MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pneumoniae SPN994039 draft genome

Total Repeats: 41240

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
27501	NC_021005	TAT	2	6	1346311	1346316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27502	NC_021005	CTT	2	6	1346417	1346422	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480531552
27503	NC_021005	CTTC	2	8	1346467	1346474	0 %	50 %	0 %	50 %	480531552
27504	NC_021005	CAA	2	6	1346523	1346528	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480531552
27505	NC_021005	TCA	2	6	1346542	1346547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480531552
27506	NC_021005	CCA	2	6	1346636	1346641	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480531552
27507	NC_021005	CTTG	2	8	1346666	1346673	0 %	50 %	25 %	25 %	480531552
27508	NC_021005	ATT	2	6	1346751	1346756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480531552
27509	NC_021005	T	6	6	1346818	1346823	0 %	100 %	0 %	0 %	480531552
27510	NC_021005	TCT	2	6	1346993	1346998	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480531552
27511	NC_021005	CTT	2	6	1347005	1347010	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480531552
27512	NC_021005	CCA	2	6	1347025	1347030	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480531552
27513	NC_021005	CCT	2	6	1347065	1347070	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480531552
27514	NC_021005	CCA	2	6	1347074	1347079	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480531552
27515	NC_021005	AATC	2	8	1347144	1347151	50 %	25 %	0 %	25 %	480531552
27516	NC_021005	ATT	2	6	1347156	1347161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480531552
27517	NC_021005	GGGT	2	8	1347183	1347190	0 %	25 %	75 %	0 %	480531552
27518	NC_021005	TTAA	2	8	1347202	1347209	50 %	50 %	0 %	0 %	480531552
27519	NC_021005	CGCCT	2	10	1347213	1347222	0 %	20 %	20 %	60 %	480531552
27520	NC_021005	TTAA	2	8	1347340	1347347	50 %	50 %	0 %	0 %	480531552
27521	NC_021005	GTTTCT	2	12	1347472	1347483	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	480531552
27522	NC_021005	CTG	2	6	1347660	1347665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480531553
27523	NC_021005	TAA	2	6	1347699	1347704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480531553
27524	NC_021005	AGA	2	6	1347738	1347743	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480531553
27525	NC_021005	CTG	2	6	1347837	1347842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480531553
27526	NC_021005	CTT	2	6	1347867	1347872	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480531553
27527	NC_021005	TGT	2	6	1347964	1347969	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480531553
27528	NC_021005	A	6	6	1347981	1347986	100 %	0 %	0 %	0 %	480531553
27529	NC_021005	CAT	2	6	1348035	1348040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480531553
27530	NC_021005	CCA	3	9	1348134	1348142	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480531553
27531	NC_021005	TTGG	2	8	1348208	1348215	0 %	50 %	50 %	0 %	480531553
27532	NC_021005	ACATCC	2	12	1348232	1348243	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	480531553
27533	NC_021005	CTT	2	6	1348266	1348271	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480531553
27534	NC_021005	ACC	2	6	1348336	1348341	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480531553
27535	NC_021005	CTG	2	6	1348440	1348445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480531553
27536	NC_021005	GCC	2	6	1348454	1348459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	480531553
27537	NC_021005	TAC	2	6	1348476	1348481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480531553
27538	NC_021005	TCA	2	6	1348690	1348695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27539	NC_021005	TCT	2	6	1348704	1348709	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27540	NC_021005	TA	3	6	1348737	1348742	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27541	NC_021005	AGT	2	6	1348856	1348861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27542	NC_021005	CTC	2	6	1348894	1348899	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
27543	NC_021005	AAG	2	6	1348901	1348906	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27544	NC_021005	TCT	2	6	1348962	1348967	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27545	NC_021005	TCA	2	6	1349036	1349041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27546	NC_021005	C	6	6	1349101	1349106	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
27547	NC_021005	TCA	2	6	1349168	1349173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27548	NC_021005	TCA	2	6	1349199	1349204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27549	NC_021005	TCA	3	9	1349207	1349215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27550	NC_021005	ATT	2	6	1349275	1349280	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27551	NC_021005	AT	3	6	1349329	1349334	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27552	NC_021005	CAA	2	6	1349427	1349432	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27553	NC_021005	T	6	6	1349439	1349444	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27554	NC_021005	TCA	2	6	1349492	1349497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27555	NC_021005	CTCA	2	8	1349550	1349557	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
