MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pneumoniae SPN034156 draft genome

Total Repeats: 41289

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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24003	NC_021006	GCTG	2	8	1170747	1170754	0 %	25 %	50 %	25 %	480533218
24004	NC_021006	AGA	2	6	1170770	1170775	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480533218
24005	NC_021006	CTTC	2	8	1170821	1170828	0 %	50 %	0 %	50 %	480533218
24006	NC_021006	TTC	2	6	1170910	1170915	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480533218
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24008	NC_021006	CAG	2	6	1170973	1170978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480533218
24009	NC_021006	TTG	2	6	1171025	1171030	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480533218
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24011	NC_021006	TTG	2	6	1171132	1171137	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24012	NC_021006	TGT	2	6	1171158	1171163	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24013	NC_021006	AAT	2	6	1171208	1171213	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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24017	NC_021006	TGA	2	6	1171357	1171362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480533219
24018	NC_021006	AAT	2	6	1171377	1171382	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480533219
24019	NC_021006	T	6	6	1171498	1171503	0 %	100 %	0 %	0 %	480533219
24020	NC_021006	AATCA	2	10	1171572	1171581	60 %	20 %	0 %	20 %	480533219
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24022	NC_021006	TCC	2	6	1171622	1171627	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24023	NC_021006	AATT	2	8	1171677	1171684	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24024	NC_021006	TAT	2	6	1171715	1171720	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24025	NC_021006	AT	3	6	1171728	1171733	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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24088	NC_021006	TAGA	2	8	1175174	1175181	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
24089	NC_021006	AT	3	6	1175515	1175520	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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24093	NC_021006	ACT	2	6	1175753	1175758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480533222
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24122	NC_021006	TTG	2	6	1177141	1177146	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480533223
24123	NC_021006	TGT	2	6	1177328	1177333	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480533223
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24235	NC_021006	ATGG	2	8	1182617	1182624	25 %	25 %	50 %	0 %	480533228
24236	NC_021006	TTTAC	2	10	1182669	1182678	20 %	60 %	0 %	20 %	480533228
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24240	NC_021006	TGA	2	6	1182810	1182815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480533228
24241	NC_021006	GA	3	6	1182819	1182824	50 %	0 %	50 %	0 %	480533228
24242	NC_021006	GAC	2	6	1182943	1182948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480533228
24243	NC_021006	GAT	2	6	1182958	1182963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480533228
24244	NC_021006	GTG	2	6	1183005	1183010	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480533228
24245	NC_021006	TCAATC	2	12	1183011	1183022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480533228
24246	NC_021006	A	6	6	1183031	1183036	100 %	0 %	0 %	0 %	480533228
24247	NC_021006	TCT	2	6	1183105	1183110	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480533228
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24249	NC_021006	GAC	2	6	1183129	1183134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480533228
24250	NC_021006	CAGA	2	8	1183208	1183215	50 %	0 %	25 %	25 %	480533228
24251	NC_021006	GGT	2	6	1183244	1183249	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480533228
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24253	NC_021006	GGT	2	6	1183432	1183437	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480533228
24254	NC_021006	GAA	2	6	1183463	1183468	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480533228
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24256	NC_021006	AGAGG	2	10	1183531	1183540	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
24257	NC_021006	TCG	2	6	1183579	1183584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480533229
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24264	NC_021006	A	7	7	1183875	1183881	100 %	0 %	0 %	0 %	480533229
24265	NC_021006	AAG	2	6	1183911	1183916	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480533229
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24284	NC_021006	T	6	6	1185012	1185017	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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24301	NC_021006	AAC	2	6	1185911	1185916	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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24305	NC_021006	ATG	2	6	1186093	1186098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480533231
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24470	NC_021006	TTTC	2	8	1195019	1195026	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
24471	NC_021006	T	6	6	1195028	1195033	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24472	NC_021006	T	6	6	1195071	1195076	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24473	NC_021006	AAT	2	6	1195092	1195097	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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24475	NC_021006	TGG	2	6	1195140	1195145	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480533237
24476	NC_021006	ATG	2	6	1195217	1195222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480533237
24477	NC_021006	ATTG	2	8	1195278	1195285	25 %	50 %	25 %	0 %	480533237
24478	NC_021006	ATG	2	6	1195301	1195306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480533237
24479	NC_021006	GAT	2	6	1195330	1195335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480533237
24480	NC_021006	TGC	2	6	1195341	1195346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480533237
24481	NC_021006	GAT	2	6	1195357	1195362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480533237
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24488	NC_021006	AAG	2	6	1195895	1195900	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480533237
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24491	NC_021006	TCA	2	6	1196183	1196188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480533237
24492	NC_021006	CTA	2	6	1196190	1196195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480533237
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24496	NC_021006	A	6	6	1196324	1196329	100 %	0 %	0 %	0 %	480533237
24497	NC_021006	GCAAG	2	10	1196363	1196372	40 %	0 %	40 %	20 %	480533237
24498	NC_021006	GTC	2	6	1196422	1196427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24499	NC_021006	GTG	2	6	1196428	1196433	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24500	NC_021006	AAAAAT	2	12	1196554	1196565	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

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