MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pneumoniae SPN994039 draft genome

Total Repeats: 41240

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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31002	NC_021005	GGA	2	6	1521719	1521724	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480531708
31003	NC_021005	TGA	2	6	1521729	1521734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480531708
31004	NC_021005	GCC	2	6	1521769	1521774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	480531708
31005	NC_021005	TAG	2	6	1521855	1521860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480531708
31006	NC_021005	ATC	2	6	1521888	1521893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480531708
31007	NC_021005	CTGG	2	8	1521928	1521935	0 %	25 %	50 %	25 %	480531708
31008	NC_021005	GATT	2	8	1521938	1521945	25 %	50 %	25 %	0 %	480531708
31009	NC_021005	CTT	2	6	1521971	1521976	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480531708
31010	NC_021005	TTC	2	6	1522002	1522007	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480531708
31011	NC_021005	ATA	2	6	1522221	1522226	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480531708
31012	NC_021005	TCC	2	6	1522278	1522283	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480531709
31013	NC_021005	CTT	2	6	1522311	1522316	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480531709
31014	NC_021005	GAAT	2	8	1522474	1522481	50 %	25 %	25 %	0 %	480531709
31015	NC_021005	TTA	2	6	1522549	1522554	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480531709
31016	NC_021005	TGA	2	6	1522577	1522582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480531709
31017	NC_021005	CAAGCC	2	12	1522593	1522604	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	480531709
31018	NC_021005	CTT	2	6	1522703	1522708	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480531709
31019	NC_021005	GTT	2	6	1522717	1522722	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480531709
31020	NC_021005	T	6	6	1522763	1522768	0 %	100 %	0 %	0 %	480531709
31021	NC_021005	TCT	2	6	1522847	1522852	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480531709
31022	NC_021005	TCT	2	6	1522964	1522969	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480531709
31023	NC_021005	TCT	2	6	1522981	1522986	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480531709
31024	NC_021005	TTGA	2	8	1523019	1523026	25 %	50 %	25 %	0 %	480531709
31025	NC_021005	TTC	2	6	1523040	1523045	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480531709
31026	NC_021005	TCC	2	6	1523071	1523076	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480531709
31027	NC_021005	CAG	2	6	1523078	1523083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480531709
31028	NC_021005	AAG	2	6	1523131	1523136	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480531709
31029	NC_021005	TAGA	2	8	1523144	1523151	50 %	25 %	25 %	0 %	480531709
31030	NC_021005	ATCC	2	8	1523244	1523251	25 %	25 %	0 %	50 %	480531709
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31032	NC_021005	A	6	6	1523279	1523284	100 %	0 %	0 %	0 %	480531709
31033	NC_021005	CCT	2	6	1523342	1523347	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480531709
31034	NC_021005	ATT	2	6	1523403	1523408	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480531709
31035	NC_021005	CTTTTT	2	12	1523451	1523462	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	480531710
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31037	NC_021005	CT	3	6	1523491	1523496	0 %	50 %	0 %	50 %	480531710
31038	NC_021005	CTC	2	6	1523571	1523576	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480531710
31039	NC_021005	TTTCAT	2	12	1523609	1523620	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	480531710
31040	NC_021005	TCA	2	6	1523668	1523673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480531710
31041	NC_021005	T	6	6	1523754	1523759	0 %	100 %	0 %	0 %	480531710
31042	NC_021005	AAC	2	6	1523760	1523765	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480531710
31043	NC_021005	TTCT	2	8	1523774	1523781	0 %	75 %	0 %	25 %	480531710
31044	NC_021005	TCGT	2	8	1523787	1523794	0 %	50 %	25 %	25 %	480531710
31045	NC_021005	TCG	2	6	1523818	1523823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480531710
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31047	NC_021005	CTT	2	6	1523852	1523857	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480531710
31048	NC_021005	ACTTG	2	10	1523880	1523889	20 %	40 %	20 %	20 %	480531710
31049	NC_021005	CCT	2	6	1523922	1523927	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31050	NC_021005	TTTTC	2	10	1523933	1523942	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
31051	NC_021005	T	6	6	1523952	1523957	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31052	NC_021005	TTC	2	6	1523976	1523981	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31053	NC_021005	T	6	6	1523997	1524002	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31054	NC_021005	TGT	2	6	1524007	1524012	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31055	NC_021005	ATT	2	6	1524013	1524018	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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31057	NC_021005	A	6	6	1524076	1524081	100 %	0 %	0 %	0 %	480531711
31058	NC_021005	CAA	2	6	1524148	1524153	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480531711
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31067	NC_021005	TAAT	2	8	1524567	1524574	50 %	50 %	0 %	0 %	480531712
31068	NC_021005	TCA	2	6	1524606	1524611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480531712
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31070	NC_021005	CAT	2	6	1524752	1524757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480531712
31071	NC_021005	TGA	2	6	1524778	1524783	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480531712
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31073	NC_021005	TGG	2	6	1524886	1524891	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480531712
31074	NC_021005	CAG	2	6	1524900	1524905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480531712
