MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pneumoniae SPN994039 draft genome

Total Repeats: 41240

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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29502	NC_021005	TC	3	6	1447297	1447302	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
29503	NC_021005	TGG	2	6	1447372	1447377	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29504	NC_021005	A	9	9	1447389	1447397	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29505	NC_021005	A	6	6	1447418	1447423	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29506	NC_021005	GATTGC	2	12	1447486	1447497	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	480531647
29507	NC_021005	GATT	2	8	1447569	1447576	25 %	50 %	25 %	0 %	480531647
29508	NC_021005	TGT	2	6	1447602	1447607	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480531647
29509	NC_021005	GGC	2	6	1447705	1447710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	480531647
29510	NC_021005	CAT	2	6	1447711	1447716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480531647
29511	NC_021005	AAG	2	6	1447757	1447762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480531647
29512	NC_021005	AAG	2	6	1447776	1447781	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480531647
29513	NC_021005	CCAA	2	8	1447788	1447795	50 %	0 %	0 %	50 %	480531647
29514	NC_021005	GGC	2	6	1447819	1447824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	480531647
29515	NC_021005	CAT	3	9	1447825	1447833	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480531647
29516	NC_021005	CAT	2	6	1447837	1447842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480531647
29517	NC_021005	AAC	2	6	1447912	1447917	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480531647
29518	NC_021005	AAC	2	6	1447969	1447974	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480531647
29519	NC_021005	ATG	2	6	1448103	1448108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480531647
29520	NC_021005	AAG	2	6	1448109	1448114	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480531647
29521	NC_021005	A	6	6	1448257	1448262	100 %	0 %	0 %	0 %	480531648
29522	NC_021005	CTA	2	6	1448305	1448310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480531648
29523	NC_021005	T	6	6	1448317	1448322	0 %	100 %	0 %	0 %	480531648
29524	NC_021005	CT	3	6	1448359	1448364	0 %	50 %	0 %	50 %	480531648
29525	NC_021005	TTC	2	6	1448374	1448379	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480531648
29526	NC_021005	GTC	2	6	1448410	1448415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480531648
29527	NC_021005	CTA	2	6	1448472	1448477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480531648
29528	NC_021005	T	6	6	1448506	1448511	0 %	100 %	0 %	0 %	480531648
29529	NC_021005	TAT	2	6	1448587	1448592	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480531648
29530	NC_021005	AGG	2	6	1448673	1448678	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29531	NC_021005	A	7	7	1448689	1448695	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29532	NC_021005	TCA	2	6	1448702	1448707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29533	NC_021005	G	6	6	1448765	1448770	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
29534	NC_021005	TTTC	2	8	1448812	1448819	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
29535	NC_021005	TGA	2	6	1448937	1448942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29536	NC_021005	TC	3	6	1448944	1448949	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
29537	NC_021005	CTC	2	6	1448993	1448998	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
29538	NC_021005	TCTT	2	8	1449133	1449140	0 %	75 %	0 %	25 %	480531649
29539	NC_021005	TTA	2	6	1449179	1449184	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480531649
29540	NC_021005	CTT	2	6	1449234	1449239	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480531649
29541	NC_021005	CAT	2	6	1449261	1449266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480531649
29542	NC_021005	AG	3	6	1449358	1449363	50 %	0 %	50 %	0 %	480531649
29543	NC_021005	GACA	2	8	1449385	1449392	50 %	0 %	25 %	25 %	480531649
29544	NC_021005	A	6	6	1449417	1449422	100 %	0 %	0 %	0 %	480531649
29545	NC_021005	TGAT	2	8	1449509	1449516	25 %	50 %	25 %	0 %	480531649
29546	NC_021005	T	6	6	1449553	1449558	0 %	100 %	0 %	0 %	480531649
29547	NC_021005	ATA	2	6	1449581	1449586	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480531649
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29549	NC_021005	TTGG	3	12	1449736	1449747	0 %	50 %	50 %	0 %	480531650
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29552	NC_021005	ACA	2	6	1450011	1450016	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480531650
29553	NC_021005	C	6	6	1450063	1450068	0 %	0 %	0 %	100 %	480531650
29554	NC_021005	CTC	2	6	1450128	1450133	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480531650
29555	NC_021005	GCCTTG	2	12	1450141	1450152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480531650
29556	NC_021005	TCAG	2	8	1450180	1450187	25 %	25 %	25 %	25 %	480531650
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29561	NC_021005	AATC	2	8	1450592	1450599	50 %	25 %	0 %	25 %	480531650
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29579	NC_021005	TTC	2	6	1451848	1451853	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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29583	NC_021005	ATA	2	6	1451953	1451958	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29584	NC_021005	TAC	2	6	1451959	1451964	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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29586	NC_021005	AGA	2	6	1452003	1452008	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29587	NC_021005	AGTC	2	8	1452215	1452222	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
29588	NC_021005	AT	3	6	1452225	1452230	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29589	NC_021005	GAA	2	6	1452269	1452274	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29590	NC_021005	TCT	2	6	1452297	1452302	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29591	NC_021005	A	7	7	1452332	1452338	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29592	NC_021005	TGC	2	6	1452377	1452382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29593	NC_021005	CAGC	2	8	1452394	1452401	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
29594	NC_021005	A	6	6	1452410	1452415	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29595	NC_021005	TAT	2	6	1452872	1452877	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480531651
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29600	NC_021005	TC	3	6	1453099	1453104	0 %	50 %	0 %	50 %	480531651
29601	NC_021005	GAT	2	6	1453121	1453126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480531651
29602	NC_021005	AC	3	6	1453156	1453161	50 %	0 %	0 %	50 %	480531651
29603	NC_021005	GAA	2	6	1453175	1453180	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480531651
29604	NC_021005	GGT	2	6	1453235	1453240	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480531651
29605	NC_021005	CGGA	2	8	1453306	1453313	25 %	0 %	50 %	25 %	480531651
29606	NC_021005	CTA	3	9	1453413	1453421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480531651
29607	NC_021005	T	7	7	1453448	1453454	0 %	100 %	0 %	0 %	480531651
29608	NC_021005	GAT	2	6	1453460	1453465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29609	NC_021005	TAT	2	6	1453505	1453510	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29610	NC_021005	T	6	6	1453552	1453557	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29611	NC_021005	TGA	2	6	1453559	1453564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29612	NC_021005	T	6	6	1453570	1453575	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29613	NC_021005	AAT	2	6	1453585	1453590	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480531652
29614	NC_021005	CTC	2	6	1453597	1453602	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480531652
29615	NC_021005	CTT	2	6	1453626	1453631	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480531652
29616	NC_021005	CAT	2	6	1453635	1453640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480531652
29617	NC_021005	TCG	2	6	1453655	1453660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480531652
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