MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pneumoniae SPN034156 draft genome

Total Repeats: 41289

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8501	NC_021006	CAG	2	6	408782	408787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8502	NC_021006	ACT	2	6	408805	408810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8503	NC_021006	A	6	6	408850	408855	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8504	NC_021006	TAA	2	6	408892	408897	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8505	NC_021006	CTTT	2	8	408906	408913	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
8506	NC_021006	GGT	2	6	408962	408967	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8507	NC_021006	CAA	2	6	409170	409175	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8508	NC_021006	ACG	2	6	409192	409197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8509	NC_021006	TCA	2	6	409277	409282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8510	NC_021006	AT	3	6	409283	409288	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8511	NC_021006	T	7	7	409373	409379	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8512	NC_021006	A	6	6	409455	409460	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8513	NC_021006	GAC	2	6	409520	409525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8514	NC_021006	CT	3	6	409536	409541	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8515	NC_021006	TCTT	2	8	409559	409566	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
8516	NC_021006	AG	3	6	409578	409583	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8517	NC_021006	A	6	6	409600	409605	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8518	NC_021006	TAT	2	6	409689	409694	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8519	NC_021006	CTA	2	6	409717	409722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8520	NC_021006	ACTT	2	8	409746	409753	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8521	NC_021006	T	7	7	409752	409758	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8522	NC_021006	CAT	2	6	409787	409792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8523	NC_021006	ACTAAA	2	12	409852	409863	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8524	NC_021006	A	8	8	409861	409868	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8525	NC_021006	A	6	6	410002	410007	100 %	0 %	0 %	0 %	480532523
8526	NC_021006	TTGG	2	8	410064	410071	0 %	50 %	50 %	0 %	480532523
8527	NC_021006	GTT	2	6	410100	410105	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480532523
8528	NC_021006	TTGA	2	8	410133	410140	25 %	50 %	25 %	0 %	480532523
8529	NC_021006	CAGC	2	8	410341	410348	25 %	0 %	25 %	50 %	480532523
8530	NC_021006	ACT	2	6	410430	410435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532523
8531	NC_021006	TTGA	2	8	410505	410512	25 %	50 %	25 %	0 %	480532523
8532	NC_021006	GTT	2	6	410526	410531	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480532523
8533	NC_021006	TTGA	2	8	410580	410587	25 %	50 %	25 %	0 %	480532523
8534	NC_021006	AC	3	6	410617	410622	50 %	0 %	0 %	50 %	480532523
8535	NC_021006	TCG	2	6	410651	410656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480532523
8536	NC_021006	GTT	2	6	410691	410696	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480532523
8537	NC_021006	GCAA	2	8	410702	410709	50 %	0 %	25 %	25 %	480532523
8538	NC_021006	CTG	2	6	410710	410715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480532523
8539	NC_021006	AGC	2	6	410759	410764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480532523
8540	NC_021006	GAA	2	6	410778	410783	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480532523
8541	NC_021006	GTC	2	6	410788	410793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480532523
8542	NC_021006	GTGTTG	2	12	410839	410850	0 %	50 %	50 %	0 %	480532523
8543	NC_021006	TTC	2	6	410854	410859	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532523
8544	NC_021006	CT	3	6	410968	410973	0 %	50 %	0 %	50 %	480532523
8545	NC_021006	A	6	6	411070	411075	100 %	0 %	0 %	0 %	480532523
8546	NC_021006	GAA	2	6	411087	411092	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480532523
8547	NC_021006	ATG	2	6	411111	411116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532523
8548	NC_021006	GAA	2	6	411123	411128	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480532523
8549	NC_021006	TGC	2	6	411203	411208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480532523
8550	NC_021006	CTA	2	6	411209	411214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532523
8551	NC_021006	GAA	2	6	411249	411254	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480532523
8552	NC_021006	CTA	2	6	411272	411277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532523
8553	NC_021006	A	6	6	411283	411288	100 %	0 %	0 %	0 %	480532523
8554	NC_021006	CAA	2	6	411356	411361	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480532523
8555	NC_021006	AGA	2	6	411401	411406	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480532523
8556	NC_021006	CTC	2	6	411460	411465	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480532523
8557	NC_021006	AC	3	6	411484	411489	50 %	0 %	0 %	50 %	480532523
