MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pneumoniae SPN034156 draft genome

Total Repeats: 41289

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_021006	ATGGCA	2	12	609064	609075	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	480532704
12502	NC_021006	ATG	2	6	609079	609084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532704
12503	NC_021006	ATC	2	6	609142	609147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532704
12504	NC_021006	TCT	2	6	609235	609240	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532704
12505	NC_021006	TTG	2	6	609286	609291	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480532704
12506	NC_021006	ATC	2	6	609301	609306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532704
12507	NC_021006	TGA	2	6	609374	609379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532704
12508	NC_021006	ATCA	2	8	609483	609490	50 %	25 %	0 %	25 %	480532704
12509	NC_021006	ATCTGT	2	12	609507	609518	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	480532704
12510	NC_021006	GTT	2	6	609544	609549	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480532704
12511	NC_021006	TCT	2	6	609577	609582	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532704
12512	NC_021006	GAC	2	6	609623	609628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480532704
12513	NC_021006	TCT	2	6	609661	609666	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532704
12514	NC_021006	TTG	2	6	609811	609816	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480532704
12515	NC_021006	TTCC	2	8	609884	609891	0 %	50 %	0 %	50 %	480532704
12516	NC_021006	CTT	2	6	609923	609928	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532704
12517	NC_021006	CAT	2	6	609980	609985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532704
12518	NC_021006	TCC	2	6	609990	609995	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480532704
12519	NC_021006	ATCA	2	8	609999	610006	50 %	25 %	0 %	25 %	480532704
12520	NC_021006	TCT	2	6	610072	610077	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532704
12521	NC_021006	AAT	2	6	610187	610192	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480532705
12522	NC_021006	TTC	2	6	610193	610198	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532705
12523	NC_021006	T	6	6	610208	610213	0 %	100 %	0 %	0 %	480532705
12524	NC_021006	TTC	2	6	610348	610353	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532705
12525	NC_021006	ACA	2	6	610361	610366	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480532705
12526	NC_021006	ATG	2	6	610396	610401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532705
12527	NC_021006	AGGT	2	8	610450	610457	25 %	25 %	50 %	0 %	480532705
12528	NC_021006	CTT	2	6	610473	610478	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532705
12529	NC_021006	CAC	2	6	610509	610514	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480532705
12530	NC_021006	CAA	2	6	610537	610542	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480532705
12531	NC_021006	CAG	2	6	610677	610682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480532705
12532	NC_021006	CTT	2	6	610695	610700	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532705
12533	NC_021006	TCTT	2	8	610724	610731	0 %	75 %	0 %	25 %	480532705
12534	NC_021006	TTC	2	6	610772	610777	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532705
12535	NC_021006	GAT	2	6	610781	610786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532705
12536	NC_021006	GCT	2	6	610796	610801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480532705
12537	NC_021006	TCA	2	6	610872	610877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532705
12538	NC_021006	TCA	2	6	611095	611100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532706
12539	NC_021006	ATC	2	6	611133	611138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532706
12540	NC_021006	CCA	2	6	611171	611176	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480532706
12541	NC_021006	GGA	2	6	611237	611242	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480532706
12542	NC_021006	TGA	2	6	611247	611252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532706
12543	NC_021006	GCC	2	6	611287	611292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	480532706
12544	NC_021006	TAG	2	6	611373	611378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532706
12545	NC_021006	ATC	2	6	611406	611411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532706
12546	NC_021006	CTGG	2	8	611446	611453	0 %	25 %	50 %	25 %	480532706
12547	NC_021006	GATT	2	8	611456	611463	25 %	50 %	25 %	0 %	480532706
12548	NC_021006	CTT	2	6	611489	611494	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532706
12549	NC_021006	TTC	2	6	611520	611525	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532706
12550	NC_021006	ATA	2	6	611739	611744	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480532706
12551	NC_021006	TCC	2	6	611796	611801	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480532707
12552	NC_021006	CTT	2	6	611829	611834	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532707
12553	NC_021006	GAAT	2	8	611992	611999	50 %	25 %	25 %	0 %	480532707
12554	NC_021006	TTA	2	6	612067	612072	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480532707
12555	NC_021006	TGA	2	6	612095	612100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532707
12556	NC_021006	CAAGCC	2	12	612111	612122	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	480532707
12557	NC_021006	CTT	2	6	612221	612226	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532707
12558	NC_021006	GTT	2	6	612235	612240	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480532707
12559	NC_021006	T	6	6	612281	612286	0 %	100 %	0 %	0 %	480532707
12560	NC_021006	TCT	2	6	612365	612370	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532707
12561	NC_021006	TCT	2	6	612482	612487	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532707
12562	NC_021006	TCT	2	6	612499	612504	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532707
12563	NC_021006	TTGA	2	8	612537	612544	25 %	50 %	25 %	0 %	480532707
12564	NC_021006	TTC	2	6	612558	612563	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532707
