MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pneumoniae SPN034156 draft genome

Total Repeats: 41289

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14501	NC_021006	ATT	2	6	709840	709845	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480532804
14502	NC_021006	TCC	2	6	709907	709912	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480532804
14503	NC_021006	CTA	2	6	709953	709958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532804
14504	NC_021006	ACTC	2	8	710009	710016	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
14505	NC_021006	CTA	2	6	710035	710040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14506	NC_021006	AT	3	6	710056	710061	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14507	NC_021006	TCA	2	6	710082	710087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14508	NC_021006	CT	3	6	710088	710093	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14509	NC_021006	TGAG	2	8	710131	710138	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
14510	NC_021006	CTTT	2	8	710158	710165	0 %	75 %	0 %	25 %	480532805
14511	NC_021006	CATC	2	8	710262	710269	25 %	25 %	0 %	50 %	480532805
14512	NC_021006	TCG	2	6	710321	710326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480532805
14513	NC_021006	ACC	2	6	710393	710398	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480532805
14514	NC_021006	ATAG	2	8	710427	710434	50 %	25 %	25 %	0 %	480532805
14515	NC_021006	CCA	2	6	710435	710440	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480532805
14516	NC_021006	TAG	2	6	710453	710458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532805
14517	NC_021006	CGA	2	6	710464	710469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480532805
14518	NC_021006	ACT	2	6	710474	710479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532805
14519	NC_021006	GTC	2	6	710483	710488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480532805
14520	NC_021006	TC	3	6	710504	710509	0 %	50 %	0 %	50 %	480532805
14521	NC_021006	T	6	6	710511	710516	0 %	100 %	0 %	0 %	480532805
14522	NC_021006	TCC	2	6	710573	710578	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14523	NC_021006	TAC	2	6	710602	710607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14524	NC_021006	CTAGT	2	10	710638	710647	20 %	40 %	20 %	20 %	480532806
14525	NC_021006	TCTG	2	8	710696	710703	0 %	50 %	25 %	25 %	480532806
14526	NC_021006	T	6	6	710775	710780	0 %	100 %	0 %	0 %	480532806
14527	NC_021006	TGA	2	6	710831	710836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532806
14528	NC_021006	TAGC	2	8	710870	710877	25 %	25 %	25 %	25 %	480532806
14529	NC_021006	CTT	3	9	710889	710897	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532806
14530	NC_021006	GTG	2	6	710904	710909	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480532806
14531	NC_021006	TCAA	2	8	710933	710940	50 %	25 %	0 %	25 %	480532806
14532	NC_021006	CTT	2	6	710953	710958	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532806
14533	NC_021006	GAT	2	6	710982	710987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532806
14534	NC_021006	CTG	2	6	711006	711011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480532806
14535	NC_021006	GTCT	2	8	711100	711107	0 %	50 %	25 %	25 %	480532806
14536	NC_021006	GACA	2	8	711211	711218	50 %	0 %	25 %	25 %	480532806
14537	NC_021006	C	6	6	711347	711352	0 %	0 %	0 %	100 %	480532806
14538	NC_021006	GAC	2	6	711432	711437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480532806
14539	NC_021006	ACCA	2	8	711526	711533	50 %	0 %	0 %	50 %	480532806
14540	NC_021006	GGT	2	6	711552	711557	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480532806
14541	NC_021006	GGT	2	6	711570	711575	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480532806
14542	NC_021006	AG	3	6	711685	711690	50 %	0 %	50 %	0 %	480532806
14543	NC_021006	CTGA	2	8	711781	711788	25 %	25 %	25 %	25 %	480532806
14544	NC_021006	TCAA	2	8	711974	711981	50 %	25 %	0 %	25 %	480532806
14545	NC_021006	CTA	2	6	712107	712112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532806
14546	NC_021006	CCT	2	6	712127	712132	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14547	NC_021006	ACT	2	6	712199	712204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532807
14548	NC_021006	CCA	2	6	712277	712282	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480532807
14549	NC_021006	CTT	2	6	712317	712322	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532807
14550	NC_021006	TG	3	6	712333	712338	0 %	50 %	50 %	0 %	480532807
14551	NC_021006	TCA	2	6	712404	712409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532807
14552	NC_021006	GCT	2	6	712445	712450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480532807
14553	NC_021006	TTC	2	6	712594	712599	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532807
14554	NC_021006	ACG	2	6	712621	712626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480532807
14555	NC_021006	TTG	2	6	712661	712666	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480532807
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14557	NC_021006	TGTT	2	8	712822	712829	0 %	75 %	25 %	0 %	480532807
14558	NC_021006	GAA	2	6	712916	712921	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480532807
