MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pneumoniae SPN994039 draft genome

Total Repeats: 41240

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
40001	NC_021005	TGC	2	6	1969564	1969569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40002	NC_021005	T	6	6	1969585	1969590	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40003	NC_021005	T	6	6	1969596	1969601	0 %	100 %	0 %	0 %	480532116
40004	NC_021005	GTT	2	6	1969616	1969621	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480532116
40005	NC_021005	GCT	2	6	1969629	1969634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480532116
40006	NC_021005	TCT	3	9	1969662	1969670	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532116
40007	NC_021005	TGGT	2	8	1969749	1969756	0 %	50 %	50 %	0 %	480532116
40008	NC_021005	ACG	2	6	1969757	1969762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480532116
40009	NC_021005	AAG	2	6	1969763	1969768	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480532116
40010	NC_021005	AGCT	2	8	1969787	1969794	25 %	25 %	25 %	25 %	480532116
40011	NC_021005	TCA	2	6	1970154	1970159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532116
40012	NC_021005	CAG	2	6	1970236	1970241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480532116
40013	NC_021005	T	6	6	1970260	1970265	0 %	100 %	0 %	0 %	480532116
40014	NC_021005	GA	3	6	1970271	1970276	50 %	0 %	50 %	0 %	480532116
40015	NC_021005	TCA	2	6	1970313	1970318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532116
40016	NC_021005	CCA	2	6	1970337	1970342	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480532116
40017	NC_021005	CAAT	2	8	1970368	1970375	50 %	25 %	0 %	25 %	480532116
40018	NC_021005	GCT	2	6	1970393	1970398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480532116
40019	NC_021005	ATC	2	6	1970405	1970410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532116
40020	NC_021005	GTT	2	6	1970438	1970443	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480532116
40021	NC_021005	TCT	2	6	1970469	1970474	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532116
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40023	NC_021005	TTA	2	6	1970682	1970687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480532116
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40028	NC_021005	GTT	2	6	1970903	1970908	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480532116
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40031	NC_021005	TGGC	2	8	1970960	1970967	0 %	25 %	50 %	25 %	480532116
40032	NC_021005	GT	3	6	1971010	1971015	0 %	50 %	50 %	0 %	480532116
40033	NC_021005	TG	3	6	1971130	1971135	0 %	50 %	50 %	0 %	480532116
40034	NC_021005	TTG	2	6	1971143	1971148	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480532116
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40039	NC_021005	T	7	7	1971376	1971382	0 %	100 %	0 %	0 %	480532116
40040	NC_021005	AC	3	6	1971423	1971428	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
40041	NC_021005	TAAA	2	8	1971433	1971440	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
40042	NC_021005	GTC	2	6	1971463	1971468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480532117
40043	NC_021005	CTT	2	6	1971502	1971507	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532117
40044	NC_021005	GTT	2	6	1971522	1971527	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480532117
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40052	NC_021005	GTT	2	6	1972111	1972116	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480532117
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40054	NC_021005	GCT	2	6	1972220	1972225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480532117
40055	NC_021005	ATGGA	2	10	1972273	1972282	40 %	20 %	40 %	0 %	480532117
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40107	NC_021005	AAT	2	6	1974610	1974615	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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40109	NC_021005	TAG	2	6	1974711	1974716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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40113	NC_021005	CT	3	6	1974928	1974933	0 %	50 %	0 %	50 %	480532119
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40239	NC_021005	TGCC	2	8	1981291	1981298	0 %	25 %	25 %	50 %	480532125
40240	NC_021005	AAG	3	9	1981313	1981321	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480532125
40241	NC_021005	TCC	2	6	1981335	1981340	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480532125
40242	NC_021005	CAC	2	6	1981490	1981495	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480532125
40243	NC_021005	ACC	2	6	1981530	1981535	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480532125
40244	NC_021005	TCA	2	6	1981539	1981544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532125
40245	NC_021005	TGA	2	6	1981552	1981557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532125
40246	NC_021005	T	6	6	1981574	1981579	0 %	100 %	0 %	0 %	480532125
40247	NC_021005	TTC	2	6	1981583	1981588	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532125
40248	NC_021005	ATC	2	6	1981655	1981660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532125
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40250	NC_021005	TGGG	2	8	1981787	1981794	0 %	25 %	75 %	0 %	480532125
40251	NC_021005	TCA	2	6	1981806	1981811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532125
40252	NC_021005	CTT	2	6	1981864	1981869	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532125
40253	NC_021005	GGA	2	6	1981887	1981892	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480532125
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40255	NC_021005	ACTC	2	8	1981930	1981937	25 %	25 %	0 %	50 %	480532125
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40259	NC_021005	GGT	2	6	1982222	1982227	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480532125
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40261	NC_021005	CCAT	2	8	1982313	1982320	25 %	25 %	0 %	50 %	480532125
40262	NC_021005	TGC	3	9	1982390	1982398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480532125
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40269	NC_021005	ATG	2	6	1982739	1982744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532125
40270	NC_021005	TCT	2	6	1982781	1982786	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532125
40271	NC_021005	TGA	2	6	1982797	1982802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532125
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40273	NC_021005	TTC	2	6	1982816	1982821	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532125
40274	NC_021005	CAC	2	6	1982827	1982832	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480532125
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40277	NC_021005	CCAA	2	8	1982970	1982977	50 %	0 %	0 %	50 %	480532125
40278	NC_021005	GTT	2	6	1982984	1982989	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480532125
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40287	NC_021005	CAT	2	6	1983325	1983330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532125
