MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pneumoniae SPN034156 draft genome

Total Repeats: 41289

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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7002	NC_021006	ATG	2	6	338810	338815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532465
7003	NC_021006	TCC	2	6	338840	338845	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480532465
7004	NC_021006	ATCCA	2	10	338935	338944	40 %	20 %	0 %	40 %	480532465
7005	NC_021006	AAATC	2	10	339000	339009	60 %	20 %	0 %	20 %	480532465
7006	NC_021006	TGT	2	6	339018	339023	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480532465
7007	NC_021006	CCAG	2	8	339029	339036	25 %	0 %	25 %	50 %	480532465
7008	NC_021006	CGAT	2	8	339044	339051	25 %	25 %	25 %	25 %	480532465
7009	NC_021006	ATC	2	6	339106	339111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532465
7010	NC_021006	AGAC	2	8	339219	339226	50 %	0 %	25 %	25 %	480532465
7011	NC_021006	CCA	2	6	339296	339301	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480532465
7012	NC_021006	CAG	2	6	339352	339357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480532465
7013	NC_021006	TGA	2	6	339390	339395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532465
7014	NC_021006	AAT	2	6	339414	339419	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480532465
7015	NC_021006	T	6	6	339466	339471	0 %	100 %	0 %	0 %	480532465
7016	NC_021006	ATT	2	6	339482	339487	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7017	NC_021006	GTCC	2	8	339538	339545	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
7018	NC_021006	GATGGT	2	12	339549	339560	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
7019	NC_021006	TTC	2	6	339564	339569	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532466
7020	NC_021006	ATCA	2	8	339576	339583	50 %	25 %	0 %	25 %	480532466
7021	NC_021006	TCT	2	6	339589	339594	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532466
7022	NC_021006	TCA	2	6	339598	339603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532466
7023	NC_021006	ATT	2	6	339639	339644	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480532466
7024	NC_021006	T	6	6	339652	339657	0 %	100 %	0 %	0 %	480532466
7025	NC_021006	TCT	2	6	339823	339828	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532466
7026	NC_021006	ATC	2	6	339834	339839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532466
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7028	NC_021006	T	6	6	339969	339974	0 %	100 %	0 %	0 %	480532467
7029	NC_021006	TGA	2	6	340041	340046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532467
7030	NC_021006	ATC	2	6	340155	340160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532467
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7033	NC_021006	CAA	2	6	340322	340327	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480532467
7034	NC_021006	AT	3	6	340330	340335	50 %	50 %	0 %	0 %	480532467
7035	NC_021006	TCC	2	6	340357	340362	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480532468
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7038	NC_021006	GAA	2	6	340464	340469	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480532468
7039	NC_021006	CTT	2	6	340721	340726	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532468
7040	NC_021006	TGA	2	6	340808	340813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532468
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7042	NC_021006	ACC	2	6	340878	340883	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480532468
7043	NC_021006	TC	3	6	340901	340906	0 %	50 %	0 %	50 %	480532468
7044	NC_021006	TAG	2	6	340945	340950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532468
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7048	NC_021006	TCGT	2	8	341173	341180	0 %	50 %	25 %	25 %	480532469
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7052	NC_021006	TCAA	2	8	341462	341469	50 %	25 %	0 %	25 %	480532469
7053	NC_021006	AG	3	6	341499	341504	50 %	0 %	50 %	0 %	480532469
7054	NC_021006	CCCAT	2	10	341624	341633	20 %	20 %	0 %	60 %	480532469
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7058	NC_021006	CTG	2	6	341811	341816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480532469
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7060	NC_021006	TAG	2	6	341927	341932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532469
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7062	NC_021006	CAT	2	6	342064	342069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532469
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7064	NC_021006	TTC	2	6	342087	342092	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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7069	NC_021006	TTTCA	2	10	342185	342194	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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7071	NC_021006	TTTACG	2	12	342229	342240	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	480532470
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7074	NC_021006	TAC	2	6	342355	342360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532470
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7079	NC_021006	TAAGC	2	10	342524	342533	40 %	20 %	20 %	20 %	480532471
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7082	NC_021006	AAT	2	6	342662	342667	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480532471
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7093	NC_021006	TATT	2	8	343244	343251	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7094	NC_021006	A	7	7	343298	343304	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7095	NC_021006	AGAA	2	8	343351	343358	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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7097	NC_021006	TGATTT	2	12	343381	343392	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	480532472
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7107	NC_021006	CTTCA	2	10	343913	343922	20 %	40 %	0 %	40 %	480532472
7108	NC_021006	CTG	2	6	343931	343936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480532472
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7115	NC_021006	CTT	2	6	344362	344367	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532472
7116	NC_021006	TTTA	2	8	344387	344394	25 %	75 %	0 %	0 %	480532472
7117	NC_021006	TCT	2	6	344416	344421	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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7119	NC_021006	CTAG	2	8	344475	344482	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7120	NC_021006	AGA	2	6	344487	344492	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7121	NC_021006	TATTT	2	10	344580	344589	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
7122	NC_021006	TTC	2	6	344604	344609	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7123	NC_021006	TAT	2	6	344684	344689	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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