MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pneumoniae SPN034156 draft genome

Total Repeats: 41289

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_021006	ATT	2	6	661380	661385	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13502	NC_021006	TTC	2	6	661455	661460	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13503	NC_021006	TAA	2	6	661501	661506	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13504	NC_021006	T	6	6	661551	661556	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13505	NC_021006	TCA	2	6	661790	661795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532758
13506	NC_021006	CT	3	6	661865	661870	0 %	50 %	0 %	50 %	480532758
13507	NC_021006	GTC	2	6	662002	662007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480532758
13508	NC_021006	ATA	2	6	662008	662013	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480532758
13509	NC_021006	TAAC	2	8	662031	662038	50 %	25 %	0 %	25 %	480532758
13510	NC_021006	GCTT	2	8	662087	662094	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
13511	NC_021006	CCT	2	6	662267	662272	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13512	NC_021006	ACA	2	6	662274	662279	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13513	NC_021006	TTA	2	6	662321	662326	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13514	NC_021006	TAT	2	6	662330	662335	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13515	NC_021006	AGT	2	6	662399	662404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13516	NC_021006	CTT	2	6	662413	662418	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13517	NC_021006	TCA	2	6	662430	662435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13518	NC_021006	TGAA	2	8	662489	662496	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13519	NC_021006	T	6	6	662522	662527	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13520	NC_021006	TTA	2	6	662693	662698	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13521	NC_021006	AGG	2	6	662701	662706	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13522	NC_021006	TAC	2	6	662712	662717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13523	NC_021006	ATT	2	6	662731	662736	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13524	NC_021006	T	6	6	662749	662754	0 %	100 %	0 %	0 %	480532759
13525	NC_021006	ATT	2	6	662761	662766	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480532759
13526	NC_021006	CTT	2	6	662775	662780	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532759
13527	NC_021006	GAA	2	6	662851	662856	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480532759
13528	NC_021006	TTTTC	2	10	662860	662869	0 %	80 %	0 %	20 %	480532759
13529	NC_021006	TTTGT	2	10	662907	662916	0 %	80 %	20 %	0 %	480532759
13530	NC_021006	CAT	2	6	662943	662948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532759
13531	NC_021006	CT	3	6	662965	662970	0 %	50 %	0 %	50 %	480532759
13532	NC_021006	ATT	2	6	663005	663010	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13533	NC_021006	CACTTC	2	12	663022	663033	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
13534	NC_021006	TC	3	6	663077	663082	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13535	NC_021006	CTC	2	6	663095	663100	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13536	NC_021006	ATTAA	2	10	663101	663110	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
13537	NC_021006	A	6	6	663116	663121	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13538	NC_021006	ATT	2	6	663141	663146	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13539	NC_021006	TAG	2	6	663200	663205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13540	NC_021006	ATC	2	6	663330	663335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532760
13541	NC_021006	CGC	2	6	663336	663341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	480532760
13542	NC_021006	TGG	2	6	663343	663348	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480532760
13543	NC_021006	TCC	2	6	663363	663368	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480532760
13544	NC_021006	CCT	2	6	663384	663389	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480532760
13545	NC_021006	A	7	7	663474	663480	100 %	0 %	0 %	0 %	480532760
13546	NC_021006	CAAG	2	8	663563	663570	50 %	0 %	25 %	25 %	480532760
13547	NC_021006	CT	3	6	663583	663588	0 %	50 %	0 %	50 %	480532760
13548	NC_021006	TCA	2	6	663604	663609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532760
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13550	NC_021006	TC	3	6	663854	663859	0 %	50 %	0 %	50 %	480532760
13551	NC_021006	CAT	2	6	663902	663907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532760
13552	NC_021006	ATG	2	6	663964	663969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532760
13553	NC_021006	TGC	2	6	664028	664033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480532760
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13555	NC_021006	TCG	2	6	664070	664075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480532760
13556	NC_021006	TGC	2	6	664151	664156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480532760
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13559	NC_021006	CA	3	6	664369	664374	50 %	0 %	0 %	50 %	480532760
13560	NC_021006	CAAG	2	8	664394	664401	50 %	0 %	25 %	25 %	480532760
13561	NC_021006	A	6	6	664414	664419	100 %	0 %	0 %	0 %	480532760
13562	NC_021006	ATC	2	6	664426	664431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532760
13563	NC_021006	AGA	2	6	664445	664450	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480532760
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13565	NC_021006	A	6	6	664528	664533	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13566	NC_021006	T	8	8	664551	664558	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13567	NC_021006	T	6	6	664629	664634	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13568	NC_021006	TAT	2	6	664636	664641	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13569	NC_021006	TCT	2	6	664656	664661	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13570	NC_021006	T	6	6	664772	664777	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13571	NC_021006	CCT	2	6	664783	664788	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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13574	NC_021006	T	7	7	664889	664895	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13576	NC_021006	T	7	7	664908	664914	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13577	NC_021006	TA	3	6	664983	664988	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13580	NC_021006	TTGA	2	8	665128	665135	25 %	50 %	25 %	0 %	480532761
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13584	NC_021006	TGC	2	6	665270	665275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480532761
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13589	NC_021006	TATGA	2	10	665640	665649	40 %	40 %	20 %	0 %	480532761
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13593	NC_021006	CTA	2	6	665844	665849	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532761
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13598	NC_021006	CCAA	2	8	666268	666275	50 %	0 %	0 %	50 %	480532761
13599	NC_021006	TTC	2	6	666292	666297	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532761
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13601	NC_021006	GTA	2	6	666418	666423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532762
13602	NC_021006	TTCT	2	8	666469	666476	0 %	75 %	0 %	25 %	480532762
13603	NC_021006	ATC	2	6	666481	666486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532762
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13605	NC_021006	ATA	2	6	666640	666645	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480532762
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13609	NC_021006	CTG	2	6	666759	666764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480532762
13610	NC_021006	TGT	2	6	666830	666835	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480532762
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13612	NC_021006	TAA	2	6	666939	666944	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480532762
13613	NC_021006	CAT	2	6	667026	667031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532762
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13615	NC_021006	GTAAA	2	10	667070	667079	60 %	20 %	20 %	0 %	480532762
13616	NC_021006	CTT	2	6	667137	667142	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532762
13617	NC_021006	ATCA	2	8	667144	667151	50 %	25 %	0 %	25 %	480532762
13618	NC_021006	CTT	2	6	667188	667193	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532762
13619	NC_021006	GTTATC	2	12	667198	667209	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	480532762
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13622	NC_021006	ATC	2	6	667252	667257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532762
13623	NC_021006	GCA	2	6	667277	667282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480532762
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13993	NC_021006	CTT	2	6	683810	683815	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532781
13994	NC_021006	ACCAGG	2	12	683867	683878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480532781
13995	NC_021006	AGACC	2	10	683884	683893	40 %	0 %	20 %	40 %	480532781
13996	NC_021006	CTT	2	6	683908	683913	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532781
13997	NC_021006	ATC	2	6	683927	683932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532781
13998	NC_021006	TCAA	2	8	684006	684013	50 %	25 %	0 %	25 %	480532781
13999	NC_021006	CAG	2	6	684294	684299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480532782
14000	NC_021006	CTG	2	6	684483	684488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480532782

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