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14561	NC_021006	GTC	2	6	713125	713130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480532807
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14564	NC_021006	CTT	2	6	713253	713258	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532807
14565	NC_021006	AGT	2	6	713296	713301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532807
14566	NC_021006	TGT	2	6	713306	713311	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480532807
14567	NC_021006	TTTC	2	8	713365	713372	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
14568	NC_021006	AGA	2	6	713440	713445	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14569	NC_021006	AGG	2	6	713471	713476	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14570	NC_021006	AGA	2	6	713573	713578	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480532808
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14589	NC_021006	A	6	6	714497	714502	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14591	NC_021006	TGT	2	6	714687	714692	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480532809
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14602	NC_021006	C	6	6	715234	715239	0 %	0 %	0 %	100 %	480532809
14603	NC_021006	ATT	2	6	715242	715247	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480532809
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14605	NC_021006	CGT	2	6	715350	715355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480532809
14606	NC_021006	CTT	2	6	715370	715375	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532809
14607	NC_021006	CAA	2	6	715376	715381	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480532809
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14613	NC_021006	TA	3	6	715553	715558	50 %	50 %	0 %	0 %	480532809
14614	NC_021006	CTG	2	6	715559	715564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480532809
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14616	NC_021006	CTGT	2	8	715625	715632	0 %	50 %	25 %	25 %	480532810
14617	NC_021006	CTC	2	6	715647	715652	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480532810
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14620	NC_021006	CGAA	2	8	715761	715768	50 %	0 %	25 %	25 %	480532810
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14871	NC_021006	CAT	2	6	728134	728139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532823
14872	NC_021006	AAGA	2	8	728153	728160	75 %	0 %	25 %	0 %	480532823
14873	NC_021006	GAA	2	6	728276	728281	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480532823
14874	NC_021006	AGA	2	6	728329	728334	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480532823
14875	NC_021006	A	6	6	728340	728345	100 %	0 %	0 %	0 %	480532823
14876	NC_021006	G	6	6	728411	728416	0 %	0 %	100 %	0 %	480532823
14877	NC_021006	CAA	2	6	728488	728493	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480532823
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14882	NC_021006	ATC	2	6	728567	728572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532823
14883	NC_021006	TCC	2	6	728574	728579	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480532823
14884	NC_021006	CAGT	2	8	728596	728603	25 %	25 %	25 %	25 %	480532823
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14889	NC_021006	A	7	7	729080	729086	100 %	0 %	0 %	0 %	480532824
14890	NC_021006	TCG	2	6	729089	729094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480532824
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14900	NC_021006	TCC	2	6	729452	729457	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480532824
14901	NC_021006	TCTT	2	8	729502	729509	0 %	75 %	0 %	25 %	480532824
14902	NC_021006	AAG	2	6	729569	729574	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480532824
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14930	NC_021006	AG	4	8	731473	731480	50 %	0 %	50 %	0 %	480532827
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14932	NC_021006	CT	3	6	731567	731572	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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14990	NC_021006	CCA	2	6	734895	734900	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480532832
14991	NC_021006	TTC	2	6	735004	735009	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532833
14992	NC_021006	TGT	2	6	735040	735045	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480532833
14993	NC_021006	GATT	2	8	735084	735091	25 %	50 %	25 %	0 %	480532833
14994	NC_021006	AAT	2	6	735096	735101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480532833
14995	NC_021006	ATA	2	6	735179	735184	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480532833
14996	NC_021006	CCAA	2	8	735236	735243	50 %	0 %	0 %	50 %	480532833
14997	NC_021006	ACC	2	6	735263	735268	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480532833
14998	NC_021006	TTC	2	6	735508	735513	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532833
14999	NC_021006	GAC	2	6	735517	735522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480532833
15000	NC_021006	CGCAGT	2	12	735523	735534	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	480532833

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