MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pneumoniae SPN994039 draft genome

Total Repeats: 41240

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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31502	NC_021005	CAA	3	9	1547570	1547578	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480531730
31503	NC_021005	TCA	2	6	1547611	1547616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480531730
31504	NC_021005	GAA	2	6	1547645	1547650	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480531730
31505	NC_021005	GAG	2	6	1547696	1547701	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480531730
31506	NC_021005	AGC	2	6	1547919	1547924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480531730
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31508	NC_021005	CT	3	6	1548028	1548033	0 %	50 %	0 %	50 %	480531730
31509	NC_021005	CAG	2	6	1548042	1548047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480531730
31510	NC_021005	TC	3	6	1548052	1548057	0 %	50 %	0 %	50 %	480531730
31511	NC_021005	CTT	2	6	1548144	1548149	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480531730
31512	NC_021005	CAT	2	6	1548201	1548206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480531730
31513	NC_021005	GCTT	2	8	1548211	1548218	0 %	50 %	25 %	25 %	480531730
31514	NC_021005	GAA	2	6	1548232	1548237	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480531730
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31523	NC_021005	CCT	3	9	1548673	1548681	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31524	NC_021005	A	6	6	1548704	1548709	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31525	NC_021005	C	6	6	1548721	1548726	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
31526	NC_021005	T	6	6	1548736	1548741	0 %	100 %	0 %	0 %	480531731
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31533	NC_021005	CAT	2	6	1549040	1549045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480531731
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31535	NC_021005	CA	3	6	1549151	1549156	50 %	0 %	0 %	50 %	480531732
31536	NC_021005	CAG	2	6	1549168	1549173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480531732
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31539	NC_021005	TAG	2	6	1549452	1549457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480531732
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31546	NC_021005	TCTA	2	8	1549776	1549783	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
31547	NC_021005	A	6	6	1549791	1549796	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31548	NC_021005	TTAT	2	8	1549822	1549829	25 %	75 %	0 %	0 %	480531733
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31588	NC_021005	TAT	2	6	1552146	1552151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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31601	NC_021005	A	6	6	1553311	1553316	100 %	0 %	0 %	0 %	480531736
31602	NC_021005	TCCTC	2	10	1553427	1553436	0 %	40 %	0 %	60 %	480531736
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31604	NC_021005	AAAG	2	8	1553482	1553489	75 %	0 %	25 %	0 %	480531736
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31608	NC_021005	CT	3	6	1553805	1553810	0 %	50 %	0 %	50 %	480531736
31609	NC_021005	TCAAG	2	10	1553838	1553847	40 %	20 %	20 %	20 %	480531736
31610	NC_021005	GA	3	6	1553871	1553876	50 %	0 %	50 %	0 %	480531736
31611	NC_021005	TTTC	2	8	1553920	1553927	0 %	75 %	0 %	25 %	480531736
31612	NC_021005	TC	3	6	1553926	1553931	0 %	50 %	0 %	50 %	480531736
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31619	NC_021005	AGT	2	6	1554390	1554395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480531737
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31719	NC_021005	TAATCA	2	12	1560094	1560105	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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31721	NC_021005	TCAT	2	8	1560137	1560144	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
31722	NC_021005	TC	3	6	1560224	1560229	0 %	50 %	0 %	50 %	480531746
31723	NC_021005	TCCTA	2	10	1560281	1560290	20 %	40 %	0 %	40 %	480531746
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31729	NC_021005	ATC	2	6	1560674	1560679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480531747
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31733	NC_021005	AGC	2	6	1561111	1561116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480531747
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31735	NC_021005	TTG	2	6	1561218	1561223	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480531747
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