516	NC_021006	AGTGG	2	10	1197061	1197070	20 %	20 %	60 %	0 %	480533238
24517	NC_021006	GGGTG	2	10	1197099	1197108	0 %	20 %	80 %	0 %	480533238
24518	NC_021006	CT	3	6	1197155	1197160	0 %	50 %	0 %	50 %	480533238
24519	NC_021006	CT	3	6	1197175	1197180	0 %	50 %	0 %	50 %	480533238
24520	NC_021006	AGA	2	6	1197183	1197188	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480533238
24521	NC_021006	GAA	2	6	1197223	1197228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480533238
24522	NC_021006	GTC	2	6	1197249	1197254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480533238
24523	NC_021006	GAT	2	6	1197307	1197312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480533239
24524	NC_021006	GCG	2	6	1197362	1197367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	480533239
24525	NC_021006	TGG	2	6	1197688	1197693	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480533239
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24528	NC_021006	CAG	2	6	1197774	1197779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480533239
24529	NC_021006	GAA	2	6	1197791	1197796	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480533239
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24532	NC_021006	TAG	2	6	1197936	1197941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480533239
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24534	NC_021006	CT	3	6	1197996	1198001	0 %	50 %	0 %	50 %	480533239
24535	NC_021006	TGA	3	9	1198021	1198029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480533239
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24545	NC_021006	CTAT	2	8	1198509	1198516	25 %	50 %	0 %	25 %	480533240
24546	NC_021006	AAG	2	6	1198634	1198639	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24547	NC_021006	GAA	2	6	1198702	1198707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480533241
24548	NC_021006	AATA	2	8	1198708	1198715	75 %	25 %	0 %	0 %	480533241
24549	NC_021006	GCTTG	2	10	1198720	1198729	0 %	40 %	40 %	20 %	480533241
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24551	NC_021006	AAG	2	6	1198804	1198809	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480533241
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24573	NC_021006	A	6	6	1199958	1199963	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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24589	NC_021006	ATA	2	6	1200659	1200664	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480533242
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24607	NC_021006	GTA	2	6	1201483	1201488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480533242
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24611	NC_021006	AGCAT	2	10	1201697	1201706	40 %	20 %	20 %	20 %	480533242
24612	NC_021006	TCG	2	6	1201814	1201819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480533242
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24614	NC_021006	T	6	6	1201849	1201854	0 %	100 %	0 %	0 %	480533242
24615	NC_021006	TCA	2	6	1201859	1201864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480533242
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24617	NC_021006	CTT	4	12	1202073	1202084	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480533242
24618	NC_021006	GTT	2	6	1202110	1202115	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480533242
24619	NC_021006	TTG	2	6	1202158	1202163	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480533242
24620	NC_021006	GA	3	6	1202185	1202190	50 %	0 %	50 %	0 %	480533242
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24622	NC_021006	TGCT	2	8	1202272	1202279	0 %	50 %	25 %	25 %	480533242
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24665	NC_021006	A	6	6	1204096	1204101	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24666	NC_021006	AT	5	10	1204105	1204114	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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24736	NC_021006	TGC	2	6	1207978	1207983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480533246
24737	NC_021006	ACT	2	6	1208019	1208024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480533246
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24849	NC_021006	TGTA	2	8	1213919	1213926	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
24850	NC_021006	TAT	2	6	1214002	1214007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24851	NC_021006	GA	3	6	1214009	1214014	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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24853	NC_021006	CTC	2	6	1214250	1214255	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24854	NC_021006	ATT	2	6	1214259	1214264	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480533253
24855	NC_021006	ACC	2	6	1214290	1214295	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480533253
24856	NC_021006	CTC	2	6	1214358	1214363	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480533253
24857	NC_021006	TGCT	2	8	1214627	1214634	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
24858	NC_021006	T	6	6	1214696	1214701	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24859	NC_021006	TCA	2	6	1214709	1214714	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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24862	NC_021006	TGA	2	6	1214812	1214817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24863	NC_021006	GT	3	6	1214878	1214883	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
24864	NC_021006	GAG	2	6	1214900	1214905	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24865	NC_021006	GAG	2	6	1215000	1215005	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24866	NC_021006	GTCT	2	8	1215006	1215013	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
24867	NC_021006	GCTCC	2	10	1215031	1215040	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
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24873	NC_021006	GCTGT	2	10	1215349	1215358	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
24874	NC_021006	TTG	2	6	1215423	1215428	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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24879	NC_021006	T	6	6	1215961	1215966	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24880	NC_021006	T	6	6	1216027	1216032	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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24977	NC_021006	A	6	6	1221415	1221420	100 %	0 %	0 %	0 %	480533256
24978	NC_021006	CAG	2	6	1221506	1221511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480533256
24979	NC_021006	CCTA	2	8	1221512	1221519	25 %	25 %	0 %	50 %	480533256
24980	NC_021006	CAG	2	6	1221548	1221553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480533256
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24982	NC_021006	A	6	6	1221871	1221876	100 %	0 %	0 %	0 %	480533256
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24984	NC_021006	CCTA	2	8	1221968	1221975	25 %	25 %	0 %	50 %	480533256
24985	NC_021006	CAG	2	6	1222004	1222009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480533256
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24988	NC_021006	TAC	2	6	1222443	1222448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480533256
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24991	NC_021006	GAT	2	6	1222539	1222544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480533256
24992	NC_021006	GCTTGC	2	12	1222617	1222628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480533256
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24997	NC_021006	AAC	2	6	1222726	1222731	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24998	NC_021006	CTTT	2	8	1222749	1222756	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
24999	NC_021006	ATC	2	6	1222772	1222777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25000	NC_021006	GA	3	6	1222835	1222840	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding

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