MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pneumoniae SPN034156 draft genome

Total Repeats: 41289

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
23501	NC_021006	TTC	2	6	1145698	1145703	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23502	NC_021006	A	6	6	1145722	1145727	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23503	NC_021006	ATG	2	6	1145732	1145737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23504	NC_021006	GGTT	2	8	1145770	1145777	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
23505	NC_021006	ATG	2	6	1145807	1145812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23506	NC_021006	TCA	2	6	1145828	1145833	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23507	NC_021006	TGC	2	6	1145859	1145864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23508	NC_021006	GAT	2	6	1145928	1145933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23509	NC_021006	T	6	6	1145948	1145953	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23510	NC_021006	TG	3	6	1146040	1146045	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
23511	NC_021006	GTG	2	6	1146185	1146190	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23512	NC_021006	TGA	2	6	1146194	1146199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23513	NC_021006	ATGA	2	8	1146221	1146228	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
23514	NC_021006	TAT	2	6	1146234	1146239	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23515	NC_021006	CAA	2	6	1146265	1146270	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23516	NC_021006	AGT	2	6	1146301	1146306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23517	NC_021006	GTCA	2	8	1146377	1146384	25 %	25 %	25 %	25 %	480533192
23518	NC_021006	AGG	2	6	1146442	1146447	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23519	NC_021006	GAAAC	2	10	1146480	1146489	60 %	0 %	20 %	20 %	480533193
23520	NC_021006	TAA	2	6	1146597	1146602	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480533193
23521	NC_021006	TCTAA	2	10	1146823	1146832	40 %	40 %	0 %	20 %	480533193
23522	NC_021006	GA	3	6	1146846	1146851	50 %	0 %	50 %	0 %	480533193
23523	NC_021006	GAA	2	6	1146901	1146906	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480533193
23524	NC_021006	TGA	2	6	1146915	1146920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480533193
23525	NC_021006	AGT	2	6	1146921	1146926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480533193
23526	NC_021006	TCA	2	6	1146935	1146940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480533193
23527	NC_021006	ATCCAG	2	12	1146941	1146952	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	480533193
23528	NC_021006	A	7	7	1147030	1147036	100 %	0 %	0 %	0 %	480533193
23529	NC_021006	GAA	2	6	1147050	1147055	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480533193
23530	NC_021006	CAG	2	6	1147198	1147203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480533193
23531	NC_021006	CAA	2	6	1147317	1147322	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480533193
23532	NC_021006	AAC	2	6	1147333	1147338	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480533193
23533	NC_021006	ACTT	2	8	1147397	1147404	25 %	50 %	0 %	25 %	480533193
23534	NC_021006	CTCTT	2	10	1147444	1147453	0 %	60 %	0 %	40 %	480533193
23535	NC_021006	ACA	2	6	1147454	1147459	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480533193
23536	NC_021006	CTG	2	6	1147472	1147477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480533193
23537	NC_021006	CAA	2	6	1147483	1147488	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480533193
23538	NC_021006	TGC	2	6	1147500	1147505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480533193
23539	NC_021006	CGT	2	6	1147510	1147515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480533193
23540	NC_021006	TCCTGA	2	12	1147545	1147556	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	480533193
23541	NC_021006	GA	3	6	1147684	1147689	50 %	0 %	50 %	0 %	480533194
23542	NC_021006	AGA	3	9	1147687	1147695	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480533194
23543	NC_021006	TGA	2	6	1147735	1147740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480533194
23544	NC_021006	TTTA	2	8	1147825	1147832	25 %	75 %	0 %	0 %	480533194
23545	NC_021006	ATG	2	6	1147836	1147841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480533194
23546	NC_021006	TGA	2	6	1147891	1147896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480533194
23547	NC_021006	ATC	2	6	1147916	1147921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480533194
23548	NC_021006	GAT	2	6	1147931	1147936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480533194
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23550	NC_021006	TGC	2	6	1148122	1148127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480533194
23551	NC_021006	AAGA	2	8	1148186	1148193	75 %	0 %	25 %	0 %	480533194
23552	NC_021006	AGTTG	2	10	1148268	1148277	20 %	40 %	40 %	0 %	480533195
23553	NC_021006	GAA	2	6	1148278	1148283	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480533195
23554	NC_021006	GAA	2	6	1148290	1148295	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480533195
23555	NC_021006	GTT	2	6	1148311	1148316	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480533195
23556	NC_021006	ATG	2	6	1148345	1148350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480533195
23557	NC_021006	AAG	2	6	1148351	1148356	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480533195
23558	NC_021006	GAA	2	6	1148401	1148406	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480533195
