MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pneumoniae SPN034156 draft genome

Total Repeats: 41289

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_021006	CTC	2	6	214669	214674	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480532352
4502	NC_021006	ATC	2	6	214748	214753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532352
4503	NC_021006	TGA	2	6	214758	214763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532352
4504	NC_021006	CAA	2	6	214865	214870	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480532352
4505	NC_021006	CTT	2	6	214893	214898	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532352
4506	NC_021006	CGAT	2	8	214908	214915	25 %	25 %	25 %	25 %	480532352
4507	NC_021006	GTG	2	6	214919	214924	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480532352
4508	NC_021006	CTTT	2	8	214928	214935	0 %	75 %	0 %	25 %	480532352
4509	NC_021006	GACT	2	8	214952	214959	25 %	25 %	25 %	25 %	480532352
4510	NC_021006	CAAC	2	8	215050	215057	50 %	0 %	0 %	50 %	480532352
4511	NC_021006	TC	3	6	215066	215071	0 %	50 %	0 %	50 %	480532352
4512	NC_021006	GAA	2	6	215098	215103	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480532352
4513	NC_021006	ATG	2	6	215189	215194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532352
4514	NC_021006	AAC	2	6	215203	215208	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480532352
4515	NC_021006	AACT	2	8	215211	215218	50 %	25 %	0 %	25 %	480532352
4516	NC_021006	TTGA	2	8	215254	215261	25 %	50 %	25 %	0 %	480532352
4517	NC_021006	A	7	7	215420	215426	100 %	0 %	0 %	0 %	480532352
4518	NC_021006	GATTA	2	10	215463	215472	40 %	40 %	20 %	0 %	480532353
4519	NC_021006	ATC	2	6	215522	215527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532353
4520	NC_021006	T	6	6	215530	215535	0 %	100 %	0 %	0 %	480532353
4521	NC_021006	CAAT	2	8	215545	215552	50 %	25 %	0 %	25 %	480532353
4522	NC_021006	TTC	2	6	215570	215575	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532353
4523	NC_021006	CCT	2	6	215595	215600	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480532353
4524	NC_021006	AAG	2	6	215709	215714	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480532353
4525	NC_021006	ATA	2	6	215748	215753	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480532353
4526	NC_021006	GAC	2	6	215800	215805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480532353
4527	NC_021006	CAG	2	6	215806	215811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480532353
4528	NC_021006	ATCA	2	8	215813	215820	50 %	25 %	0 %	25 %	480532353
4529	NC_021006	GCTG	2	8	215873	215880	0 %	25 %	50 %	25 %	480532353
4530	NC_021006	TAC	2	6	215903	215908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532353
4531	NC_021006	TCG	2	6	215921	215926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480532353
4532	NC_021006	AGCT	2	8	215936	215943	25 %	25 %	25 %	25 %	480532353
4533	NC_021006	CTG	2	6	215971	215976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480532353
4534	NC_021006	CTT	2	6	215990	215995	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532353
4535	NC_021006	GTT	2	6	216036	216041	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480532353
4536	NC_021006	CAA	2	6	216061	216066	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480532353
4537	NC_021006	ATG	2	6	216150	216155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532353
4538	NC_021006	ACG	2	6	216158	216163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480532353
4539	NC_021006	TCC	2	6	216213	216218	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480532353
4540	NC_021006	CAG	2	6	216260	216265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480532353
4541	NC_021006	TTC	2	6	216266	216271	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532353
4542	NC_021006	TTC	2	6	216287	216292	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532353
4543	NC_021006	AAG	2	6	216315	216320	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480532353
4544	NC_021006	TCT	2	6	216352	216357	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532353
4545	NC_021006	TCT	2	6	216390	216395	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532353
4546	NC_021006	ATT	2	6	216428	216433	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480532353
4547	NC_021006	TTC	2	6	216434	216439	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532353
4548	NC_021006	TTC	2	6	216479	216484	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532353
4549	NC_021006	TTC	2	6	216497	216502	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532353
4550	NC_021006	TCT	2	6	216507	216512	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532353
4551	NC_021006	TTC	2	6	216548	216553	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532353
4552	NC_021006	TCC	2	6	216570	216575	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480532353
4553	NC_021006	CAA	2	6	216595	216600	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480532353
4554	NC_021006	CTT	2	6	216613	216618	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532353
4555	NC_021006	CTT	2	6	216688	216693	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532353
4556	NC_021006	CTT	2	6	216700	216705	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532353
4557	NC_021006	TTC	2	6	216716	216721	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532353
4558	NC_021006	T	7	7	216722	216728	0 %	100 %	0 %	0 %	480532353
4559	NC_021006	TTC	2	6	216779	216784	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532354
4560	NC_021006	TAC	2	6	216827	216832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532354
4561	NC_021006	CAC	2	6	216922	216927	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480532354
4562	NC_021006	TCT	2	6	217072	217077	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532354