12565	NC_021006	TCC	2	6	612589	612594	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480532707
12566	NC_021006	CAG	2	6	612596	612601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480532707
12567	NC_021006	AAG	2	6	612649	612654	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480532707
12568	NC_021006	TAGA	2	8	612662	612669	50 %	25 %	25 %	0 %	480532707
12569	NC_021006	ATCC	2	8	612762	612769	25 %	25 %	0 %	50 %	480532707
12570	NC_021006	GAT	2	6	612779	612784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532707
12571	NC_021006	A	6	6	612797	612802	100 %	0 %	0 %	0 %	480532707
12572	NC_021006	CCT	2	6	612860	612865	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480532707
12573	NC_021006	ATT	2	6	612921	612926	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480532707
12574	NC_021006	CTTTTT	2	12	612969	612980	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	480532708
12575	NC_021006	TTG	2	6	612996	613001	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480532708
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12577	NC_021006	CTC	2	6	613089	613094	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480532708
12578	NC_021006	TTTCAT	2	12	613127	613138	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	480532708
12579	NC_021006	TCA	2	6	613186	613191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532708
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12581	NC_021006	AAC	2	6	613278	613283	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480532708
12582	NC_021006	TTCT	2	8	613292	613299	0 %	75 %	0 %	25 %	480532708
12583	NC_021006	TCGT	2	8	613305	613312	0 %	50 %	25 %	25 %	480532708
12584	NC_021006	TCG	2	6	613336	613341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480532708
12585	NC_021006	TCT	2	6	613350	613355	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532708
12586	NC_021006	CTT	2	6	613370	613375	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532708
12587	NC_021006	ACTTG	2	10	613398	613407	20 %	40 %	20 %	20 %	480532708
12588	NC_021006	CCT	2	6	613440	613445	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12589	NC_021006	TTTTC	2	10	613451	613460	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
12590	NC_021006	T	6	6	613470	613475	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12591	NC_021006	TTC	2	6	613494	613499	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12592	NC_021006	T	6	6	613515	613520	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12593	NC_021006	TGT	2	6	613525	613530	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12594	NC_021006	ATT	2	6	613531	613536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12595	NC_021006	ACA	2	6	613589	613594	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480532709
12596	NC_021006	A	6	6	613594	613599	100 %	0 %	0 %	0 %	480532709
12597	NC_021006	CAA	2	6	613666	613671	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480532709
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12599	NC_021006	AAC	2	6	613776	613781	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480532709
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12601	NC_021006	AGA	3	9	613839	613847	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480532709
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12603	NC_021006	AGA	2	6	613893	613898	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480532709
12604	NC_021006	CTT	2	6	614042	614047	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532710
12605	NC_021006	AAC	2	6	614068	614073	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480532710
12606	NC_021006	TAAT	2	8	614085	614092	50 %	50 %	0 %	0 %	480532710
12607	NC_021006	TCA	2	6	614124	614129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532710
12608	NC_021006	AAG	2	6	614214	614219	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480532710
12609	NC_021006	TCA	2	6	614269	614274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532710
12610	NC_021006	TGA	2	6	614296	614301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532710
12611	NC_021006	GTC	2	6	614307	614312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480532710
12612	NC_021006	TGG	2	6	614404	614409	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480532710
12613	NC_021006	CAG	2	6	614418	614423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480532710
12614	NC_021006	CAA	2	6	614452	614457	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480532710
12615	NC_021006	GTC	2	6	614552	614557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480532710
12616	NC_021006	GAT	2	6	614573	614578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532710
12617	NC_021006	ATT	2	6	614648	614653	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12618	NC_021006	CTA	2	6	614797	614802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532711
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12620	NC_021006	ATT	2	6	614871	614876	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480532711
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12989	NC_021006	AAT	2	6	633369	633374	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480532725
12990	NC_021006	TAA	2	6	633450	633455	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480532725
12991	NC_021006	TTCC	2	8	633475	633482	0 %	50 %	0 %	50 %	480532726
12992	NC_021006	TGA	2	6	633508	633513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532726
12993	NC_021006	CT	3	6	633618	633623	0 %	50 %	0 %	50 %	480532726
12994	NC_021006	TTA	2	6	633682	633687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480532726
12995	NC_021006	ACC	2	6	633689	633694	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480532726
12996	NC_021006	CCA	2	6	633829	633834	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480532726
12997	NC_021006	A	6	6	633860	633865	100 %	0 %	0 %	0 %	480532726
12998	NC_021006	ACCTG	2	10	633981	633990	20 %	20 %	20 %	40 %	480532726
12999	NC_021006	TAAGA	2	10	633994	634003	60 %	20 %	20 %	0 %	480532726
13000	NC_021006	TCA	2	6	634056	634061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532726

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