MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pneumoniae SPN034156 draft genome

Total Repeats: 41289

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10501	NC_021006	TGA	2	6	512428	512433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10502	NC_021006	A	6	6	512437	512442	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10503	NC_021006	A	7	7	512458	512464	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10504	NC_021006	TAC	2	6	512482	512487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10505	NC_021006	TGA	2	6	512497	512502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10506	NC_021006	GAT	2	6	512516	512521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10507	NC_021006	GAA	2	6	512561	512566	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10508	NC_021006	A	6	6	512604	512609	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10509	NC_021006	TA	4	8	512690	512697	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10510	NC_021006	C	6	6	512712	512717	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
10511	NC_021006	AATT	2	8	512729	512736	50 %	50 %	0 %	0 %	480532622
10512	NC_021006	TTG	2	6	512803	512808	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480532622
10513	NC_021006	AAAG	2	8	512904	512911	75 %	0 %	25 %	0 %	480532622
10514	NC_021006	CAT	2	6	512916	512921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532622
10515	NC_021006	TGA	2	6	512986	512991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532622
10516	NC_021006	TTGT	2	8	513077	513084	0 %	75 %	25 %	0 %	480532622
10517	NC_021006	CTT	2	6	513267	513272	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532622
10518	NC_021006	GAA	2	6	513292	513297	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480532622
10519	NC_021006	TCA	2	6	513341	513346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532622
10520	NC_021006	TAAA	2	8	513396	513403	75 %	25 %	0 %	0 %	480532622
10521	NC_021006	CGA	2	6	513406	513411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480532622
10522	NC_021006	TAG	3	9	513505	513513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532622
10523	NC_021006	AGA	3	9	513541	513549	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480532622
10524	NC_021006	TCTT	2	8	513590	513597	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
10525	NC_021006	TCC	2	6	513609	513614	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10526	NC_021006	T	6	6	513636	513641	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10527	NC_021006	CT	3	6	513702	513707	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10528	NC_021006	T	6	6	513717	513722	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10529	NC_021006	CAA	2	6	513763	513768	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10530	NC_021006	AAG	2	6	513806	513811	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10531	NC_021006	TTA	2	6	513879	513884	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10532	NC_021006	T	6	6	513929	513934	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10533	NC_021006	ATCA	2	8	513956	513963	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10534	NC_021006	ATT	2	6	513989	513994	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10535	NC_021006	ATTT	2	8	514003	514010	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10536	NC_021006	ATC	2	6	514064	514069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10537	NC_021006	ATA	2	6	514083	514088	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10538	NC_021006	T	6	6	514109	514114	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10539	NC_021006	TCA	2	6	514138	514143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10540	NC_021006	T	6	6	514166	514171	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10541	NC_021006	TC	3	6	514186	514191	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10542	NC_021006	A	6	6	514200	514205	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10543	NC_021006	CTA	2	6	514331	514336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10544	NC_021006	ATT	2	6	514353	514358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10545	NC_021006	ATC	2	6	514388	514393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10546	NC_021006	ACA	2	6	514427	514432	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10547	NC_021006	ATCA	2	8	514509	514516	50 %	25 %	0 %	25 %	480532623
10548	NC_021006	ACG	3	9	514623	514631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480532623
10549	NC_021006	GTAG	2	8	514659	514666	25 %	25 %	50 %	0 %	480532623
10550	NC_021006	ACC	2	6	514719	514724	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480532623
10551	NC_021006	AGC	2	6	514743	514748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480532623
10552	NC_021006	ATA	2	6	514786	514791	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480532623
10553	NC_021006	ACG	2	6	514816	514821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480532623
10554	NC_021006	CTT	2	6	514856	514861	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532623
10555	NC_021006	GTG	2	6	514903	514908	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480532623
10556	NC_021006	ATG	2	6	514923	514928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532623
10557	NC_021006	ACC	2	6	514995	515000	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480532623
10558	NC_021006	CCATT	2	10	515009	515018	20 %	40 %	0 %	40 %	480532623
10559	NC_021006	AAG	2	6	515149	515154	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480532623
10560	NC_021006	CTG	3	9	515165	515173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480532623
10561	NC_021006	GA	3	6	515210	515215	50 %	0 %	50 %	0 %	480532623
10562	NC_021006	CCT	2	6	515354	515359	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480532623
10563	NC_021006	ATCCC	2	10	515427	515436	20 %	20 %	0 %	60 %	480532623
10564	NC_021006	TCT	2	6	515461	515466	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532623
10565	NC_021006	GTG	2	6	515474	515479	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480532623
10566	NC_021006	TCAA	2	8	515542	515549	50 %	25 %	0 %	25 %	480532623
10567	NC_021006	TGC	2	6	515595	515600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480532623
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10569	NC_021006	TGA	2	6	515746	515751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532623
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10574	NC_021006	AG	3	6	516044	516049	50 %	0 %	50 %	0 %	480532623
10575	NC_021006	GCT	2	6	516113	516118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480532623
10576	NC_021006	GCA	2	6	516166	516171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480532623
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10578	NC_021006	TCC	2	6	516265	516270	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10579	NC_021006	TAA	2	6	516275	516280	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10580	NC_021006	TCT	2	6	516284	516289	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10581	NC_021006	ATT	2	6	516296	516301	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480532624
10582	NC_021006	TTC	2	6	516327	516332	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532624
10583	NC_021006	CCAAA	2	10	516377	516386	60 %	0 %	0 %	40 %	480532624
10584	NC_021006	TTTG	2	8	516434	516441	0 %	75 %	25 %	0 %	480532624
10585	NC_021006	GAA	2	6	516457	516462	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480532624
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10587	NC_021006	ATG	2	6	516475	516480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532624
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10589	NC_021006	ACA	2	6	516649	516654	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480532624
10590	NC_021006	CAT	2	6	516671	516676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532624
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10592	NC_021006	GT	3	6	516809	516814	0 %	50 %	50 %	0 %	480532624
10593	NC_021006	T	6	6	516821	516826	0 %	100 %	0 %	0 %	480532624
10594	NC_021006	CTT	2	6	516830	516835	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532624
10595	NC_021006	CCAT	2	8	516877	516884	25 %	25 %	0 %	50 %	480532624
10596	NC_021006	A	6	6	516919	516924	100 %	0 %	0 %	0 %	480532624
10597	NC_021006	TCA	2	6	516959	516964	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532624
10598	NC_021006	AATTC	2	10	516976	516985	40 %	40 %	0 %	20 %	480532624
10599	NC_021006	TCT	2	6	517034	517039	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532624
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10606	NC_021006	AATCCA	2	12	517400	517411	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	480532625
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10613	NC_021006	TAA	2	6	517734	517739	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480532625
10614	NC_021006	TA	3	6	517762	517767	50 %	50 %	0 %	0 %	480532625
10615	NC_021006	ACC	2	6	517780	517785	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480532625
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10621	NC_021006	CAC	2	6	518016	518021	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480532625
10622	NC_021006	TTTAAG	2	12	518066	518077	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	480532625
10623	NC_021006	AT	3	6	518087	518092	50 %	50 %	0 %	0 %	480532625
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