MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pneumoniae SPN034156 draft genome

Total Repeats: 41289

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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15002	NC_021006	TTC	2	6	735667	735672	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532833
15003	NC_021006	A	6	6	735731	735736	100 %	0 %	0 %	0 %	480532833
15004	NC_021006	TCT	2	6	735761	735766	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532834
15005	NC_021006	T	6	6	735775	735780	0 %	100 %	0 %	0 %	480532834
15006	NC_021006	TGAT	2	8	735782	735789	25 %	50 %	25 %	0 %	480532834
15007	NC_021006	GAAC	2	8	735813	735820	50 %	0 %	25 %	25 %	480532834
15008	NC_021006	CT	4	8	735851	735858	0 %	50 %	0 %	50 %	480532834
15009	NC_021006	TAATCA	2	12	735859	735870	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	480532834
15010	NC_021006	TTAT	2	8	735959	735966	25 %	75 %	0 %	0 %	480532835
15011	NC_021006	T	6	6	735966	735971	0 %	100 %	0 %	0 %	480532835
15012	NC_021006	TTG	2	6	735999	736004	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480532835
15013	NC_021006	GAT	2	6	736008	736013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532835
15014	NC_021006	TGG	2	6	736015	736020	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480532835
15015	NC_021006	TTG	2	6	736026	736031	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480532835
15016	NC_021006	TCC	2	6	736149	736154	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480532835
15017	NC_021006	CTC	2	6	736160	736165	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480532835
15018	NC_021006	CAAT	2	8	736181	736188	50 %	25 %	0 %	25 %	480532835
15019	NC_021006	CAT	2	6	736209	736214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532835
15020	NC_021006	GCT	2	6	736318	736323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15021	NC_021006	CTG	2	6	736571	736576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480532836
15022	NC_021006	CTT	2	6	736592	736597	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532836
15023	NC_021006	CTTC	2	8	736693	736700	0 %	50 %	0 %	50 %	480532836
15024	NC_021006	AAT	2	6	736899	736904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480532836
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15030	NC_021006	TCCT	2	8	737085	737092	0 %	50 %	0 %	50 %	480532836
15031	NC_021006	TGA	2	6	737281	737286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532836
15032	NC_021006	CGA	2	6	737322	737327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480532836
15033	NC_021006	TGG	2	6	737348	737353	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480532836
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15040	NC_021006	GAA	2	6	737721	737726	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480532836
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15043	NC_021006	T	6	6	737990	737995	0 %	100 %	0 %	0 %	480532836
15044	NC_021006	GTG	2	6	738031	738036	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480532836
15045	NC_021006	ACT	2	6	738067	738072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532836
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15047	NC_021006	GA	3	6	738291	738296	50 %	0 %	50 %	0 %	480532837
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15049	NC_021006	TGA	2	6	738362	738367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532837
15050	NC_021006	CTTGG	2	10	738614	738623	0 %	40 %	40 %	20 %	480532837
15051	NC_021006	AAGT	2	8	738728	738735	50 %	25 %	25 %	0 %	480532837
15052	NC_021006	CTT	3	9	738764	738772	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532837
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15054	NC_021006	GAA	3	9	738837	738845	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480532837
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15056	NC_021006	GCA	2	6	738896	738901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480532837
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15061	NC_021006	TCA	2	6	739120	739125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532837
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15069	NC_021006	GCAA	2	8	739507	739514	50 %	0 %	25 %	25 %	480532837
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15088	NC_021006	GGT	2	6	740790	740795	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480532838
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15091	NC_021006	TCTA	2	8	740893	740900	25 %	50 %	0 %	25 %	480532838
15092	NC_021006	TA	3	6	740905	740910	50 %	50 %	0 %	0 %	480532838
15093	NC_021006	GACG	2	8	741049	741056	25 %	0 %	50 %	25 %	480532838
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15096	NC_021006	A	7	7	741226	741232	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15098	NC_021006	CAT	2	6	741352	741357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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15100	NC_021006	ATC	2	6	741380	741385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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15102	NC_021006	CTA	2	6	741495	741500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15103	NC_021006	CGT	2	6	741518	741523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15104	NC_021006	AAG	2	6	741575	741580	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15105	NC_021006	ATC	2	6	741582	741587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15106	NC_021006	ATC	2	6	741599	741604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15107	NC_021006	TCAACT	2	12	741674	741685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15108	NC_021006	GAGATG	2	12	741793	741804	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
15109	NC_021006	ATC	2	6	741838	741843	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15110	NC_021006	TCT	2	6	742009	742014	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15111	NC_021006	ACA	2	6	742067	742072	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15112	NC_021006	ACA	2	6	742172	742177	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15113	NC_021006	AAAGA	2	10	742425	742434	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
15114	NC_021006	AAT	2	6	742485	742490	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15115	NC_021006	TCA	2	6	742492	742497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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15117	NC_021006	A	6	6	742575	742580	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15118	NC_021006	ATT	2	6	742684	742689	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480532839
15119	NC_021006	CTT	2	6	742820	742825	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532839
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15123	NC_021006	T	6	6	743030	743035	0 %	100 %	0 %	0 %	480532839
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15491	NC_021006	ACT	2	6	762348	762353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15492	NC_021006	ATTCA	2	10	762459	762468	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
15493	NC_021006	TATTAG	2	12	762520	762531	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15494	NC_021006	CACTTC	2	12	762551	762562	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
15495	NC_021006	ATC	2	6	762578	762583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15496	NC_021006	TC	3	6	762582	762587	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15497	NC_021006	AT	3	6	762601	762606	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15498	NC_021006	TCCCT	2	10	762664	762673	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
15499	NC_021006	ACG	2	6	762806	762811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15500	NC_021006	CGA	2	6	762886	762891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

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