MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pneumoniae SPN034156 draft genome

Total Repeats: 41289

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18501	NC_021006	TCA	2	6	909283	909288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532989
18502	NC_021006	GTA	2	6	909347	909352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532989
18503	NC_021006	CAT	2	6	909361	909366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532989
18504	NC_021006	TCT	2	6	909399	909404	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532989
18505	NC_021006	ACC	2	6	909421	909426	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480532989
18506	NC_021006	ATTC	3	12	909467	909478	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
18507	NC_021006	TAT	2	6	909491	909496	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18508	NC_021006	GAAA	2	8	909517	909524	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
18509	NC_021006	T	6	6	909541	909546	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18510	NC_021006	A	6	6	909550	909555	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18511	NC_021006	GATG	2	8	909567	909574	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
18512	NC_021006	TAC	2	6	909611	909616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18513	NC_021006	TGG	2	6	909660	909665	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480532990
18514	NC_021006	CTG	2	6	909667	909672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480532990
18515	NC_021006	CAA	2	6	909770	909775	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480532990
18516	NC_021006	GTT	2	6	909807	909812	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480532990
18517	NC_021006	CAC	2	6	909871	909876	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480532990
18518	NC_021006	CAC	2	6	909964	909969	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480532990
18519	NC_021006	GAA	2	6	910017	910022	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480532990
18520	NC_021006	AGC	2	6	910127	910132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480532990
18521	NC_021006	AAT	2	6	910154	910159	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480532990
18522	NC_021006	TCT	2	6	910260	910265	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532990
18523	NC_021006	TAT	2	6	910282	910287	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480532990
18524	NC_021006	ATCA	2	8	910325	910332	50 %	25 %	0 %	25 %	480532990
18525	NC_021006	T	6	6	910382	910387	0 %	100 %	0 %	0 %	480532990
18526	NC_021006	AGT	2	6	910390	910395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532990
18527	NC_021006	T	6	6	910442	910447	0 %	100 %	0 %	0 %	480532990
18528	NC_021006	CTT	2	6	910471	910476	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532990
18529	NC_021006	CAA	2	6	910477	910482	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480532990
18530	NC_021006	ATA	2	6	910542	910547	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480532990
18531	NC_021006	CAA	2	6	910630	910635	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480532990
18532	NC_021006	AAG	2	6	910636	910641	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480532990
18533	NC_021006	CTC	2	6	910682	910687	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18534	NC_021006	T	7	7	910690	910696	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18535	NC_021006	TTC	2	6	910739	910744	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18536	NC_021006	T	7	7	910749	910755	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18537	NC_021006	T	7	7	910760	910766	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18538	NC_021006	TTTA	2	8	910772	910779	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
18539	NC_021006	A	6	6	910799	910804	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18540	NC_021006	TC	3	6	910832	910837	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18541	NC_021006	TAGG	2	8	910865	910872	25 %	25 %	50 %	0 %	480532991
18542	NC_021006	CGT	2	6	910915	910920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480532991
18543	NC_021006	CAT	2	6	910985	910990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532991
18544	NC_021006	TTC	2	6	911031	911036	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532991
18545	NC_021006	TTTGAG	2	12	911045	911056	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	480532991
18546	NC_021006	TTTG	2	8	911203	911210	0 %	75 %	25 %	0 %	480532991
18547	NC_021006	GTG	2	6	911240	911245	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480532991
18548	NC_021006	T	6	6	911378	911383	0 %	100 %	0 %	0 %	480532991
18549	NC_021006	TCA	2	6	911388	911393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532991
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18551	NC_021006	CTC	2	6	911534	911539	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480532991
18552	NC_021006	TC	3	6	911550	911555	0 %	50 %	0 %	50 %	480532991
18553	NC_021006	ATA	2	6	911609	911614	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480532991
18554	NC_021006	CTT	2	6	911641	911646	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532991
18555	NC_021006	GCAA	2	8	911676	911683	50 %	0 %	25 %	25 %	480532991
18556	NC_021006	AAG	2	6	911738	911743	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480532991
18557	NC_021006	TGT	3	9	911776	911784	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480532991
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18559	NC_021006	CGA	2	6	911937	911942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480532991
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18561	NC_021006	GATT	2	8	912009	912016	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
18562	NC_021006	TAT	2	6	912025	912030	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18563	NC_021006	CTTT	2	8	912049	912056	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
18564	NC_021006	T	6	6	912054	912059	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18565	NC_021006	T	6	6	912082	912087	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18566	NC_021006	CTCTT	2	10	912120	912129	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
18567	NC_021006	T	6	6	912128	912133	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18568	NC_021006	TCT	2	6	912327	912332	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532992
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18576	NC_021006	GCTT	2	8	912740	912747	0 %	50 %	25 %	25 %	480532992
18577	NC_021006	GTCT	2	8	912766	912773	0 %	50 %	25 %	25 %	480532992
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18594	NC_021006	CCA	2	6	913661	913666	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480532992
18595	NC_021006	TCT	2	6	913759	913764	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532992
18596	NC_021006	A	6	6	913765	913770	100 %	0 %	0 %	0 %	480532992
18597	NC_021006	ATCAA	2	10	913775	913784	60 %	20 %	0 %	20 %	480532992
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18602	NC_021006	A	7	7	914000	914006	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18603	NC_021006	GAA	2	6	914007	914012	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18604	NC_021006	TTA	2	6	914079	914084	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480532993
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18613	NC_021006	CAAA	2	8	914635	914642	75 %	0 %	0 %	25 %	480532993
18614	NC_021006	GAC	2	6	914656	914661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480532993
18615	NC_021006	TCGA	2	8	914703	914710	25 %	25 %	25 %	25 %	480532993
18616	NC_021006	TCA	2	6	914751	914756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532993
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18875	NC_021006	TAC	2	6	928430	928435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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18883	NC_021006	GT	3	6	928785	928790	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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18888	NC_021006	ATG	2	6	929049	929054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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