MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pneumoniae SPN994039 draft genome

Total Repeats: 41240

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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24003	NC_021005	TGC	2	6	1177121	1177126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480531397
24004	NC_021005	A	6	6	1177132	1177137	100 %	0 %	0 %	0 %	480531397
24005	NC_021005	ACT	2	6	1177159	1177164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480531397
24006	NC_021005	CAA	2	6	1177169	1177174	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480531397
24007	NC_021005	GAA	2	6	1177290	1177295	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480531397
24008	NC_021005	ATG	2	6	1177308	1177313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480531397
24009	NC_021005	A	7	7	1177362	1177368	100 %	0 %	0 %	0 %	480531397
24010	NC_021005	ACC	2	6	1177380	1177385	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480531397
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24012	NC_021005	AGG	2	6	1177530	1177535	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24013	NC_021005	GTT	2	6	1177538	1177543	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24014	NC_021005	CTG	2	6	1177578	1177583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24015	NC_021005	T	6	6	1177594	1177599	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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24026	NC_021005	A	7	7	1178089	1178095	100 %	0 %	0 %	0 %	480531399
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24063	NC_021005	TCAT	2	8	1179748	1179755	25 %	50 %	0 %	25 %	480531403
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24102	NC_021005	GA	3	6	1181702	1181707	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24103	NC_021005	CTC	2	6	1181720	1181725	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24104	NC_021005	T	7	7	1181729	1181735	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24105	NC_021005	GTT	2	6	1181751	1181756	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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24110	NC_021005	TTTTC	2	10	1182143	1182152	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
24111	NC_021005	CATAC	2	10	1182159	1182168	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
24112	NC_021005	CGTT	2	8	1182209	1182216	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
24113	NC_021005	T	7	7	1182215	1182221	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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24116	NC_021005	A	8	8	1182294	1182301	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24117	NC_021005	TAA	2	6	1182322	1182327	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24118	NC_021005	AT	3	6	1182370	1182375	50 %	50 %	0 %	0 %	480531405
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24121	NC_021005	GAA	2	6	1182494	1182499	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480531405
24122	NC_021005	CTGAGC	2	12	1182519	1182530	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	480531405
24123	NC_021005	TTTC	2	8	1182537	1182544	0 %	75 %	0 %	25 %	480531405
24124	NC_021005	TTCAA	2	10	1182600	1182609	40 %	40 %	0 %	20 %	480531405
24125	NC_021005	CTG	2	6	1182849	1182854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480531405
24126	NC_021005	TGG	2	6	1182868	1182873	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480531405
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24128	NC_021005	GGTTT	2	10	1182995	1183004	0 %	60 %	40 %	0 %	480531405
24129	NC_021005	GAA	2	6	1183013	1183018	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480531405
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24131	NC_021005	CGT	2	6	1183211	1183216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480531405
24132	NC_021005	AGC	2	6	1183342	1183347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480531405
24133	NC_021005	TGG	2	6	1183474	1183479	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480531405
24134	NC_021005	GAA	2	6	1183538	1183543	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480531405
24135	NC_021005	TGA	2	6	1183546	1183551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480531405
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24139	NC_021005	ATTG	2	8	1183796	1183803	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
24140	NC_021005	AATT	2	8	1183838	1183845	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24141	NC_021005	TACT	2	8	1183890	1183897	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
24142	NC_021005	GGCAA	2	10	1183968	1183977	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
24143	NC_021005	A	6	6	1184024	1184029	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24144	NC_021005	CTA	2	6	1184069	1184074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24145	NC_021005	TAT	2	6	1184087	1184092	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24146	NC_021005	A	6	6	1184183	1184188	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24147	NC_021005	CAA	2	6	1184246	1184251	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24148	NC_021005	A	7	7	1184286	1184292	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24149	NC_021005	ATC	2	6	1184310	1184315	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24150	NC_021005	TGT	2	6	1184330	1184335	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24151	NC_021005	TCTT	2	8	1184355	1184362	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
24152	NC_021005	TA	3	6	1184392	1184397	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24153	NC_021005	GTA	2	6	1184402	1184407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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24160	NC_021005	TA	3	6	1184546	1184551	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24161	NC_021005	ATT	2	6	1184621	1184626	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24162	NC_021005	ACC	2	6	1184663	1184668	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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24168	NC_021005	TA	3	6	1184929	1184934	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24169	NC_021005	ATA	2	6	1184953	1184958	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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24238	NC_021005	TAT	2	6	1188245	1188250	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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24241	NC_021005	AAAT	2	8	1188327	1188334	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
24242	NC_021005	TAT	2	6	1188340	1188345	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24243	NC_021005	TAAC	2	8	1188346	1188353	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
24244	NC_021005	TTC	2	6	1188355	1188360	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24245	NC_021005	TTTA	2	8	1188393	1188400	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
24246	NC_021005	GAAG	2	8	1188420	1188427	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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24248	NC_021005	A	7	7	1188445	1188451	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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24350	NC_021005	TC	3	6	1192726	1192731	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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