MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pneumoniae SPN034156 draft genome

Total Repeats: 41289

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_021006	AGCAAG	2	12	311026	311037	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
6502	NC_021006	AGG	2	6	311039	311044	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6503	NC_021006	GA	4	8	311084	311091	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6504	NC_021006	TAAA	2	8	311141	311148	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6505	NC_021006	AATAA	2	10	311150	311159	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
6506	NC_021006	AAT	2	6	311250	311255	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6507	NC_021006	ATC	2	6	311306	311311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6508	NC_021006	TTTCAC	2	12	311398	311409	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6509	NC_021006	AGGC	2	8	311482	311489	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6510	NC_021006	AG	3	6	311520	311525	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6511	NC_021006	A	7	7	311530	311536	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6512	NC_021006	GGA	2	6	311550	311555	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6513	NC_021006	ATC	2	6	311604	311609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6514	NC_021006	AAGG	2	8	311617	311624	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6515	NC_021006	GGT	2	6	311680	311685	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6516	NC_021006	TC	3	6	311729	311734	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6517	NC_021006	TGC	2	6	311737	311742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6518	NC_021006	T	6	6	311750	311755	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6519	NC_021006	AGGA	2	8	311798	311805	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6520	NC_021006	CTT	2	6	311807	311812	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6521	NC_021006	AG	3	6	311833	311838	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6522	NC_021006	CAA	2	6	311953	311958	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6523	NC_021006	GAA	2	6	311977	311982	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6524	NC_021006	AGA	2	6	311983	311988	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6525	NC_021006	ATC	2	6	312021	312026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6526	NC_021006	A	6	6	312034	312039	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6527	NC_021006	ATA	2	6	312118	312123	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6528	NC_021006	GACA	2	8	312239	312246	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6529	NC_021006	AGG	2	6	312295	312300	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6530	NC_021006	AAG	2	6	312343	312348	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6531	NC_021006	AATG	2	8	312418	312425	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6532	NC_021006	A	6	6	312437	312442	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6533	NC_021006	A	6	6	312463	312468	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6534	NC_021006	T	7	7	312503	312509	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6535	NC_021006	GCTT	2	8	312522	312529	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6536	NC_021006	CTT	2	6	312553	312558	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6537	NC_021006	T	6	6	312590	312595	0 %	100 %	0 %	0 %	480532439
6538	NC_021006	CCT	2	6	312620	312625	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480532439
6539	NC_021006	AAAAC	2	10	312782	312791	80 %	0 %	0 %	20 %	480532439
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6542	NC_021006	GCT	2	6	313026	313031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480532439
6543	NC_021006	CAAT	2	8	313049	313056	50 %	25 %	0 %	25 %	480532439
6544	NC_021006	CTG	2	6	313180	313185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480532439
6545	NC_021006	TGG	2	6	313214	313219	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480532439
6546	NC_021006	TC	3	6	313259	313264	0 %	50 %	0 %	50 %	480532439
6547	NC_021006	TAT	2	6	313377	313382	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6548	NC_021006	A	7	7	313399	313405	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6549	NC_021006	ACG	2	6	313569	313574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480532440
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6551	NC_021006	AGA	2	6	313759	313764	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480532440
6552	NC_021006	ACA	2	6	314058	314063	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480532440
6553	NC_021006	GGGCT	2	10	314065	314074	0 %	20 %	60 %	20 %	480532440
6554	NC_021006	CTTT	2	8	314244	314251	0 %	75 %	0 %	25 %	480532440
6555	NC_021006	A	6	6	314355	314360	100 %	0 %	0 %	0 %	480532440
6556	NC_021006	GAA	2	6	314363	314368	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480532440
6557	NC_021006	CCA	2	6	314395	314400	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480532440
6558	NC_021006	GAA	2	6	314549	314554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480532440
6559	NC_021006	CAG	2	6	314565	314570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480532440
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6562	NC_021006	CCT	2	6	314683	314688	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480532440
6563	NC_021006	ACT	2	6	314727	314732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532440
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6567	NC_021006	ATA	2	6	314984	314989	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6568	NC_021006	T	6	6	315017	315022	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6569	NC_021006	CAA	2	6	315091	315096	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480532441
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6580	NC_021006	TGC	2	6	315520	315525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480532441
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6592	NC_021006	GC	3	6	316380	316385	0 %	0 %	50 %	50 %	480532441
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6598	NC_021006	TTC	3	9	316603	316611	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532441
6599	NC_021006	GTA	2	6	316660	316665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532441
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6611	NC_021006	GTT	2	6	317676	317681	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480532441
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6617	NC_021006	A	6	6	318088	318093	100 %	0 %	0 %	0 %	480532442
6618	NC_021006	TTTG	2	8	318168	318175	0 %	75 %	25 %	0 %	480532442
6619	NC_021006	TCA	2	6	318189	318194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532442
6620	NC_021006	ACC	2	6	318250	318255	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6621	NC_021006	TTCA	2	8	318256	318263	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6622	NC_021006	GCA	2	6	318336	318341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6623	NC_021006	TTA	2	6	318390	318395	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6624	NC_021006	T	7	7	318401	318407	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6625	NC_021006	AT	3	6	318480	318485	50 %	50 %	0 %	0 %	480532443
6626	NC_021006	T	6	6	318485	318490	0 %	100 %	0 %	0 %	480532443
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6628	NC_021006	AT	3	6	318581	318586	50 %	50 %	0 %	0 %	480532443
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6636	NC_021006	TAGAA	2	10	318870	318879	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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6742	NC_021006	CAAT	2	8	325200	325207	50 %	25 %	0 %	25 %	480532449
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6745	NC_021006	GTATT	2	10	325313	325322	20 %	60 %	20 %	0 %	480532449
6746	NC_021006	AAT	2	6	325325	325330	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480532449
6747	NC_021006	GA	3	6	325428	325433	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6748	NC_021006	AAG	2	6	325452	325457	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6749	NC_021006	A	8	8	325459	325466	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6750	NC_021006	GAA	2	6	325503	325508	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480532450
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