MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pneumoniae SPN034156 draft genome

Total Repeats: 41289

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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23002	NC_021006	ATT	2	6	1122293	1122298	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480533164
23003	NC_021006	ATT	2	6	1122337	1122342	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480533164
23004	NC_021006	AGA	2	6	1122412	1122417	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480533164
23005	NC_021006	ATG	2	6	1122438	1122443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480533164
23006	NC_021006	ATGA	2	8	1122458	1122465	50 %	25 %	25 %	0 %	480533164
23007	NC_021006	GA	3	6	1122480	1122485	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
23008	NC_021006	CT	3	6	1122495	1122500	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23009	NC_021006	T	6	6	1122500	1122505	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23010	NC_021006	GAA	2	6	1122615	1122620	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480533165
23011	NC_021006	AAG	2	6	1122691	1122696	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480533165
23012	NC_021006	TAG	2	6	1122722	1122727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480533165
23013	NC_021006	AGA	2	6	1122728	1122733	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480533165
23014	NC_021006	GAA	2	6	1122855	1122860	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480533165
23015	NC_021006	GAGG	2	8	1122888	1122895	25 %	0 %	75 %	0 %	480533165
23016	NC_021006	GAT	2	6	1122906	1122911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480533165
23017	NC_021006	TAT	2	6	1122912	1122917	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480533165
23018	NC_021006	AAAC	2	8	1122947	1122954	75 %	0 %	0 %	25 %	480533165
23019	NC_021006	AAG	2	6	1122970	1122975	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480533165
23020	NC_021006	A	8	8	1123087	1123094	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23021	NC_021006	A	7	7	1123097	1123103	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23022	NC_021006	AGT	2	6	1123112	1123117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23023	NC_021006	AAC	2	6	1123161	1123166	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23024	NC_021006	CGG	2	6	1123207	1123212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
23025	NC_021006	TGA	2	6	1123265	1123270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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23027	NC_021006	A	6	6	1123281	1123286	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23028	NC_021006	A	7	7	1123301	1123307	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23029	NC_021006	GA	3	6	1123356	1123361	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
23030	NC_021006	ACA	2	6	1123418	1123423	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23031	NC_021006	GTA	2	6	1123430	1123435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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23033	NC_021006	GGC	2	6	1123532	1123537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
23034	NC_021006	AGG	2	6	1123567	1123572	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23035	NC_021006	GCTT	2	8	1123574	1123581	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
23036	NC_021006	CTG	2	6	1123624	1123629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23037	NC_021006	TGG	2	6	1123751	1123756	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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23039	NC_021006	GCA	2	6	1123849	1123854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23040	NC_021006	CGC	2	6	1123896	1123901	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
23041	NC_021006	GTGA	2	8	1123902	1123909	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
23042	NC_021006	TGT	2	6	1123935	1123940	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23043	NC_021006	AGA	2	6	1123944	1123949	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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23045	NC_021006	AGCG	2	8	1124073	1124080	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
23046	NC_021006	TAG	2	6	1124125	1124130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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23049	NC_021006	CT	3	6	1124233	1124238	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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23051	NC_021006	GGT	2	6	1124546	1124551	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23052	NC_021006	GTC	2	6	1124560	1124565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23053	NC_021006	TCGTG	2	10	1124569	1124578	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
23054	NC_021006	CAT	2	6	1124628	1124633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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23057	NC_021006	CGT	2	6	1124690	1124695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23058	NC_021006	ATC	2	6	1124698	1124703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23059	NC_021006	CGC	2	6	1124862	1124867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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23062	NC_021006	AGCC	2	8	1124954	1124961	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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23067	NC_021006	GTA	2	6	1125247	1125252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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23069	NC_021006	GTTAA	2	10	1125290	1125299	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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23073	NC_021006	GAT	2	6	1125386	1125391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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23090	NC_021006	TG	3	6	1126520	1126525	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
23091	NC_021006	GAG	2	6	1126541	1126546	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23092	NC_021006	GA	3	6	1126671	1126676	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
23093	NC_021006	ACA	2	6	1126697	1126702	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23094	NC_021006	CTAA	2	8	1126752	1126759	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
23095	NC_021006	GTCT	2	8	1126777	1126784	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
23096	NC_021006	TAG	2	6	1126854	1126859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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23098	NC_021006	CT	3	6	1127083	1127088	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23099	NC_021006	GAT	2	6	1127101	1127106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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23101	NC_021006	GA	3	6	1127290	1127295	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
23102	NC_021006	TAGG	2	8	1127408	1127415	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
23103	NC_021006	TAC	2	6	1127462	1127467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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23106	NC_021006	TCG	2	6	1127801	1127806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23107	NC_021006	CGT	2	6	1127881	1127886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23108	NC_021006	AGGGA	2	10	1128019	1128028	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
23109	NC_021006	TA	3	6	1128085	1128090	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23110	NC_021006	GA	3	6	1128105	1128110	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
23111	NC_021006	GAAGTG	2	12	1128130	1128141	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
23112	NC_021006	ACTAAT	2	12	1128160	1128171	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
23113	NC_021006	AGT	2	6	1128339	1128344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23114	NC_021006	GTA	2	6	1128406	1128411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23115	NC_021006	ATG	2	6	1128429	1128434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23116	NC_021006	T	6	6	1128488	1128493	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23117	NC_021006	TAA	3	9	1128500	1128508	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23118	NC_021006	CTA	2	6	1128620	1128625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23119	NC_021006	TAT	2	6	1128626	1128631	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23120	NC_021006	TG	3	6	1128673	1128678	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
23121	NC_021006	TCC	2	6	1128707	1128712	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23122	NC_021006	TCTTGT	2	12	1128816	1128827	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
23123	NC_021006	GAA	2	6	1128887	1128892	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23124	NC_021006	CTTT	2	8	1128923	1128930	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
23125	NC_021006	T	6	6	1128928	1128933	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23126	NC_021006	TGA	2	6	1128981	1128986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23127	NC_021006	ATT	2	6	1128988	1128993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23128	NC_021006	GTG	2	6	1129122	1129127	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23129	NC_021006	TTA	2	6	1129171	1129176	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23130	NC_021006	TTG	2	6	1129236	1129241	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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23133	NC_021006	AGTTGA	2	12	1129480	1129491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23134	NC_021006	TGA	2	6	1129502	1129507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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23136	NC_021006	TGA	2	6	1129577	1129582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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23140	NC_021006	ATA	2	6	1129700	1129705	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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23491	NC_021006	AATC	2	8	1145317	1145324	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
23492	NC_021006	GTG	2	6	1145338	1145343	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23493	NC_021006	GAA	2	6	1145419	1145424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23494	NC_021006	ATGA	2	8	1145437	1145444	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
23495	NC_021006	TGA	2	6	1145520	1145525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23496	NC_021006	AGA	2	6	1145562	1145567	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23497	NC_021006	TGG	2	6	1145595	1145600	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23498	NC_021006	GCT	3	9	1145632	1145640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23499	NC_021006	CT	3	6	1145639	1145644	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23500	NC_021006	CA	3	6	1145688	1145693	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding

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