23559	NC_021006	AAG	2	6	1148408	1148413	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480533195
23560	NC_021006	GAA	2	6	1148503	1148508	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480533195
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23562	NC_021006	TTAC	2	8	1148550	1148557	25 %	50 %	0 %	25 %	480533195
23563	NC_021006	AAG	2	6	1148564	1148569	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480533195
23564	NC_021006	TGA	2	6	1148624	1148629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480533195
23565	NC_021006	AAG	2	6	1148636	1148641	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480533195
23566	NC_021006	ACAAG	2	10	1148646	1148655	60 %	0 %	20 %	20 %	480533195
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23568	NC_021006	AACC	2	8	1148783	1148790	50 %	0 %	0 %	50 %	480533195
23569	NC_021006	CGT	2	6	1148821	1148826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480533195
23570	NC_021006	TGA	2	6	1148856	1148861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480533195
23571	NC_021006	AAAC	2	8	1148893	1148900	75 %	0 %	0 %	25 %	480533195
23572	NC_021006	TAC	2	6	1149022	1149027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480533195
23573	NC_021006	GCT	2	6	1149061	1149066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480533195
23574	NC_021006	CAAGGA	2	12	1149078	1149089	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	480533195
23575	NC_021006	TTG	2	6	1149155	1149160	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480533195
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23578	NC_021006	GTA	2	6	1149322	1149327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480533195
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23580	NC_021006	TA	3	6	1149397	1149402	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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23582	NC_021006	TGA	2	6	1149550	1149555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480533196
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23585	NC_021006	GTA	2	6	1149624	1149629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480533196
23586	NC_021006	GAG	2	6	1149654	1149659	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480533196
23587	NC_021006	ATT	2	6	1149679	1149684	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23588	NC_021006	CAA	2	6	1149714	1149719	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23589	NC_021006	ATC	2	6	1149746	1149751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480533197
23590	NC_021006	AGA	2	6	1149772	1149777	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480533197
23591	NC_021006	AGA	2	6	1149811	1149816	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480533197
23592	NC_021006	GGGTG	2	10	1149856	1149865	0 %	20 %	80 %	0 %	480533197
23593	NC_021006	A	7	7	1149963	1149969	100 %	0 %	0 %	0 %	480533198
23594	NC_021006	TAC	2	6	1149988	1149993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480533198
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23597	NC_021006	GCAA	2	8	1150153	1150160	50 %	0 %	25 %	25 %	480533198
23598	NC_021006	CCTAT	2	10	1150177	1150186	20 %	40 %	0 %	40 %	480533198
23599	NC_021006	TGA	2	6	1150279	1150284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480533199
23600	NC_021006	GAA	2	6	1150292	1150297	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480533199
23601	NC_021006	TGA	2	6	1150324	1150329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480533199
23602	NC_021006	AGA	2	6	1150395	1150400	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480533199
23603	NC_021006	TGT	2	6	1150420	1150425	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480533199
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23606	NC_021006	TGC	2	6	1150590	1150595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480533200
23607	NC_021006	ACCT	2	8	1150658	1150665	25 %	25 %	0 %	50 %	480533200
23608	NC_021006	TAT	2	6	1150675	1150680	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480533200
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23612	NC_021006	GAA	2	6	1150780	1150785	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480533200
23613	NC_021006	T	6	6	1150819	1150824	0 %	100 %	0 %	0 %	480533200
23614	NC_021006	AAG	2	6	1150832	1150837	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480533200
23615	NC_021006	TCTA	2	8	1150883	1150890	25 %	50 %	0 %	25 %	480533200
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23987	NC_021006	T	6	6	1170266	1170271	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23988	NC_021006	AATA	2	8	1170275	1170282	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
23989	NC_021006	TAG	2	6	1170285	1170290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23990	NC_021006	ATA	2	6	1170327	1170332	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23991	NC_021006	AGA	2	6	1170338	1170343	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23992	NC_021006	TCA	2	6	1170358	1170363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23993	NC_021006	CAT	2	6	1170378	1170383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23994	NC_021006	TAG	2	6	1170431	1170436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23995	NC_021006	TTC	2	6	1170490	1170495	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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23998	NC_021006	TG	3	6	1170557	1170562	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
23999	NC_021006	TGA	2	6	1170572	1170577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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