4563	NC_021006	TGT	2	6	217123	217128	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480532354
4564	NC_021006	AACCA	2	10	217349	217358	60 %	0 %	0 %	40 %	480532354
4565	NC_021006	AAG	2	6	217416	217421	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480532354
4566	NC_021006	GAC	2	6	217438	217443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480532354
4567	NC_021006	AGT	2	6	217523	217528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532354
4568	NC_021006	GTCCAA	2	12	217541	217552	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	480532354
4569	NC_021006	CAT	2	6	217696	217701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532355
4570	NC_021006	T	6	6	217759	217764	0 %	100 %	0 %	0 %	480532355
4571	NC_021006	CAA	2	6	217773	217778	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480532355
4572	NC_021006	TCT	2	6	217895	217900	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532355
4573	NC_021006	GTTG	2	8	217906	217913	0 %	50 %	50 %	0 %	480532355
4574	NC_021006	TCA	2	6	218003	218008	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532355
4575	NC_021006	CTT	2	6	218032	218037	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532355
4576	NC_021006	TA	3	6	218065	218070	50 %	50 %	0 %	0 %	480532355
4577	NC_021006	TCA	2	6	218189	218194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532355
4578	NC_021006	AAT	2	6	218207	218212	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480532355
4579	NC_021006	CCCGA	2	10	218232	218241	20 %	0 %	20 %	60 %	480532355
4580	NC_021006	AG	3	6	218283	218288	50 %	0 %	50 %	0 %	480532355
4581	NC_021006	CTA	2	6	218352	218357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532355
4582	NC_021006	TAACT	2	10	218394	218403	40 %	40 %	0 %	20 %	480532356
4583	NC_021006	ACG	2	6	218488	218493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480532356
4584	NC_021006	AAT	2	6	218610	218615	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480532356
4585	NC_021006	GCAAG	2	10	218624	218633	40 %	0 %	40 %	20 %	480532356
4586	NC_021006	CAC	3	9	218651	218659	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480532356
4587	NC_021006	TCA	2	6	218842	218847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532356
4588	NC_021006	ATC	2	6	218895	218900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532356
4589	NC_021006	CTT	2	6	218936	218941	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532356
4590	NC_021006	CTT	2	6	219008	219013	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532356
4591	NC_021006	TCTT	2	8	219130	219137	0 %	75 %	0 %	25 %	480532356
4592	NC_021006	TTGC	2	8	219153	219160	0 %	50 %	25 %	25 %	480532356
4593	NC_021006	CTC	2	6	219168	219173	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480532356
4594	NC_021006	CTG	2	6	219177	219182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480532356
4595	NC_021006	ATC	2	6	219210	219215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532356
4596	NC_021006	ATC	2	6	219231	219236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532356
4597	NC_021006	TTG	2	6	219264	219269	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480532356
4598	NC_021006	TTC	2	6	219294	219299	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532356
4599	NC_021006	GAA	2	6	219356	219361	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480532356
4600	NC_021006	TTA	2	6	219526	219531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480532356
4601	NC_021006	GCA	2	6	219583	219588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480532356
4602	NC_021006	CTT	2	6	219653	219658	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532356
4603	NC_021006	TTC	2	6	219681	219686	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532356
4604	NC_021006	CATCT	2	10	219792	219801	20 %	40 %	0 %	40 %	480532356
4605	NC_021006	CTT	2	6	219821	219826	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532356
4606	NC_021006	GCTT	2	8	219837	219844	0 %	50 %	25 %	25 %	480532356
4607	NC_021006	CTT	3	9	219842	219850	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532356
4608	NC_021006	TGA	2	6	219887	219892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532356
4609	NC_021006	TGT	2	6	219899	219904	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480532356
4610	NC_021006	ACC	2	6	219933	219938	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480532356
4611	NC_021006	AGC	2	6	219996	220001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480532356
4612	NC_021006	CGT	2	6	220035	220040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480532356
4613	NC_021006	GAA	2	6	220181	220186	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480532356
4614	NC_021006	TCT	2	6	220249	220254	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532356
4615	NC_021006	GAT	2	6	220257	220262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532356
4616	NC_021006	ATA	2	6	220305	220310	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480532356
4617	NC_021006	ACTG	2	8	220332	220339	25 %	25 %	25 %	25 %	480532356
4618	NC_021006	AAT	2	6	220344	220349	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480532356
4619	NC_021006	TTG	2	6	220488	220493	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480532356
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4621	NC_021006	AAT	2	6	220552	220557	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480532356
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4998	NC_021006	GCT	2	6	239060	239065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480532369
4999	NC_021006	TAA	3	9	239102	239110	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480532370
5000	NC_021006	GAC	2	6	239127	239132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480532370

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