27556	NC_021005	GCAA	2	8	1349576	1349583	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
27557	NC_021005	AT	4	8	1349706	1349713	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27558	NC_021005	ATAA	2	8	1349768	1349775	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
27559	NC_021005	AAG	2	6	1349796	1349801	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27560	NC_021005	TTAA	2	8	1349891	1349898	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27561	NC_021005	ACG	2	6	1349959	1349964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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27564	NC_021005	TGA	2	6	1350024	1350029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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27566	NC_021005	AAG	2	6	1350197	1350202	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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27569	NC_021005	AGA	2	6	1350295	1350300	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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27574	NC_021005	TAA	2	6	1350549	1350554	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27575	NC_021005	TA	3	6	1350591	1350596	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27576	NC_021005	CTT	2	6	1350627	1350632	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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27592	NC_021005	AACT	2	8	1351263	1351270	50 %	25 %	0 %	25 %	480531554
27593	NC_021005	TTCT	2	8	1351348	1351355	0 %	75 %	0 %	25 %	480531554
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27603	NC_021005	TCA	2	6	1352123	1352128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480531554
27604	NC_021005	T	6	6	1352227	1352232	0 %	100 %	0 %	0 %	480531554
27605	NC_021005	TTC	2	6	1352287	1352292	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480531554
27606	NC_021005	ATG	2	6	1352379	1352384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480531554
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27612	NC_021005	TAT	2	6	1352648	1352653	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27613	NC_021005	GTTTG	2	10	1352659	1352668	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
27614	NC_021005	A	6	6	1352688	1352693	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27615	NC_021005	A	7	7	1352697	1352703	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27616	NC_021005	A	6	6	1352749	1352754	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27617	NC_021005	TTTA	2	8	1352800	1352807	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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27978	NC_021005	GCT	2	6	1371916	1371921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480531577
27979	NC_021005	ACC	2	6	1371957	1371962	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480531577
27980	NC_021005	GAA	2	6	1371966	1371971	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480531577
27981	NC_021005	CTTGC	2	10	1371973	1371982	0 %	40 %	20 %	40 %	480531577
27982	NC_021005	CCAA	2	8	1372101	1372108	50 %	0 %	0 %	50 %	480531577
27983	NC_021005	CAG	2	6	1372139	1372144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480531577
27984	NC_021005	CTT	2	6	1372202	1372207	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480531577
27985	NC_021005	CGA	2	6	1372214	1372219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480531577
27986	NC_021005	ATC	2	6	1372236	1372241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480531577
27987	NC_021005	ATACCG	2	12	1372294	1372305	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	480531577
27988	NC_021005	AC	3	6	1372415	1372420	50 %	0 %	0 %	50 %	480531577
27989	NC_021005	TTC	2	6	1372458	1372463	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480531577
27990	NC_021005	TGG	2	6	1372564	1372569	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480531577
27991	NC_021005	ATC	2	6	1372651	1372656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480531577
27992	NC_021005	TGA	2	6	1372762	1372767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480531577
27993	NC_021005	TTGT	2	8	1372780	1372787	0 %	75 %	25 %	0 %	480531577
27994	NC_021005	ATGA	2	8	1372788	1372795	50 %	25 %	25 %	0 %	480531577
27995	NC_021005	TCA	2	6	1372810	1372815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480531577
27996	NC_021005	GAA	2	6	1372844	1372849	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480531577
27997	NC_021005	CAT	2	6	1372997	1373002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480531577
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27999	NC_021005	ATC	2	6	1373136	1373141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480531577
28000	NC_021005	AGA	2	6	1373168	1373173	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480531577

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