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40298	NC_021005	ATG	2	6	1983894	1983899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532126
40299	NC_021005	CCA	2	6	1983940	1983945	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480532126
40300	NC_021005	AAC	2	6	1984017	1984022	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480532126
40301	NC_021005	CT	4	8	1984142	1984149	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
40302	NC_021005	ACCTTG	2	12	1984154	1984165	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
40303	NC_021005	TAT	2	6	1984172	1984177	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40304	NC_021005	CCT	2	6	1984404	1984409	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480532127
40305	NC_021005	TGA	2	6	1984422	1984427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532127
40306	NC_021005	GTT	2	6	1984433	1984438	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480532127
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40308	NC_021005	AGGT	2	8	1984547	1984554	25 %	25 %	50 %	0 %	480532127
40309	NC_021005	TTC	2	6	1984780	1984785	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532127
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40324	NC_021005	TTGAGT	2	12	1985447	1985458	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	480532128
40325	NC_021005	ACCA	2	8	1985565	1985572	50 %	0 %	0 %	50 %	480532128
40326	NC_021005	GA	3	6	1985606	1985611	50 %	0 %	50 %	0 %	480532128
40327	NC_021005	CAA	2	6	1985633	1985638	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480532128
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40329	NC_021005	TCT	2	6	1985749	1985754	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532128
40330	NC_021005	CTT	2	6	1985786	1985791	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532128
40331	NC_021005	TG	3	6	1985826	1985831	0 %	50 %	50 %	0 %	480532128
40332	NC_021005	CTT	2	6	1985868	1985873	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532128
40333	NC_021005	TGT	2	6	1985888	1985893	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480532128
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40335	NC_021005	CTTTT	2	10	1985996	1986005	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
40336	NC_021005	ATTCTA	2	12	1986014	1986025	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	480532129
40337	NC_021005	TAA	2	6	1986040	1986045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480532129
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40339	NC_021005	TGT	2	6	1986203	1986208	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480532129
40340	NC_021005	GAT	2	6	1986371	1986376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480532129
40341	NC_021005	ACC	2	6	1986483	1986488	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480532129
40342	NC_021005	GTC	2	6	1986751	1986756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480532130
40343	NC_021005	TCA	2	6	1986778	1986783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532130
40344	NC_021005	TC	3	6	1986794	1986799	0 %	50 %	0 %	50 %	480532130
40345	NC_021005	ATTT	2	8	1986804	1986811	25 %	75 %	0 %	0 %	480532130
40346	NC_021005	CTGCC	2	10	1986840	1986849	0 %	20 %	20 %	60 %	480532130
40347	NC_021005	CTT	2	6	1986860	1986865	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532130
40348	NC_021005	TCA	2	6	1986883	1986888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532130
40349	NC_021005	CTT	2	6	1986935	1986940	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532130
40350	NC_021005	TGCT	2	8	1987022	1987029	0 %	50 %	25 %	25 %	480532130
40351	NC_021005	CCT	2	6	1987040	1987045	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40352	NC_021005	A	7	7	1987064	1987070	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40353	NC_021005	AT	3	6	1987196	1987201	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40354	NC_021005	TA	3	6	1987208	1987213	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40355	NC_021005	CGT	2	6	1987332	1987337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480532131
40356	NC_021005	AAT	2	6	1987367	1987372	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480532131
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40358	NC_021005	ATA	2	6	1987488	1987493	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480532131
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40472	NC_021005	CCA	2	6	1991712	1991717	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480532135
40473	NC_021005	AGCAA	2	10	1991742	1991751	60 %	0 %	20 %	20 %	480532135
40474	NC_021005	TCA	2	6	1991763	1991768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532135
40475	NC_021005	TCAT	2	8	1991865	1991872	25 %	50 %	0 %	25 %	480532135
40476	NC_021005	CGA	2	6	1991928	1991933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480532135
40477	NC_021005	CAT	2	6	1991939	1991944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532135
40478	NC_021005	TCC	2	6	1992021	1992026	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480532135
40479	NC_021005	ATC	2	6	1992029	1992034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532135
40480	NC_021005	GAA	2	6	1992135	1992140	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480532135
40481	NC_021005	AAATCA	2	12	1992234	1992245	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	480532135
40482	NC_021005	AGA	2	6	1992302	1992307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480532135
40483	NC_021005	TTC	2	6	1992362	1992367	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480532135
40484	NC_021005	TGG	2	6	1992372	1992377	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480532135
40485	NC_021005	TAAA	2	8	1992433	1992440	75 %	25 %	0 %	0 %	480532135
40486	NC_021005	A	7	7	1992438	1992444	100 %	0 %	0 %	0 %	480532135
40487	NC_021005	CCT	2	6	1992450	1992455	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480532135
40488	NC_021005	ATT	3	9	1992488	1992496	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480532135
40489	NC_021005	AAT	2	6	1992503	1992508	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480532135
40490	NC_021005	CAAT	2	8	1992532	1992539	50 %	25 %	0 %	25 %	480532135
40491	NC_021005	CTA	2	6	1992541	1992546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480532135
40492	NC_021005	T	6	6	1992575	1992580	0 %	100 %	0 %	0 %	480532135
40493	NC_021005	ATA	2	6	1992611	1992616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40494	NC_021005	ACCT	2	8	1992696	1992703	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
40495	NC_021005	ACG	2	6	1992761	1992766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480532136
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40497	NC_021005	GAAC	2	8	1992885	1992892	50 %	0 %	25 %	25 %	480532136
40498	NC_021005	ACA	2	6	1992906	1992911	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480532136
40499	NC_021005	CCA	2	6	1992922	1992927	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480532136
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