8558	NC_021006	GAA	2	6	411576	411581	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480532523
8559	NC_021006	ACCA	2	8	411654	411661	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8560	NC_021006	T	6	6	411670	411675	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8561	NC_021006	TGCG	2	8	411795	411802	0 %	25 %	50 %	25 %	480532524
8562	NC_021006	AAG	2	6	411804	411809	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480532524
8563	NC_021006	A	6	6	411818	411823	100 %	0 %	0 %	0 %	480532524
8564	NC_021006	CTT	2	6	411835	411840	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532524
8565	NC_021006	TCA	2	6	411927	411932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532524
8566	NC_021006	GAA	2	6	411938	411943	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480532524
8567	NC_021006	A	6	6	412092	412097	100 %	0 %	0 %	0 %	480532524
8568	NC_021006	TAT	2	6	412298	412303	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8569	NC_021006	A	7	7	412320	412326	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8570	NC_021006	CTT	2	6	412379	412384	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532525
8571	NC_021006	CTT	2	6	412388	412393	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532525
8572	NC_021006	TCT	2	6	412405	412410	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532525
8573	NC_021006	TCT	2	6	412478	412483	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532525
8574	NC_021006	ATA	2	6	412587	412592	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480532525
8575	NC_021006	TCAA	2	8	412609	412616	50 %	25 %	0 %	25 %	480532525
8576	NC_021006	ATCA	2	8	412644	412651	50 %	25 %	0 %	25 %	480532525
8577	NC_021006	TTA	2	6	412687	412692	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480532525
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8580	NC_021006	TTC	2	6	412810	412815	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532525
8581	NC_021006	TTC	2	6	412834	412839	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532525
8582	NC_021006	AT	3	6	412840	412845	50 %	50 %	0 %	0 %	480532525
8583	NC_021006	CTT	2	6	412934	412939	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532525
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8587	NC_021006	GACT	2	8	413177	413184	25 %	25 %	25 %	25 %	480532525
8588	NC_021006	T	6	6	413199	413204	0 %	100 %	0 %	0 %	480532525
8589	NC_021006	TCC	2	6	413215	413220	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480532526
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8596	NC_021006	GTC	2	6	413725	413730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480532526
8597	NC_021006	CCA	2	6	413737	413742	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480532526
8598	NC_021006	TTTG	2	8	413804	413811	0 %	75 %	25 %	0 %	480532526
8599	NC_021006	CTAT	2	8	413859	413866	25 %	50 %	0 %	25 %	480532527
8600	NC_021006	T	6	6	413889	413894	0 %	100 %	0 %	0 %	480532527
8601	NC_021006	AAT	2	6	413898	413903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480532527
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8605	NC_021006	ATA	2	6	414103	414108	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480532527
8606	NC_021006	AAT	2	6	414234	414239	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480532527
8607	NC_021006	ATA	2	6	414285	414290	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480532527
8608	NC_021006	AAGGCA	2	12	414382	414393	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	480532527
8609	NC_021006	AAAT	2	8	414486	414493	75 %	25 %	0 %	0 %	480532527
8610	NC_021006	CCT	2	6	414507	414512	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8611	NC_021006	TAT	2	6	414528	414533	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8612	NC_021006	TC	3	6	414652	414657	0 %	50 %	0 %	50 %	480532528
8613	NC_021006	CAT	2	6	414678	414683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532528
8614	NC_021006	TAAG	2	8	414697	414704	50 %	25 %	25 %	0 %	480532528
8615	NC_021006	CTT	2	6	414723	414728	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532528
8616	NC_021006	AGAT	2	8	414752	414759	50 %	25 %	25 %	0 %	480532528
8617	NC_021006	ATC	2	6	414863	414868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532528
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8621	NC_021006	CAC	2	6	415017	415022	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480532528
8622	NC_021006	CAT	2	6	415026	415031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532528
8623	NC_021006	AGC	2	6	415054	415059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480532528
8624	NC_021006	CTT	2	6	415119	415124	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532528
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8626	NC_021006	TTC	2	6	415231	415236	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532528
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8998	NC_021006	TTG	2	6	434238	434243	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480532546
8999	NC_021006	CTG	2	6	434283	434288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480532546
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