MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pneumoniae SPN034156 draft genome

Total Repeats: 41289

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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17502	NC_021006	GATA	2	8	859194	859201	50 %	25 %	25 %	0 %	480532944
17503	NC_021006	GTT	2	6	859247	859252	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480532944
17504	NC_021006	AAC	2	6	859271	859276	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480532944
17505	NC_021006	CAT	2	6	859301	859306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532944
17506	NC_021006	GATAA	2	10	859325	859334	60 %	20 %	20 %	0 %	480532944
17507	NC_021006	ATAG	2	8	859390	859397	50 %	25 %	25 %	0 %	480532944
17508	NC_021006	ATA	2	6	859420	859425	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480532944
17509	NC_021006	AAT	2	6	859426	859431	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480532944
17510	NC_021006	TTC	2	6	859515	859520	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532945
17511	NC_021006	CAA	2	6	859533	859538	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480532945
17512	NC_021006	ATT	2	6	859545	859550	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480532945
17513	NC_021006	ACT	2	6	859621	859626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532945
17514	NC_021006	GACT	2	8	859665	859672	25 %	25 %	25 %	25 %	480532945
17515	NC_021006	AGGA	2	8	859698	859705	50 %	0 %	50 %	0 %	480532945
17516	NC_021006	CGT	2	6	859746	859751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480532945
17517	NC_021006	GCA	2	6	859906	859911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480532945
17518	NC_021006	GAAA	2	8	859962	859969	75 %	0 %	25 %	0 %	480532945
17519	NC_021006	TTCT	2	8	860010	860017	0 %	75 %	0 %	25 %	480532945
17520	NC_021006	GCTC	2	8	860054	860061	0 %	25 %	25 %	50 %	480532945
17521	NC_021006	GAAA	2	8	860084	860091	75 %	0 %	25 %	0 %	480532945
17522	NC_021006	GA	3	6	860138	860143	50 %	0 %	50 %	0 %	480532945
17523	NC_021006	GTC	2	6	860248	860253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480532945
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17526	NC_021006	AACC	2	8	860483	860490	50 %	0 %	0 %	50 %	480532946
17527	NC_021006	ATAG	2	8	860539	860546	50 %	25 %	25 %	0 %	480532946
17528	NC_021006	T	6	6	860551	860556	0 %	100 %	0 %	0 %	480532946
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17531	NC_021006	TCT	2	6	860749	860754	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17532	NC_021006	TAC	2	6	860767	860772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17533	NC_021006	AGG	2	6	860795	860800	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17534	NC_021006	A	6	6	860839	860844	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17535	NC_021006	CAAG	2	8	860857	860864	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
17536	NC_021006	AT	3	6	861003	861008	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17537	NC_021006	AATT	2	8	861059	861066	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17538	NC_021006	TAT	2	6	861111	861116	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17539	NC_021006	TATT	2	8	861206	861213	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
17540	NC_021006	A	6	6	861266	861271	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17541	NC_021006	GA	3	6	861272	861277	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17542	NC_021006	TA	3	6	861301	861306	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17543	NC_021006	AC	3	6	861325	861330	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
17544	NC_021006	CT	3	6	861609	861614	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17545	NC_021006	ACG	2	6	861621	861626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17546	NC_021006	GGT	2	6	861658	861663	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17547	NC_021006	TCT	2	6	861695	861700	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17548	NC_021006	AT	3	6	861883	861888	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17549	NC_021006	ACT	2	6	862175	862180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17550	NC_021006	ATTCA	2	10	862286	862295	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
17551	NC_021006	TATTAG	2	12	862347	862358	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17552	NC_021006	CACTTC	2	12	862378	862389	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
17553	NC_021006	ATC	2	6	862405	862410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17554	NC_021006	TC	3	6	862409	862414	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17555	NC_021006	AT	3	6	862428	862433	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17556	NC_021006	TCCCT	2	10	862491	862500	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
17557	NC_021006	ACG	2	6	862633	862638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17558	NC_021006	CGA	2	6	862713	862718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17559	NC_021006	ACC	2	6	862828	862833	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17560	NC_021006	AGG	2	6	862964	862969	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17561	NC_021006	GTA	2	6	863052	863057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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17563	NC_021006	TC	3	6	863224	863229	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17564	NC_021006	GCC	2	6	863321	863326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17565	NC_021006	CTC	2	6	863369	863374	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17566	NC_021006	CAT	2	6	863412	863417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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17568	NC_021006	TC	3	6	863547	863552	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17569	NC_021006	CTA	2	6	863660	863665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17570	NC_021006	AGAC	2	8	863735	863742	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
17571	NC_021006	TTAG	2	8	863760	863767	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
17572	NC_021006	TGT	2	6	863817	863822	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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17574	NC_021006	CTC	2	6	863973	863978	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17575	NC_021006	TCA	2	6	863990	863995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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17577	NC_021006	TGAA	2	8	864113	864120	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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17585	NC_021006	CTCCC	2	10	864702	864711	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
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17599	NC_021006	TAC	2	6	865267	865272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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17601	NC_021006	CCT	2	6	865382	865387	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17602	NC_021006	TCCTTA	2	12	865466	865477	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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17608	NC_021006	GT	3	6	865791	865796	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
17609	NC_021006	ATG	2	6	865816	865821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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17611	NC_021006	TTA	2	6	865851	865856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17612	NC_021006	ATG	2	6	865886	865891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17613	NC_021006	CACGA	2	10	865941	865950	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
17614	NC_021006	GAC	2	6	865954	865959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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17616	NC_021006	TTC	2	6	866042	866047	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17617	NC_021006	AG	3	6	866281	866286	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17618	NC_021006	TCC	2	6	866306	866311	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17619	NC_021006	AT	3	6	866312	866317	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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17624	NC_021006	CTT	2	6	866605	866610	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17625	NC_021006	CTG	2	6	866664	866669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17626	NC_021006	TCG	2	6	866739	866744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17627	NC_021006	CCA	2	6	866763	866768	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17628	NC_021006	CAGG	2	8	866890	866897	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
17629	NC_021006	AAGC	2	8	866938	866945	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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