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31077	NC_021005	GAT	2	6	1525055	1525060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480531712
31078	NC_021005	ATT	2	6	1525130	1525135	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31079	NC_021005	CTA	2	6	1525279	1525284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480531713
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31082	NC_021005	CGAC	2	8	1525382	1525389	25 %	0 %	25 %	50 %	480531713
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31086	NC_021005	TCTT	2	8	1525585	1525592	0 %	75 %	0 %	25 %	480531713
31087	NC_021005	TCCT	2	8	1525602	1525609	0 %	50 %	0 %	50 %	480531713
31088	NC_021005	TTC	2	6	1525743	1525748	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480531713
31089	NC_021005	CTA	2	6	1525868	1525873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480531713
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31091	NC_021005	T	6	6	1526018	1526023	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31092	NC_021005	GAACG	2	10	1526068	1526077	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
31093	NC_021005	ATC	2	6	1526302	1526307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480531714
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31099	NC_021005	ATC	2	6	1526543	1526548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480531714
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31101	NC_021005	ACA	2	6	1526750	1526755	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480531714
31102	NC_021005	CAT	2	6	1526794	1526799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480531714
31103	NC_021005	GAC	2	6	1526839	1526844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480531714
31104	NC_021005	AAAG	2	8	1526919	1526926	75 %	0 %	25 %	0 %	480531714
31105	NC_021005	CTG	2	6	1526940	1526945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480531714
31106	NC_021005	TCA	2	6	1526981	1526986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480531714
31107	NC_021005	TGAAT	2	10	1526997	1527006	40 %	40 %	20 %	0 %	480531714
31108	NC_021005	TCT	2	6	1527158	1527163	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480531714
31109	NC_021005	TCT	2	6	1527194	1527199	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480531714
31110	NC_021005	CTT	2	6	1527207	1527212	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480531714
31111	NC_021005	TTC	2	6	1527257	1527262	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480531714
31112	NC_021005	TGT	2	6	1527286	1527291	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480531714
31113	NC_021005	ACT	2	6	1527293	1527298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480531714
31114	NC_021005	TAT	2	6	1527306	1527311	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480531714
31115	NC_021005	AGA	2	6	1527322	1527327	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480531714
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31117	NC_021005	TTG	2	6	1527504	1527509	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480531715
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31158	NC_021005	TCC	2	6	1529612	1529617	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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31233	NC_021005	GTTT	2	8	1532915	1532922	0 %	75 %	25 %	0 %	480531718
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31237	NC_021005	ACCA	2	8	1533047	1533054	50 %	0 %	0 %	50 %	480531718
31238	NC_021005	GGA	2	6	1533061	1533066	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480531718
31239	NC_021005	AGC	2	6	1533077	1533082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480531718
31240	NC_021005	ATTG	2	8	1533138	1533145	25 %	50 %	25 %	0 %	480531718
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31250	NC_021005	GCT	2	6	1533444	1533449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480531718
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31252	NC_021005	TA	3	6	1533586	1533591	50 %	50 %	0 %	0 %	480531718
31253	NC_021005	TAT	2	6	1533636	1533641	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31254	NC_021005	A	6	6	1533679	1533684	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31255	NC_021005	TCTA	2	8	1533688	1533695	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
31256	NC_021005	GATT	2	8	1533714	1533721	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
31257	NC_021005	TCA	2	6	1533735	1533740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31258	NC_021005	TATT	2	8	1533834	1533841	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
31259	NC_021005	T	6	6	1533862	1533867	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31260	NC_021005	T	6	6	1533871	1533876	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31261	NC_021005	T	6	6	1533894	1533899	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31262	NC_021005	GGA	2	6	1533937	1533942	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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31339	NC_021005	CAT	2	6	1538322	1538327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480531722
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31343	NC_021005	TCTT	2	8	1538625	1538632	0 %	75 %	0 %	25 %	480531722
31344	NC_021005	GCC	2	6	1538662	1538667	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	480531722
31345	NC_021005	TCAT	2	8	1538845	1538852	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
31346	NC_021005	A	6	6	1538855	1538860	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31347	NC_021005	AG	3	6	1538896	1538901	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31348	NC_021005	A	6	6	1538902	1538907	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31349	NC_021005	TCA	2	6	1538940	1538945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31350	NC_021005	AG	3	6	1538968	1538973	50 %	0 %	50 %	0 %	480531723
31351	NC_021005	GGA	2	6	1539024	1539029	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480531723
31352	NC_021005	CATCT	2	10	1539055	1539064	20 %	40 %	0 %	40 %	480531723
31353	NC_021005	ACTG	2	8	1539081	1539088	25 %	25 %	25 %	25 %	480531723
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