MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pneumoniae SPN994039 draft genome

Total Repeats: 41240

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
34501	NC_021005	CTC	3	9	1699436	1699444	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34502	NC_021005	GGAT	2	8	1699581	1699588	25 %	25 %	50 %	0 %	480531880
34503	NC_021005	TAC	2	6	1699651	1699656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480531880
34504	NC_021005	T	7	7	1699701	1699707	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34505	NC_021005	TAAT	2	8	1699743	1699750	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34506	NC_021005	G	6	6	1699760	1699765	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
34507	NC_021005	TCT	2	6	1699783	1699788	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34508	NC_021005	TTC	2	6	1699801	1699806	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34509	NC_021005	AAG	2	6	1699878	1699883	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34510	NC_021005	CCT	2	6	1699896	1699901	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34511	NC_021005	T	6	6	1699908	1699913	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34512	NC_021005	GTT	2	6	1699918	1699923	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34513	NC_021005	CAT	2	6	1699940	1699945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480531881
34514	NC_021005	CAT	2	6	1699952	1699957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480531881
34515	NC_021005	CTGGTT	2	12	1699987	1699998	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	480531881
34516	NC_021005	TGT	2	6	1700018	1700023	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480531881
34517	NC_021005	TGC	2	6	1700045	1700050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480531881
34518	NC_021005	ATCA	2	8	1700099	1700106	50 %	25 %	0 %	25 %	480531881
34519	NC_021005	TGC	2	6	1700126	1700131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480531881
34520	NC_021005	CGAT	2	8	1700166	1700173	25 %	25 %	25 %	25 %	480531881
34521	NC_021005	TTC	2	6	1700222	1700227	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480531881
34522	NC_021005	CCA	2	6	1700319	1700324	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480531881
34523	NC_021005	CAA	2	6	1700329	1700334	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480531881
34524	NC_021005	CTT	2	6	1700338	1700343	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480531881
34525	NC_021005	TTTC	2	8	1700392	1700399	0 %	75 %	0 %	25 %	480531881
34526	NC_021005	TCAGTT	2	12	1700403	1700414	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	480531881
34527	NC_021005	TAA	2	6	1700428	1700433	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480531881
34528	NC_021005	ACC	2	6	1700441	1700446	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480531881
34529	NC_021005	GCT	2	6	1700604	1700609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480531881
34530	NC_021005	TCT	2	6	1700655	1700660	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480531881
34531	NC_021005	CTA	2	6	1700743	1700748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480531881
34532	NC_021005	CAT	2	6	1700806	1700811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480531881
34533	NC_021005	AAT	2	6	1700816	1700821	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480531881
34534	NC_021005	CCA	2	6	1700929	1700934	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480531881
34535	NC_021005	T	6	6	1700935	1700940	0 %	100 %	0 %	0 %	480531881
34536	NC_021005	TGA	2	6	1701040	1701045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480531881
34537	NC_021005	CTT	2	6	1701136	1701141	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480531881
34538	NC_021005	GTT	2	6	1701161	1701166	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480531881
34539	NC_021005	CTG	2	6	1701181	1701186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480531881
34540	NC_021005	CTG	2	6	1701193	1701198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480531881
34541	NC_021005	ACG	2	6	1701209	1701214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480531881
34542	NC_021005	CTG	2	6	1701235	1701240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480531881
34543	NC_021005	TGA	2	6	1701533	1701538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480531881
34544	NC_021005	AATTT	2	10	1701540	1701549	40 %	60 %	0 %	0 %	480531881
34545	NC_021005	TACT	2	8	1701559	1701566	25 %	50 %	0 %	25 %	480531881
34546	NC_021005	GAT	2	6	1701614	1701619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480531882
34547	NC_021005	T	6	6	1701763	1701768	0 %	100 %	0 %	0 %	480531882
34548	NC_021005	TCT	2	6	1701816	1701821	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480531882
34549	NC_021005	TCC	2	6	1701866	1701871	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34550	NC_021005	GATA	2	8	1701879	1701886	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
34551	NC_021005	TTA	2	6	1701887	1701892	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34552	NC_021005	A	6	6	1701957	1701962	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34553	NC_021005	TTC	2	6	1702027	1702032	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480531883
34554	NC_021005	ATT	2	6	1702069	1702074	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480531883
34555	NC_021005	ACG	2	6	1702303	1702308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480531883
34556	NC_021005	TTG	2	6	1702346	1702351	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480531883
34557	NC_021005	TAT	2	6	1702401	1702406	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480531883
34558	NC_021005	TCC	2	6	1702418	1702423	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34559	NC_021005	A	7	7	1702447	1702453	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34560	NC_021005	T	6	6	1702484	1702489	0 %	100 %	0 %	0 %	480531884
34561	NC_021005	T	6	6	1702491	1702496	0 %	100 %	0 %	0 %	480531884
34562	NC_021005	ACG	2	6	1702557	1702562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480531884
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34564	NC_021005	GTC	2	6	1702708	1702713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480531884
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34569	NC_021005	CGT	2	6	1703146	1703151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480531884
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34571	NC_021005	AAC	2	6	1703282	1703287	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34572	NC_021005	TCT	2	6	1703340	1703345	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480531885
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34591	NC_021005	CATT	2	8	1704540	1704547	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
34592	NC_021005	A	6	6	1704555	1704560	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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34598	NC_021005	GT	3	6	1704785	1704790	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
34599	NC_021005	TGA	2	6	1704813	1704818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34600	NC_021005	ATA	2	6	1704825	1704830	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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34602	NC_021005	ATA	2	6	1704888	1704893	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480531888
34603	NC_021005	A	7	7	1704954	1704960	100 %	0 %	0 %	0 %	480531888
34604	NC_021005	T	6	6	1704978	1704983	0 %	100 %	0 %	0 %	480531888
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34608	NC_021005	AAC	2	6	1705099	1705104	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34609	NC_021005	TGAAG	2	10	1705167	1705176	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
34610	NC_021005	T	7	7	1705178	1705184	0 %	100 %	0 %	0 %	480531889
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34985	NC_021005	GCA	2	6	1723026	1723031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480531907
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34996	NC_021005	TCT	2	6	1723479	1723484	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480531907
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35000	NC_021005	CTA	2	6	1723544	1723549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

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